RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465614.1

LMO2-205, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 5

Gene LMO2, Length 869 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-205ENST00000465614 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.03■■■■■ 4.32
LMO2-205ENST00000465614 CUL7Q14999 1698 aa41.88■■■■■ 4.29
LMO2-205ENST00000465614 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.87■■■■■ 4.29
LMO2-205ENST00000465614 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.75■■■■■ 4.27
LMO2-205ENST00000465614 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.61■■■■■ 4.25
LMO2-205ENST00000465614 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.59■■■■■ 4.25
LMO2-205ENST00000465614 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.58■■■■■ 4.25
LMO2-205ENST00000465614 MAPKBP1O60336 1514 aa41.56■■■■■ 4.24
LMO2-205ENST00000465614 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.53■■■■■ 4.24
LMO2-205ENST00000465614 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.48■■■■■ 4.23
LMO2-205ENST00000465614 PTPRGP23470 1445 aa41.47■■■■■ 4.23
LMO2-205ENST00000465614 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.44■■■■■ 4.22
LMO2-205ENST00000465614 IQGAP2Q13576 1575 aa41.42■■■■■ 4.22
LMO2-205ENST00000465614 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.4■■■■■ 4.22
LMO2-205ENST00000465614 DIP2BQ9P265 1576 aa41.38■■■■■ 4.22
LMO2-205ENST00000465614 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.35■■■■■ 4.21
LMO2-205ENST00000465614 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
LMO2-205ENST00000465614 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
LMO2-205ENST00000465614 DISP1Q96F81 1524 aa41.27■■■■■ 4.2
LMO2-205ENST00000465614 ABCC2Q92887 1545 aa41.24■■■■■ 4.19
LMO2-205ENST00000465614 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.21■■■■■ 4.19
LMO2-205ENST00000465614 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.2■■■■■ 4.19
LMO2-205ENST00000465614 UACAQ9BZF9 1416 aa41.16■■■■■ 4.18
LMO2-205ENST00000465614 ASXL2Q76L83 1435 aa41.09■■■■■ 4.17
LMO2-205ENST00000465614 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.08■■■■■ 4.17
LMO2-205ENST00000465614 KIAA0556O60303 1618 aa41.04■■■■■ 4.16
LMO2-205ENST00000465614 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41■■■■■ 4.15
LMO2-205ENST00000465614 PRXQ9BXM0 1461 aa40.98■■■■■ 4.15
LMO2-205ENST00000465614 KDM6BO15054 1643 aa40.98■■■■■ 4.15
LMO2-205ENST00000465614 TSPOAP1O95153 1857 aa40.97■■■■■ 4.15
LMO2-205ENST00000465614 GLI2P10070 1586 aa40.97■■■■■ 4.15
LMO2-205ENST00000465614 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.91■■■■■ 4.14
LMO2-205ENST00000465614 GOLGA3Q08378 1498 aa40.86■■■■■ 4.13
LMO2-205ENST00000465614 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
LMO2-205ENST00000465614 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
LMO2-205ENST00000465614 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
LMO2-205ENST00000465614 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.71■■■■■ 4.11
LMO2-205ENST00000465614 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.7■■■■■ 4.11
LMO2-205ENST00000465614 ABCA8O94911 1581 aa40.69■■■■■ 4.11
LMO2-205ENST00000465614 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.65■■■■■ 4.1
LMO2-205ENST00000465614 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.64■■■■■ 4.1
LMO2-205ENST00000465614 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.63■■■■■ 4.09
LMO2-205ENST00000465614 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
LMO2-205ENST00000465614 EEA1Q15075 1411 aa40.5■■■■■ 4.07
LMO2-205ENST00000465614 P3H3Q8IVL6 736 aa40.47■■■■■ 4.07
LMO2-205ENST00000465614 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
LMO2-205ENST00000465614 KCNH8Q96L42 1107 aa40.45■■■■■ 4.07
LMO2-205ENST00000465614 CD109Q6YHK3 1445 aa40.44■■■■■ 4.06
LMO2-205ENST00000465614 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.43■■■■■ 4.06
LMO2-205ENST00000465614 SAMD9Q5K651 1589 aa40.42■■■■■ 4.06
