RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 SHROOM2Q13796 1616 aa25.45■■□□□ 1.66
CENPF-202ENST00000464322 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.43■■□□□ 1.66
CENPF-202ENST00000464322 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.4■■□□□ 1.66
CENPF-202ENST00000464322 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.33■■□□□ 1.65
CENPF-202ENST00000464322 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.29■■□□□ 1.64
CENPF-202ENST00000464322 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CENPF-202ENST00000464322 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CENPF-202ENST00000464322 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.19■■□□□ 1.62
CENPF-202ENST00000464322 MAPKBP1O60336 1514 aa25.17■■□□□ 1.62
CENPF-202ENST00000464322 DIP2BQ9P265 1576 aa25.14■■□□□ 1.61
CENPF-202ENST00000464322 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.13■■□□□ 1.61
CENPF-202ENST00000464322 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.13■■□□□ 1.61
CENPF-202ENST00000464322 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.13■■□□□ 1.61
CENPF-202ENST00000464322 IGF1RP08069 1367 aa25.12■■□□□ 1.61
CENPF-202ENST00000464322 KDM6BO15054 1643 aa25.1■■□□□ 1.61
CENPF-202ENST00000464322 PTPRGP23470 1445 aa25.09■■□□□ 1.61
CENPF-202ENST00000464322 KIF27Q86VH2 1401 aa25.08■■□□□ 1.61
CENPF-202ENST00000464322 TSPOAP1O95153 1857 aa25.06■■□□□ 1.6
CENPF-202ENST00000464322 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.98■■□□□ 1.59
CENPF-202ENST00000464322 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.97■■□□□ 1.59
CENPF-202ENST00000464322 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.96■■□□□ 1.59
CENPF-202ENST00000464322 CUL7Q14999 1698 aa24.95■■□□□ 1.58
CENPF-202ENST00000464322 ASXL2Q76L83 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
CENPF-202ENST00000464322 ABCC2Q92887 1545 aa24.91■■□□□ 1.58
CENPF-202ENST00000464322 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.89■■□□□ 1.58
CENPF-202ENST00000464322 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CENPF-202ENST00000464322 UACAQ9BZF9 1416 aa24.83■■□□□ 1.57
CENPF-202ENST00000464322 IQGAP2Q13576 1575 aa24.79■■□□□ 1.56
CENPF-202ENST00000464322 ADGRL1O94910 1474 aa24.77■■□□□ 1.56
CENPF-202ENST00000464322 GLI2P10070 1586 aa24.77■■□□□ 1.56
CENPF-202ENST00000464322 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
CENPF-202ENST00000464322 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CENPF-202ENST00000464322 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CENPF-202ENST00000464322 DISP1Q96F81 1524 aa24.71■■□□□ 1.55
CENPF-202ENST00000464322 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CENPF-202ENST00000464322 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.7■■□□□ 1.54
CENPF-202ENST00000464322 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.67■■□□□ 1.54
CENPF-202ENST00000464322 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.64■■□□□ 1.54
CENPF-202ENST00000464322 KCNH8Q96L42 1107 aa24.64■■□□□ 1.54
CENPF-202ENST00000464322 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.6■■□□□ 1.53
CENPF-202ENST00000464322 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.59■■□□□ 1.53
CENPF-202ENST00000464322 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CENPF-202ENST00000464322 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.56■■□□□ 1.52
CENPF-202ENST00000464322 KIAA0556O60303 1618 aa24.54■■□□□ 1.52
CENPF-202ENST00000464322 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.54■■□□□ 1.52
CENPF-202ENST00000464322 CD109Q6YHK3 1445 aa24.53■■□□□ 1.52
CENPF-202ENST00000464322 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CENPF-202ENST00000464322 ARID3CA6NKF2 412 aa24.47■■□□□ 1.51
CENPF-202ENST00000464322 GOLGA3Q08378 1498 aa24.45■■□□□ 1.5
CENPF-202ENST00000464322 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.43■■□□□ 1.5
