RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469137.5

LIN7B-204, Transcript of lin-7 homolog B, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene LIN7B, Length 1,057 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7B-204ENST00000469137 CUL7Q14999 1698 aa49.45■■■■■ 5.51
LIN7B-204ENST00000469137 IGF1RP08069 1367 aa49.4■■■■■ 5.5
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LIN7B-204ENST00000469137 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.1■■■■■ 5.45
LIN7B-204ENST00000469137 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.08■■■■■ 5.45
LIN7B-204ENST00000469137 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.99■■■■■ 5.43
LIN7B-204ENST00000469137 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.99■■■■■ 5.43
LIN7B-204ENST00000469137 MAPKBP1O60336 1514 aa48.94■■■■■ 5.43
LIN7B-204ENST00000469137 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.86■■■■■ 5.41
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LIN7B-204ENST00000469137 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.82■■■■■ 5.41
LIN7B-204ENST00000469137 PTPRGP23470 1445 aa48.78■■■■■ 5.4
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LIN7B-204ENST00000469137 DIP2BQ9P265 1576 aa48.76■■■■■ 5.4
LIN7B-204ENST00000469137 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.71■■■■■ 5.39
LIN7B-204ENST00000469137 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.69■■■■■ 5.39
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LIN7B-204ENST00000469137 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.53■■■■■ 5.36
LIN7B-204ENST00000469137 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.47■■■■■ 5.35
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LIN7B-204ENST00000469137 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.38■■■■■ 5.34
LIN7B-204ENST00000469137 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.35■■■■■ 5.33
LIN7B-204ENST00000469137 ASXL2Q76L83 1435 aa48.33■■■■■ 5.33
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LIN7B-204ENST00000469137 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.24■■■■■ 5.31
LIN7B-204ENST00000469137 PRXQ9BXM0 1461 aa48.2■■■■■ 5.31
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LIN7B-204ENST00000469137 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.91■■■■■ 5.26
LIN7B-204ENST00000469137 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.88■■■■■ 5.26
LIN7B-204ENST00000469137 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.81■■■■■ 5.24
LIN7B-204ENST00000469137 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.75■■■■■ 5.23
LIN7B-204ENST00000469137 EEA1Q15075 1411 aa47.73■■■■■ 5.23
LIN7B-204ENST00000469137 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.68■■■■■ 5.22
LIN7B-204ENST00000469137 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.68■■■■■ 5.22
LIN7B-204ENST00000469137 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.67■■■■■ 5.22
LIN7B-204ENST00000469137 SAMD9Q5K651 1589 aa47.64■■■■■ 5.22
LIN7B-204ENST00000469137 P3H3Q8IVL6 736 aa47.59■■■■■ 5.21
LIN7B-204ENST00000469137 CD109Q6YHK3 1445 aa47.58■■■■■ 5.21
LIN7B-204ENST00000469137 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.58■■■■■ 5.21
LIN7B-204ENST00000469137 KCNH8Q96L42 1107 aa47.57■■■■■ 5.21
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LIN7B-204ENST00000469137 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.45■■■■■ 5.19
LIN7B-204ENST00000469137 ARID3CA6NKF2 412 aa47.42■■■■■ 5.18
LIN7B-204ENST00000469137 ADGRL1O94910 1474 aa47.41■■■■■ 5.18
LIN7B-204ENST00000469137 KIF21BO75037 1637 aa47.34■■■■■ 5.17
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LIN7B-204ENST00000469137 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.21■■■■■ 5.15
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LIN7B-204ENST00000469137 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.15■■■■■ 5.14
LIN7B-204ENST00000469137 NEO1Q92859 1461 aa47.05■■■■■ 5.12
LIN7B-204ENST00000469137 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.97■■■■■ 5.11
LIN7B-204ENST00000469137 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.93■■■■■ 5.1
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LIN7B-204ENST00000469137 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.81■■■■■ 5.08
LIN7B-204ENST00000469137 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.81■■■■■ 5.08
LIN7B-204ENST00000469137 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.8■■■■■ 5.08
LIN7B-204ENST00000469137 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.8■■■■■ 5.08
LIN7B-204ENST00000469137 FMN1Q68DA7 1419 aa46.78■■■■■ 5.08
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LIN7B-204ENST00000469137 HECW1Q76N89 1606 aa46.73■■■■■ 5.07
LIN7B-204ENST00000469137 FANCAO15360 1455 aa46.73■■■■■ 5.07
LIN7B-204ENST00000469137 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.72■■■■■ 5.07
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LIN7B-204ENST00000469137 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.5■■■■■ 5.03
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LIN7B-204ENST00000469137 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.47■■■■■ 5.03
LIN7B-204ENST00000469137 KIF14Q15058 1648 aa46.43■■■■■ 5.02
LIN7B-204ENST00000469137 MADDQ8WXG6 1647 aa46.42■■■■■ 5.02
LIN7B-204ENST00000469137 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.4■■■■■ 5.02
LIN7B-204ENST00000469137 MAGI2Q86UL8 1455 aa46.4■■■■■ 5.02
LIN7B-204ENST00000469137 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.37■■■■■ 5.01
LIN7B-204ENST00000469137 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.37■■■■■ 5.01
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