LMO2-205ENST00000465614 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.39■■■■■ 4.06
LMO2-205ENST00000465614 ATP10BO94823 1461 aa40.39■■■■■ 4.06
LMO2-205ENST00000465614 ARID3CA6NKF2 412 aa40.31■■■■■ 4.04
LMO2-205ENST00000465614 ADGRL1O94910 1474 aa40.28■■■■■ 4.04
LMO2-205ENST00000465614 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.22■■■■■ 4.03
LMO2-205ENST00000465614 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.15■■■■■ 4.02
LMO2-205ENST00000465614 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
LMO2-205ENST00000465614 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
LMO2-205ENST00000465614 KIF21BO75037 1637 aa40.13■■■■■ 4.01
LMO2-205ENST00000465614 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.13■■■■■ 4.01
LMO2-205ENST00000465614 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.12■■■■■ 4.01
LMO2-205ENST00000465614 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
LMO2-205ENST00000465614 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
LMO2-205ENST00000465614 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.07■■■■■ 4
LMO2-205ENST00000465614 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.03■■■■■ 4
LMO2-205ENST00000465614 NEO1Q92859 1461 aa39.96■■■■□ 3.99
LMO2-205ENST00000465614 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.92■■■■□ 3.98
LMO2-205ENST00000465614 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.92■■■■□ 3.98
LMO2-205ENST00000465614 RAPGEF3O95398 923 aa39.86■■■■□ 3.97
LMO2-205ENST00000465614 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
LMO2-205ENST00000465614 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.75■■■■□ 3.95
LMO2-205ENST00000465614 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.74■■■■□ 3.95
LMO2-205ENST00000465614 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.74■■■■□ 3.95
LMO2-205ENST00000465614 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
LMO2-205ENST00000465614 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.7■■■■□ 3.95
LMO2-205ENST00000465614 FMN1Q68DA7 1419 aa39.7■■■■□ 3.95
LMO2-205ENST00000465614 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.69■■■■□ 3.94
LMO2-205ENST00000465614 AKNAQ7Z591 1439 aa39.68■■■■□ 3.94
LMO2-205ENST00000465614 FANCAO15360 1455 aa39.68■■■■□ 3.94
LMO2-205ENST00000465614 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
LMO2-205ENST00000465614 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.65■■■■□ 3.94
LMO2-205ENST00000465614 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.61■■■■□ 3.93
LMO2-205ENST00000465614 HECW1Q76N89 1606 aa39.58■■■■□ 3.93
LMO2-205ENST00000465614 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.57■■■■□ 3.93
LMO2-205ENST00000465614 RICTORQ6R327 1708 aa39.56■■■■□ 3.92
LMO2-205ENST00000465614 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
LMO2-205ENST00000465614 PLCH2O75038 1416 aa39.53■■■■□ 3.92
LMO2-205ENST00000465614 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.53■■■■□ 3.92
LMO2-205ENST00000465614 PTPRMP28827 1452 aa39.51■■■■□ 3.92
LMO2-205ENST00000465614 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
LMO2-205ENST00000465614 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
LMO2-205ENST00000465614 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.49■■■■□ 3.91
LMO2-205ENST00000465614 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.48■■■■□ 3.91
LMO2-205ENST00000465614 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.41■■■■□ 3.9
LMO2-205ENST00000465614 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.4■■■■□ 3.9
LMO2-205ENST00000465614 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
LMO2-205ENST00000465614 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.38■■■■□ 3.89
LMO2-205ENST00000465614 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.38■■■■□ 3.89
LMO2-205ENST00000465614 MADDQ8WXG6 1647 aa39.37■■■■□ 3.89
LMO2-205ENST00000465614 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.37■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms