RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471724.5

SSR4-207, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-207ENST00000471724 NUP160Q12769 1436 aa23.28■■□□□ 1.32
SSR4-207ENST00000471724 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.27■■□□□ 1.32
SSR4-207ENST00000471724 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.25■■□□□ 1.31
SSR4-207ENST00000471724 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SSR4-207ENST00000471724 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.14■■□□□ 1.3
SSR4-207ENST00000471724 GOLGA3Q08378 1498 aa23.14■■□□□ 1.29
SSR4-207ENST00000471724 SHROOM2Q13796 1616 aa23.14■■□□□ 1.29
SSR4-207ENST00000471724 IQGAP2Q13576 1575 aa23.14■■□□□ 1.29
SSR4-207ENST00000471724 ARAP1Q96P48 1450 aa23.07■■□□□ 1.28
SSR4-207ENST00000471724 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.06■■□□□ 1.28
SSR4-207ENST00000471724 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.99■■□□□ 1.27
SSR4-207ENST00000471724 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SSR4-207ENST00000471724 JPH4Q96JJ6 628 aa22.92■■□□□ 1.26
SSR4-207ENST00000471724 KIAA0556O60303 1618 aa22.91■■□□□ 1.26
SSR4-207ENST00000471724 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SSR4-207ENST00000471724 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.9■■□□□ 1.26
SSR4-207ENST00000471724 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.9■■□□□ 1.26
SSR4-207ENST00000471724 SAMD9Q5K651 1589 aa22.89■■□□□ 1.25
SSR4-207ENST00000471724 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.87■■□□□ 1.25
SSR4-207ENST00000471724 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.86■■□□□ 1.25
SSR4-207ENST00000471724 DISP1Q96F81 1524 aa22.86■■□□□ 1.25
SSR4-207ENST00000471724 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.84■■□□□ 1.25
SSR4-207ENST00000471724 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.7■■□□□ 1.22
SSR4-207ENST00000471724 PTPRGP23470 1445 aa22.68■■□□□ 1.22
SSR4-207ENST00000471724 CLIP1P30622 1438 aa22.68■■□□□ 1.22
SSR4-207ENST00000471724 CEP162Q5TB80 1403 aa22.67■■□□□ 1.22
SSR4-207ENST00000471724 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.66■■□□□ 1.22
SSR4-207ENST00000471724 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SSR4-207ENST00000471724 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SSR4-207ENST00000471724 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.65■■□□□ 1.22
SSR4-207ENST00000471724 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.61■■□□□ 1.21
SSR4-207ENST00000471724 ABCA8O94911 1581 aa22.6■■□□□ 1.21
SSR4-207ENST00000471724 ABCC2Q92887 1545 aa22.6■■□□□ 1.21
SSR4-207ENST00000471724 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.6■■□□□ 1.21
SSR4-207ENST00000471724 FMN1Q68DA7 1419 aa22.59■■□□□ 1.21
SSR4-207ENST00000471724 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.59■■□□□ 1.21
SSR4-207ENST00000471724 P3H3Q8IVL6 736 aa22.58■■□□□ 1.21
SSR4-207ENST00000471724 UACAQ9BZF9 1416 aa22.57■■□□□ 1.2
SSR4-207ENST00000471724 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
SSR4-207ENST00000471724 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SSR4-207ENST00000471724 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.54■■□□□ 1.2
SSR4-207ENST00000471724 HECW1Q76N89 1606 aa22.53■■□□□ 1.2
SSR4-207ENST00000471724 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SSR4-207ENST00000471724 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SSR4-207ENST00000471724 MAPKBP1O60336 1514 aa22.47■■□□□ 1.19
SSR4-207ENST00000471724 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.46■■□□□ 1.19
SSR4-207ENST00000471724 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.46■■□□□ 1.19
SSR4-207ENST00000471724 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SSR4-207ENST00000471724 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.42■■□□□ 1.18
SSR4-207ENST00000471724 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.4■■□□□ 1.18
SSR4-207ENST00000471724 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.4■■□□□ 1.18
SSR4-207ENST00000471724 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.37■■□□□ 1.17
SSR4-207ENST00000471724 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.36■■□□□ 1.17
SSR4-207ENST00000471724 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.35■■□□□ 1.17
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SSR4-207ENST00000471724 ATP10BO94823 1461 aa22.34■■□□□ 1.17
SSR4-207ENST00000471724 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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SSR4-207ENST00000471724 DIP2BQ9P265 1576 aa22.31■■□□□ 1.16
SSR4-207ENST00000471724 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-207ENST00000471724 ASXL2Q76L83 1435 aa22.29■■□□□ 1.16
SSR4-207ENST00000471724 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.28■■□□□ 1.16
SSR4-207ENST00000471724 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SSR4-207ENST00000471724 ARID3CA6NKF2 412 aa22.23■■□□□ 1.15
SSR4-207ENST00000471724 TIAM1Q13009 1591 aa22.22■■□□□ 1.15
SSR4-207ENST00000471724 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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SSR4-207ENST00000471724 MAP3K1Q13233 1512 aa22.2■■□□□ 1.14
SSR4-207ENST00000471724 GLI2P10070 1586 aa22.19■■□□□ 1.14
SSR4-207ENST00000471724 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SSR4-207ENST00000471724 KIF14Q15058 1648 aa22.17■■□□□ 1.14
SSR4-207ENST00000471724 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.16■■□□□ 1.14
SSR4-207ENST00000471724 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SSR4-207ENST00000471724 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.14■■□□□ 1.14
SSR4-207ENST00000471724 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.14■■□□□ 1.13
SSR4-207ENST00000471724 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.13■■□□□ 1.13
SSR4-207ENST00000471724 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.13■■□□□ 1.13
SSR4-207ENST00000471724 TSPOAP1O95153 1857 aa22.12■■□□□ 1.13
SSR4-207ENST00000471724 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.09■■□□□ 1.13
SSR4-207ENST00000471724 APLP2Q06481 763 aa22.08■■□□□ 1.13
SSR4-207ENST00000471724 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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SSR4-207ENST00000471724 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.07■■□□□ 1.12
SSR4-207ENST00000471724 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.124e-9■□□□□ 10.3
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SSR4-207ENST00000471724 KCNH8Q96L42 1107 aa22.03■■□□□ 1.12
SSR4-207ENST00000471724 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.03■■□□□ 1.12
SSR4-207ENST00000471724 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SSR4-207ENST00000471724 KDM6BO15054 1643 aa22.02■■□□□ 1.11
SSR4-207ENST00000471724 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.01■■□□□ 1.11
SSR4-207ENST00000471724 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22■■□□□ 1.11
SSR4-207ENST00000471724 PREX2Q70Z35 1606 aa22■■□□□ 1.11
SSR4-207ENST00000471724 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.99■■□□□ 1.11
SSR4-207ENST00000471724 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.98■■□□□ 1.11
SSR4-207ENST00000471724 CD109Q6YHK3 1445 aa21.97■■□□□ 1.11
SSR4-207ENST00000471724 NCOA2Q15596 1464 aa21.94■■□□□ 1.1
SSR4-207ENST00000471724 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.94■■□□□ 1.1
SSR4-207ENST00000471724 PLCH2O75038 1416 aa21.89■■□□□ 1.1
SSR4-207ENST00000471724 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.89■■□□□ 1.09
SSR4-207ENST00000471724 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.88■■□□□ 1.09
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