CENPF-202ENST00000464322 P3H3Q8IVL6 736 aa24.38■■□□□ 1.49
CENPF-202ENST00000464322 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.36■■□□□ 1.49
CENPF-202ENST00000464322 ABCA8O94911 1581 aa24.35■■□□□ 1.49
CENPF-202ENST00000464322 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.31■■□□□ 1.48
CENPF-202ENST00000464322 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CENPF-202ENST00000464322 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CENPF-202ENST00000464322 KIF21BO75037 1637 aa24.28■■□□□ 1.48
CENPF-202ENST00000464322 RAPGEF3O95398 923 aa24.27■■□□□ 1.48
CENPF-202ENST00000464322 FBXO41Q8TF61 875 aa24.27■■□□□ 1.48
CENPF-202ENST00000464322 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CENPF-202ENST00000464322 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.25■■□□□ 1.47
CENPF-202ENST00000464322 ATP10BO94823 1461 aa24.24■■□□□ 1.47
CENPF-202ENST00000464322 PRXQ9BXM0 1461 aa24.22■■□□□ 1.47
CENPF-202ENST00000464322 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.22■■□□□ 1.47
CENPF-202ENST00000464322 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CENPF-202ENST00000464322 PTPRMP28827 1452 aa24.18■■□□□ 1.46
CENPF-202ENST00000464322 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.13■■□□□ 1.45
CENPF-202ENST00000464322 NEO1Q92859 1461 aa24.1■■□□□ 1.45
CENPF-202ENST00000464322 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.1■■□□□ 1.45
CENPF-202ENST00000464322 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.09■■□□□ 1.45
CENPF-202ENST00000464322 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.07■■□□□ 1.44
CENPF-202ENST00000464322 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.06■■□□□ 1.44
CENPF-202ENST00000464322 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.02■■□□□ 1.44
CENPF-202ENST00000464322 HSPA2P54652 639 aa23.99■■□□□ 1.43
CENPF-202ENST00000464322 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CENPF-202ENST00000464322 MADDQ8WXG6 1647 aa23.99■■□□□ 1.43
CENPF-202ENST00000464322 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.98■■□□□ 1.43
CENPF-202ENST00000464322 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CENPF-202ENST00000464322 MLECQ14165 292 aa23.97■■□□□ 1.43
CENPF-202ENST00000464322 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CENPF-202ENST00000464322 SAMD9Q5K651 1589 aa23.95■■□□□ 1.43
CENPF-202ENST00000464322 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.95■■□□□ 1.42
CENPF-202ENST00000464322 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.95■■□□□ 1.42
CENPF-202ENST00000464322 AKNAQ7Z591 1439 aa23.95■■□□□ 1.42
CENPF-202ENST00000464322 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.95■■□□□ 1.42
CENPF-202ENST00000464322 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.93■■□□□ 1.42
CENPF-202ENST00000464322 FANCAO15360 1455 aa23.91■■□□□ 1.42
CENPF-202ENST00000464322 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CENPF-202ENST00000464322 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.89■■□□□ 1.41
CENPF-202ENST00000464322 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CENPF-202ENST00000464322 CERKQ8TCT0 537 aa23.84■■□□□ 1.41
CENPF-202ENST00000464322 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.83■■□□□ 1.4
CENPF-202ENST00000464322 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.81■■□□□ 1.4
CENPF-202ENST00000464322 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.81■■□□□ 1.42e-6■□□□□ 8.3
CENPF-202ENST00000464322 RICTORQ6R327 1708 aa23.81■■□□□ 1.4
CENPF-202ENST00000464322 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.8■■□□□ 1.4
CENPF-202ENST00000464322 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.79■■□□□ 1.4
CENPF-202ENST00000464322 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.79■■□□□ 1.4
CENPF-202ENST00000464322 EEA1Q15075 1411 aa23.78■■□□□ 1.4
CENPF-202ENST00000464322 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms