RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-205ENST00000468532 JPH4Q96JJ6 628 aa52.98■■■■■ 6.07
CHKB-205ENST00000468532 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP52.96■■■■■ 6.07
CHKB-205ENST00000468532 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa52.92■■■■■ 6.06
CHKB-205ENST00000468532 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa52.75■■■■■ 6.03
CHKB-205ENST00000468532 TRHP20396 242 aaPredicted RBP52.65■■■■■ 6.02
CHKB-205ENST00000468532 IQGAP2Q13576 1575 aa52.59■■■■■ 6.01
CHKB-205ENST00000468532 PRXQ9BXM0 1461 aa52.43■■■■■ 5.98
CHKB-205ENST00000468532 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa52.38■■■■■ 5.98
CHKB-205ENST00000468532 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa52.33■■■■■ 5.97
CHKB-205ENST00000468532 UGGT2Q9NYU1 1516 aa52.27■■■■■ 5.96
CHKB-205ENST00000468532 CSRNP3Q8WYN3 585 aa52.26■■■■■ 5.96
CHKB-205ENST00000468532 PTPRGP23470 1445 aa52.25■■■■■ 5.96
CHKB-205ENST00000468532 ADCY10Q96PN6 1610 aa52.25■■■■■ 5.95
CHKB-205ENST00000468532 DISP1Q96F81 1524 aa52.25■■■■■ 5.95
CHKB-205ENST00000468532 TNIKQ9UKE5 1360 aa52.24■■■■■ 5.95
CHKB-205ENST00000468532 EEA1Q15075 1411 aa52.23■■■■■ 5.95
CHKB-205ENST00000468532 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP52.2■■■■■ 5.95
CHKB-205ENST00000468532 CHIC1Q5VXU3 224 aa52.16■■■■■ 5.94
CHKB-205ENST00000468532 KIAA0556O60303 1618 aa52.11■■■■■ 5.93
CHKB-205ENST00000468532 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP52.11■■■■■ 5.93
CHKB-205ENST00000468532 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP52.05■■■■■ 5.92
CHKB-205ENST00000468532 MAPKBP1O60336 1514 aa51.98■■■■■ 5.91
CHKB-205ENST00000468532 GOLGA3Q08378 1498 aa51.94■■■■■ 5.91
CHKB-205ENST00000468532 KIF13AQ9H1H9 1805 aa51.92■■■■■ 5.9
CHKB-205ENST00000468532 UACAQ9BZF9 1416 aa51.89■■■■■ 5.9
CHKB-205ENST00000468532 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa51.86■■■■■ 5.89
CHKB-205ENST00000468532 ABCC2Q92887 1545 aa51.86■■■■■ 5.89
CHKB-205ENST00000468532 ABCC10Q5T3U5 1492 aa51.8■■■■■ 5.88
CHKB-205ENST00000468532 KIF21BO75037 1637 aa51.78■■■■■ 5.88
CHKB-205ENST00000468532 DIP2BQ9P265 1576 aa51.73■■■■■ 5.87
CHKB-205ENST00000468532 FAM69CQ0P6D2 419 aa51.71■■■■■ 5.87
CHKB-205ENST00000468532 PLB1Q6P1J6 1458 aa51.63■■■■■ 5.86
CHKB-205ENST00000468532 KDM5BQ9UGL1 1544 aa51.62■■■■■ 5.85
CHKB-205ENST00000468532 SAMD9Q5K651 1589 aa51.6■■■■■ 5.85
CHKB-205ENST00000468532 ASXL2Q76L83 1435 aa51.58■■■■■ 5.85
CHKB-205ENST00000468532 P3H3Q8IVL6 736 aa51.58■■■■■ 5.85
CHKB-205ENST00000468532 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP51.56■■■■■ 5.85
CHKB-205ENST00000468532 ABCA8O94911 1581 aa51.56■■■■■ 5.84
CHKB-205ENST00000468532 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP51.48■■■■■ 5.83
CHKB-205ENST00000468532 EHMT2Q96KQ7 1210 aa51.44■■■■■ 5.83
CHKB-205ENST00000468532 TSPOAP1O95153 1857 aa51.37■■■■■ 5.81
CHKB-205ENST00000468532 UBTFP17480 764 aaKnown RBP51.34■■■■■ 5.81
CHKB-205ENST00000468532 GLI2P10070 1586 aa51.32■■■■■ 5.81
CHKB-205ENST00000468532 FHOD3Q2V2M9 1422 aa51.29■■■■■ 5.8
CHKB-205ENST00000468532 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP51.28■■■■■ 5.8
CHKB-205ENST00000468532 EFCAB5A4FU69 1503 aa51.27■■■■■ 5.8
CHKB-205ENST00000468532 WDR7Q9Y4E6 1490 aa51.25■■■■■ 5.79
CHKB-205ENST00000468532 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa51.21■■■■■ 5.79
CHKB-205ENST00000468532 ARID3CA6NKF2 412 aa51.16■■■■■ 5.78
CHKB-205ENST00000468532 ATP10BO94823 1461 aa51.11■■■■■ 5.77
CHKB-205ENST00000468532 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP51.11■■■■■ 5.77
CHKB-205ENST00000468532 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa51.1■■■■■ 5.77
CHKB-205ENST00000468532 KDM6BO15054 1643 aa51.04■■■■■ 5.76
CHKB-205ENST00000468532 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP51■■■■■ 5.75
CHKB-205ENST00000468532 KCNH8Q96L42 1107 aa51■■■■■ 5.75
CHKB-205ENST00000468532 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa50.95■■■■■ 5.75
CHKB-205ENST00000468532 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP50.9■■■■■ 5.74
CHKB-205ENST00000468532 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP50.9■■■■■ 5.74
CHKB-205ENST00000468532 CFAP43Q8NDM7 1665 aa50.89■■■■■ 5.74
CHKB-205ENST00000468532 TEX14Q8IWB6 1497 aa50.88■■■■■ 5.74
CHKB-205ENST00000468532 CD109Q6YHK3 1445 aa50.81■■■■■ 5.72
CHKB-205ENST00000468532 FMN1Q68DA7 1419 aa50.79■■■■■ 5.72
CHKB-205ENST00000468532 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa50.73■■■■■ 5.71
CHKB-205ENST00000468532 ABCA9Q8IUA7 1624 aa50.67■■■■■ 5.7
CHKB-205ENST00000468532 HECW1Q76N89 1606 aa50.65■■■■■ 5.7
CHKB-205ENST00000468532 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP50.64■■■■■ 5.7
CHKB-205ENST00000468532 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP50.63■■■■■ 5.7
CHKB-205ENST00000468532 PLEKHD1A6NEE1 506 aa50.61■■■■■ 5.69
CHKB-205ENST00000468532 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP50.6■■■■■ 5.69
CHKB-205ENST00000468532 CLIP1P30622 1438 aa50.49■■■■■ 5.67
CHKB-205ENST00000468532 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP50.39■■■■■ 5.66
CHKB-205ENST00000468532 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa50.38■■■■■ 5.66
CHKB-205ENST00000468532 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP50.36■■■■■ 5.65
CHKB-205ENST00000468532 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa50.34■■■■■ 5.65
CHKB-205ENST00000468532 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP50.33■■■■■ 5.65
CHKB-205ENST00000468532 TTC37Q6PGP7 1564 aa50.32■■■■■ 5.65
CHKB-205ENST00000468532 ARAP3Q8WWN8 1544 aa50.31■■■■■ 5.64
CHKB-205ENST00000468532 NEO1Q92859 1461 aa50.29■■■■■ 5.64
CHKB-205ENST00000468532 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP50.29■■■■■ 5.64
CHKB-205ENST00000468532 PHLDB1Q86UU1 1377 aa50.29■■■■■ 5.64
CHKB-205ENST00000468532 FYCO1Q9BQS8 1478 aa50.21■■■■■ 5.63
CHKB-205ENST00000468532 CCDC18Q5T9S5 1454 aa50.2■■■■■ 5.63
CHKB-205ENST00000468532 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP50.17■■■■■ 5.62
CHKB-205ENST00000468532 CEP162Q5TB80 1403 aa50.15■■■■■ 5.62
CHKB-205ENST00000468532 KIF14Q15058 1648 aa50.13■■■■■ 5.62
CHKB-205ENST00000468532 CFAP74Q9C0B2 1584 aa50.13■■■■■ 5.61
CHKB-205ENST00000468532 FANCAO15360 1455 aa50.12■■■■■ 5.61
CHKB-205ENST00000468532 AKNAQ7Z591 1439 aa50.05■■■■■ 5.6
CHKB-205ENST00000468532 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa50.05■■■■■ 5.6
CHKB-205ENST00000468532 RAPGEF3O95398 923 aa50.04■■■■■ 5.6
CHKB-205ENST00000468532 MYO5CQ9NQX4 1742 aa50.04■■■■■ 5.6
CHKB-205ENST00000468532 PLCH2O75038 1416 aa50.03■■■■■ 5.6
CHKB-205ENST00000468532 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa50.03■■■■■ 5.6
CHKB-205ENST00000468532 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa50■■■■■ 5.59
CHKB-205ENST00000468532 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP49.95■■■■■ 5.59
CHKB-205ENST00000468532 ADGRL1O94910 1474 aa49.93■■■■■ 5.58
CHKB-205ENST00000468532 RICTORQ6R327 1708 aa49.9■■■■■ 5.58
CHKB-205ENST00000468532 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa49.84■■■■■ 5.57
CHKB-205ENST00000468532 ARHGAP5Q13017 1502 aa49.81■■■■■ 5.56
CHKB-205ENST00000468532 SCAPERQ9BY12 1400 aa49.77■■■■■ 5.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.6 ms