RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471978.5

C9orf3-213, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 478 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-213ENST00000471978 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.11■■■■□ 3.85
C9orf3-213ENST00000471978 CUL7Q14999 1698 aa39.07■■■■□ 3.85
C9orf3-213ENST00000471978 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.96■■■■□ 3.83
C9orf3-213ENST00000471978 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.94■■■■□ 3.82
C9orf3-213ENST00000471978 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.7■■■■□ 3.79
C9orf3-213ENST00000471978 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.65■■■■□ 3.78
C9orf3-213ENST00000471978 IQGAP2Q13576 1575 aa38.61■■■■□ 3.77
C9orf3-213ENST00000471978 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.6■■■■□ 3.77
C9orf3-213ENST00000471978 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.59■■■■□ 3.77
C9orf3-213ENST00000471978 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.59■■■■□ 3.77
C9orf3-213ENST00000471978 PTPRGP23470 1445 aa38.58■■■■□ 3.77
C9orf3-213ENST00000471978 MAPKBP1O60336 1514 aa38.56■■■■□ 3.76
C9orf3-213ENST00000471978 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
C9orf3-213ENST00000471978 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.53■■■■□ 3.76
C9orf3-213ENST00000471978 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.51■■■■□ 3.76
C9orf3-213ENST00000471978 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.5■■■■□ 3.75
C9orf3-213ENST00000471978 DISP1Q96F81 1524 aa38.42■■■■□ 3.74
C9orf3-213ENST00000471978 DIP2BQ9P265 1576 aa38.4■■■■□ 3.74
C9orf3-213ENST00000471978 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.38■■■■□ 3.73
C9orf3-213ENST00000471978 ABCC2Q92887 1545 aa38.33■■■■□ 3.73
C9orf3-213ENST00000471978 UACAQ9BZF9 1416 aa38.29■■■■□ 3.72
C9orf3-213ENST00000471978 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.28■■■■□ 3.72
C9orf3-213ENST00000471978 KIAA0556O60303 1618 aa38.26■■■■□ 3.71
C9orf3-213ENST00000471978 PRXQ9BXM0 1461 aa38.25■■■■□ 3.71
C9orf3-213ENST00000471978 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.23■■■■□ 3.71
C9orf3-213ENST00000471978 ASXL2Q76L83 1435 aa38.18■■■■□ 3.7
C9orf3-213ENST00000471978 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
C9orf3-213ENST00000471978 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.15■■■■□ 3.7
C9orf3-213ENST00000471978 TSPOAP1O95153 1857 aa38.12■■■■□ 3.69
C9orf3-213ENST00000471978 GOLGA3Q08378 1498 aa38.1■■■■□ 3.69
C9orf3-213ENST00000471978 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.1■■■■□ 3.69
C9orf3-213ENST00000471978 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.04■■■■□ 3.68
C9orf3-213ENST00000471978 GLI2P10070 1586 aa38.02■■■■□ 3.68
C9orf3-213ENST00000471978 KDM6BO15054 1643 aa38.02■■■■□ 3.68
C9orf3-213ENST00000471978 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
C9orf3-213ENST00000471978 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
C9orf3-213ENST00000471978 EEA1Q15075 1411 aa37.9■■■■□ 3.66
C9orf3-213ENST00000471978 ABCA8O94911 1581 aa37.89■■■■□ 3.66
C9orf3-213ENST00000471978 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
C9orf3-213ENST00000471978 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.84■■■■□ 3.65
C9orf3-213ENST00000471978 P3H3Q8IVL6 736 aa37.83■■■■□ 3.65
C9orf3-213ENST00000471978 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.82■■■■□ 3.64
C9orf3-213ENST00000471978 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
C9orf3-213ENST00000471978 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.73■■■■□ 3.63
C9orf3-213ENST00000471978 SAMD9Q5K651 1589 aa37.72■■■■□ 3.63
C9orf3-213ENST00000471978 KCNH8Q96L42 1107 aa37.7■■■■□ 3.63
C9orf3-213ENST00000471978 ARID3CA6NKF2 412 aa37.65■■■■□ 3.62
C9orf3-213ENST00000471978 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
C9orf3-213ENST00000471978 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
C9orf3-213ENST00000471978 ATP10BO94823 1461 aa37.6■■■■□ 3.61
C9orf3-213ENST00000471978 CD109Q6YHK3 1445 aa37.6■■■■□ 3.61
C9orf3-213ENST00000471978 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.57■■■■□ 3.61
C9orf3-213ENST00000471978 KIF21BO75037 1637 aa37.57■■■■□ 3.6
C9orf3-213ENST00000471978 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.56■■■■□ 3.6
C9orf3-213ENST00000471978 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.54■■■■□ 3.6
C9orf3-213ENST00000471978 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.54■■■■□ 3.6
C9orf3-213ENST00000471978 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.53■■■■□ 3.6
C9orf3-213ENST00000471978 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.5■■■■□ 3.59
C9orf3-213ENST00000471978 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
C9orf3-213ENST00000471978 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
C9orf3-213ENST00000471978 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
C9orf3-213ENST00000471978 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.4■■■■□ 3.58
C9orf3-213ENST00000471978 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.38■■■■□ 3.57
C9orf3-213ENST00000471978 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
C9orf3-213ENST00000471978 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.34■■■■□ 3.57
C9orf3-213ENST00000471978 ADGRL1O94910 1474 aa37.31■■■■□ 3.56
C9orf3-213ENST00000471978 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.25■■■■□ 3.55
C9orf3-213ENST00000471978 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.22■■■■□ 3.55
C9orf3-213ENST00000471978 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.2■■■■□ 3.55
C9orf3-213ENST00000471978 NEO1Q92859 1461 aa37.14■■■■□ 3.54
C9orf3-213ENST00000471978 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.1■■■■□ 3.53
C9orf3-213ENST00000471978 FMN1Q68DA7 1419 aa37.09■■■■□ 3.53
C9orf3-213ENST00000471978 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
C9orf3-213ENST00000471978 RAPGEF3O95398 923 aa37.07■■■■□ 3.52
C9orf3-213ENST00000471978 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
C9orf3-213ENST00000471978 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.02■■■■□ 3.52
C9orf3-213ENST00000471978 HECW1Q76N89 1606 aa36.99■■■■□ 3.51
C9orf3-213ENST00000471978 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.96■■■■□ 3.51
C9orf3-213ENST00000471978 FANCAO15360 1455 aa36.94■■■■□ 3.5
C9orf3-213ENST00000471978 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.93■■■■□ 3.5
C9orf3-213ENST00000471978 AKNAQ7Z591 1439 aa36.93■■■■□ 3.5
C9orf3-213ENST00000471978 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.91■■■■□ 3.5
C9orf3-213ENST00000471978 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.5
C9orf3-213ENST00000471978 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
C9orf3-213ENST00000471978 PLCH2O75038 1416 aa36.81■■■■□ 3.48
C9orf3-213ENST00000471978 RICTORQ6R327 1708 aa36.81■■■■□ 3.48
C9orf3-213ENST00000471978 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.74■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.73■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 KIF14Q15058 1648 aa36.72■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.71■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.7■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 CLIP1P30622 1438 aa36.7■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.7■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.7■■■■□ 3.47
C9orf3-213ENST00000471978 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.69■■■■□ 3.46
C9orf3-213ENST00000471978 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.69■■■■□ 3.46
C9orf3-213ENST00000471978 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.69■■■■□ 3.46
C9orf3-213ENST00000471978 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms