RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461944.1

NGEF-208, Transcript of neuronal guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 4

Gene NGEF, Length 568 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGEF-208ENST00000461944 CEP170Q5SW79 1584 aa29.83■■■□□ 2.37
NGEF-208ENST00000461944 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.77■■■□□ 2.36
NGEF-208ENST00000461944 NUP160Q12769 1436 aa29.75■■■□□ 2.35
NGEF-208ENST00000461944 IQGAP2Q13576 1575 aa29.75■■■□□ 2.35
NGEF-208ENST00000461944 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.66■■■□□ 2.34
NGEF-208ENST00000461944 CEP162Q5TB80 1403 aa29.63■■■□□ 2.33
NGEF-208ENST00000461944 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.62■■■□□ 2.33
NGEF-208ENST00000461944 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
NGEF-208ENST00000461944 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.55■■■□□ 2.32
NGEF-208ENST00000461944 CLIP1P30622 1438 aa29.55■■■□□ 2.32
NGEF-208ENST00000461944 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.53■■■□□ 2.32
NGEF-208ENST00000461944 SAMD9Q5K651 1589 aa29.52■■■□□ 2.32
NGEF-208ENST00000461944 SHROOM2Q13796 1616 aa29.52■■■□□ 2.32
NGEF-208ENST00000461944 KIAA0556O60303 1618 aa29.46■■■□□ 2.31
NGEF-208ENST00000461944 OSCARQ8IYS5 282 aa29.46■■■□□ 2.31
NGEF-208ENST00000461944 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.44■■■□□ 2.3
NGEF-208ENST00000461944 DISP1Q96F81 1524 aa29.38■■■□□ 2.29
NGEF-208ENST00000461944 ARAP1Q96P48 1450 aa29.36■■■□□ 2.29
NGEF-208ENST00000461944 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.36■■■□□ 2.29
NGEF-208ENST00000461944 JPH4Q96JJ6 628 aa29.35■■■□□ 2.29
NGEF-208ENST00000461944 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.35■■■□□ 2.29
NGEF-208ENST00000461944 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
NGEF-208ENST00000461944 P3H3Q8IVL6 736 aa29.29■■■□□ 2.28
NGEF-208ENST00000461944 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.29■■■□□ 2.28
NGEF-208ENST00000461944 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.23■■■□□ 2.27
NGEF-208ENST00000461944 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.23■■■□□ 2.27
NGEF-208ENST00000461944 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.23■■■□□ 2.27
NGEF-208ENST00000461944 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.2■■■□□ 2.27
NGEF-208ENST00000461944 FMN1Q68DA7 1419 aa29.2■■■□□ 2.26
NGEF-208ENST00000461944 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
NGEF-208ENST00000461944 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.25
NGEF-208ENST00000461944 ARHGEF11O15085 1522 aa29.14■■■□□ 2.25
NGEF-208ENST00000461944 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.1■■■□□ 2.25
NGEF-208ENST00000461944 HECW1Q76N89 1606 aa29.09■■■□□ 2.25
NGEF-208ENST00000461944 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.09■■■□□ 2.25
NGEF-208ENST00000461944 PTPRGP23470 1445 aa29.06■■■□□ 2.24
NGEF-208ENST00000461944 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.03■■■□□ 2.24
NGEF-208ENST00000461944 ABCA8O94911 1581 aa29.01■■■□□ 2.24
NGEF-208ENST00000461944 PLB1Q6P1J6 1458 aa29■■■□□ 2.23
NGEF-208ENST00000461944 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.99■■■□□ 2.23
NGEF-208ENST00000461944 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.99■■■□□ 2.23
NGEF-208ENST00000461944 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
NGEF-208ENST00000461944 ABCC2Q92887 1545 aa28.94■■■□□ 2.22
NGEF-208ENST00000461944 UACAQ9BZF9 1416 aa28.92■■■□□ 2.22
NGEF-208ENST00000461944 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.91■■■□□ 2.22
NGEF-208ENST00000461944 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
NGEF-208ENST00000461944 TIAM1Q13009 1591 aa28.89■■■□□ 2.22
NGEF-208ENST00000461944 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.88■■■□□ 2.21
NGEF-208ENST00000461944 APLP2Q06481 763 aa28.86■■■□□ 2.21
NGEF-208ENST00000461944 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.85■■■□□ 2.21
NGEF-208ENST00000461944 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
NGEF-208ENST00000461944 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
NGEF-208ENST00000461944 MAP3K1Q13233 1512 aa28.81■■■□□ 2.2
NGEF-208ENST00000461944 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
NGEF-208ENST00000461944 ARID3CA6NKF2 412 aa28.79■■■□□ 2.2
NGEF-208ENST00000461944 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.79■■■□□ 2.2
NGEF-208ENST00000461944 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.71■■■□□ 2.19
NGEF-208ENST00000461944 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.71■■■□□ 2.19
NGEF-208ENST00000461944 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
NGEF-208ENST00000461944 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
NGEF-208ENST00000461944 ATP10BO94823 1461 aa28.7■■■□□ 2.18
NGEF-208ENST00000461944 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.67■■■□□ 2.18
NGEF-208ENST00000461944 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.65■■■□□ 2.18
NGEF-208ENST00000461944 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.63■■■□□ 2.17
NGEF-208ENST00000461944 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
NGEF-208ENST00000461944 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
NGEF-208ENST00000461944 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
NGEF-208ENST00000461944 KIF14Q15058 1648 aa28.58■■■□□ 2.17
NGEF-208ENST00000461944 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.57■■■□□ 2.16
NGEF-208ENST00000461944 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
NGEF-208ENST00000461944 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
NGEF-208ENST00000461944 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
NGEF-208ENST00000461944 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.51■■■□□ 2.15
NGEF-208ENST00000461944 MAPKBP1O60336 1514 aa28.5■■■□□ 2.15
NGEF-208ENST00000461944 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.5■■■□□ 2.15
NGEF-208ENST00000461944 ASXL2Q76L83 1435 aa28.49■■■□□ 2.15
NGEF-208ENST00000461944 NCOA2Q15596 1464 aa28.46■■■□□ 2.15
NGEF-208ENST00000461944 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.43■■■□□ 2.14
NGEF-208ENST00000461944 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.41■■■□□ 2.14
NGEF-208ENST00000461944 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.37■■■□□ 2.13
NGEF-208ENST00000461944 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
NGEF-208ENST00000461944 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.35■■■□□ 2.13
NGEF-208ENST00000461944 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.33■■■□□ 2.13
NGEF-208ENST00000461944 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.33■■■□□ 2.13
NGEF-208ENST00000461944 PREX2Q70Z35 1606 aa28.32■■■□□ 2.12
NGEF-208ENST00000461944 KCNH8Q96L42 1107 aa28.32■■■□□ 2.12
NGEF-208ENST00000461944 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.32■■■□□ 2.12
NGEF-208ENST00000461944 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.31■■■□□ 2.12
NGEF-208ENST00000461944 DIP2BQ9P265 1576 aa28.3■■■□□ 2.12
NGEF-208ENST00000461944 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.3■■■□□ 2.12
NGEF-208ENST00000461944 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.24■■■□□ 2.11
NGEF-208ENST00000461944 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.23■■■□□ 2.11
NGEF-208ENST00000461944 GLI2P10070 1586 aa28.23■■■□□ 2.11
NGEF-208ENST00000461944 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
NGEF-208ENST00000461944 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.22■■■□□ 2.11
NGEF-208ENST00000461944 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.22■■■□□ 2.11
NGEF-208ENST00000461944 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.21■■■□□ 2.11
NGEF-208ENST00000461944 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.21■■■□□ 2.11
NGEF-208ENST00000461944 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
NGEF-208ENST00000461944 MIA2Q96PC5 1412 aa28.17■■■□□ 2.1
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