RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		22.38	■■□□□ 1.17
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		22.35	■■□□□ 1.17
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA3	Q08378	1498 aa		22.35	■■□□□ 1.17
SELENBP1-208	ENST00000447402	JPH4	Q96JJ6	628 aa		22.33	■■□□□ 1.17
SELENBP1-208	ENST00000447402	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	22.28	■■□□□ 1.16
SELENBP1-208	ENST00000447402	IQGAP2	Q13576	1575 aa		22.28	■■□□□ 1.16
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		22.28	■■□□□ 1.16
SELENBP1-208	ENST00000447402	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		22.26	■■□□□ 1.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	22.22	■■□□□ 1.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	SHROOM2	Q13796	1616 aa		22.21	■■□□□ 1.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGEF11	O15085	1522 aa		22.19	■■□□□ 1.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		22.15	■■□□□ 1.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		22.15	■■□□□ 1.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		22.15	■■□□□ 1.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		22.15	■■□□□ 1.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		22.15	■■□□□ 1.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	22.14	■■□□□ 1.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		22.14	■■□□□ 1.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		22.13	■■□□□ 1.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	P3H3	Q8IVL6	736 aa		22.12	■■□□□ 1.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		22.09	■■□□□ 1.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	DISP1	Q96F81	1524 aa		22.09	■■□□□ 1.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA0556	O60303	1618 aa		22.05	■■□□□ 1.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARAP1	Q96P48	1450 aa		22.04	■■□□□ 1.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTPRG	P23470	1445 aa		22.02	■■□□□ 1.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAMD9	Q5K651	1589 aa		21.99	■■□□□ 1.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLIP1	P30622	1438 aa		21.99	■■□□□ 1.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		21.98	■■□□□ 1.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		21.97	■■□□□ 1.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP162	Q5TB80	1403 aa		21.96	■■□□□ 1.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		21.96	■■□□□ 1.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	UACA	Q9BZF9	1416 aa		21.85	■■□□□ 1.09
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		21.85	■■□□□ 1.09
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	21.84	■■□□□ 1.09
SELENBP1-208	ENST00000447402	FMN1	Q68DA7	1419 aa		21.83	■■□□□ 1.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	21.81	■■□□□ 1.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARID3C	A6NKF2	412 aa		21.8	■■□□□ 1.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		21.79	■■□□□ 1.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCC2	Q92887	1545 aa		21.77	■■□□□ 1.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCA8	O94911	1581 aa		21.77	■■□□□ 1.08
SELENBP1-208	ENST00000447402	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		21.75	■■□□□ 1.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		21.75	■■□□□ 1.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	21.74	■■□□□ 1.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	21.74	■■□□□ 1.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	21.68	■■□□□ 1.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		21.67	■■□□□ 1.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	21.66	■■□□□ 1.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		21.66	■■□□□ 1.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		21.66	■■□□□ 1.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	HECW1	Q76N89	1606 aa		21.65	■■□□□ 1.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP10B	O94823	1461 aa		21.64	■■□□□ 1.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	21.64	■■□□□ 1.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		21.63	■■□□□ 1.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	21.6	■■□□□ 1.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	21.6	■■□□□ 1.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASXL2	Q76L83	1435 aa		21.57	■■□□□ 1.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		21.57	■■□□□ 1.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	21.56	■■□□□ 1.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNH8	Q96L42	1107 aa		21.55	■■□□□ 1.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAPKBP1	O60336	1514 aa		21.55	■■□□□ 1.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	APLP2	Q06481	763 aa		21.55	■■□□□ 1.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		21.54	■■□□□ 1.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		21.54	■■□□□ 1.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		21.51	■■□□□ 1.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		21.49	■■□□□ 1.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		21.44	■■□□□ 1.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		21.44	■■□□□ 1.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIAM1	Q13009	1591 aa		21.41	■■□□□ 1.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	DIP2B	Q9P265	1576 aa		21.4	■■□□□ 1.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		21.39	■■□□□ 1.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		21.38	■■□□□ 1.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP3K1	Q13233	1512 aa		21.36	■■□□□ 1.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		21.35	■■□□□ 1.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		21.34	■■□□□ 1.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF14	Q15058	1648 aa		21.33	■■□□□ 1.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		21.33	■■□□□ 1
SELENBP1-208	ENST00000447402	GLI2	P10070	1586 aa		21.33	■■□□□ 1
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD109	Q6YHK3	1445 aa		21.31	■■□□□ 1
SELENBP1-208	ENST00000447402	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	21.31	■■□□□ 1
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		21.28	■■□□□ 1
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSPOAP1	O95153	1857 aa		21.28	■■□□□ 1
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		21.27	■□□□□ 0.99
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		21.26	■□□□□ 0.99
SELENBP1-208	ENST00000447402	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		21.23	■□□□□ 0.99
SELENBP1-208	ENST00000447402	NCOA2	Q15596	1464 aa		21.23	■□□□□ 0.99
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLCH2	O75038	1416 aa		21.19	■□□□□ 0.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		21.18	■□□□□ 0.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		21.18	■□□□□ 0.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	21.18	■□□□□ 0.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	21.18	■□□□□ 0.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		21.17	■□□□□ 0.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		21.17	■□□□□ 0.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	21.15	■□□□□ 0.98
SELENBP1-208	ENST00000447402	FANCA	O15360	1455 aa		21.15	■□□□□ 0.98

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