RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446877.5

PMS1-214, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 4

Gene PMS1, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-214ENST00000446877 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.93■■■■■ 4.46
PMS1-214ENST00000446877 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.92■■■■■ 4.46
PMS1-214ENST00000446877 IGF1RP08069 1367 aa42.86■■■■■ 4.45
PMS1-214ENST00000446877 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.83■■■■■ 4.45
PMS1-214ENST00000446877 KIF27Q86VH2 1401 aa42.83■■■■■ 4.45
PMS1-214ENST00000446877 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.81■■■■■ 4.44
PMS1-214ENST00000446877 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.81■■■■■ 4.44
PMS1-214ENST00000446877 MAPKBP1O60336 1514 aa42.73■■■■■ 4.43
PMS1-214ENST00000446877 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.66■■■■■ 4.42
PMS1-214ENST00000446877 CUL7Q14999 1698 aa42.63■■■■■ 4.42
PMS1-214ENST00000446877 DIP2BQ9P265 1576 aa42.58■■■■■ 4.41
PMS1-214ENST00000446877 PTPRGP23470 1445 aa42.58■■■■■ 4.41
PMS1-214ENST00000446877 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.58■■■■■ 4.41
PMS1-214ENST00000446877 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
PMS1-214ENST00000446877 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.48■■■■■ 4.39
PMS1-214ENST00000446877 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.44■■■■■ 4.38
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PMS1-214ENST00000446877 ABCC2Q92887 1545 aa42.3■■■■■ 4.36
PMS1-214ENST00000446877 IQGAP2Q13576 1575 aa42.27■■■■■ 4.36
PMS1-214ENST00000446877 TSPOAP1O95153 1857 aa42.26■■■■■ 4.36
PMS1-214ENST00000446877 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.24■■■■■ 4.35
PMS1-214ENST00000446877 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.23■■■■■ 4.35
PMS1-214ENST00000446877 ASXL2Q76L83 1435 aa42.23■■■■■ 4.35
PMS1-214ENST00000446877 UACAQ9BZF9 1416 aa42.19■■■■■ 4.34
PMS1-214ENST00000446877 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.17■■■■■ 4.34
PMS1-214ENST00000446877 DISP1Q96F81 1524 aa42.11■■■■■ 4.33
PMS1-214ENST00000446877 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.1■■■■■ 4.33
PMS1-214ENST00000446877 GLI2P10070 1586 aa42.07■■■■■ 4.33
PMS1-214ENST00000446877 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42■■■■■ 4.31
PMS1-214ENST00000446877 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.97■■■■■ 4.31
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PMS1-214ENST00000446877 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.85■■■■■ 4.29
PMS1-214ENST00000446877 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
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PMS1-214ENST00000446877 ADGRL1O94910 1474 aa41.74■■■■■ 4.27
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PMS1-214ENST00000446877 KCNH8Q96L42 1107 aa41.66■■■■■ 4.26
PMS1-214ENST00000446877 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
PMS1-214ENST00000446877 CD109Q6YHK3 1445 aa41.59■■■■■ 4.25
PMS1-214ENST00000446877 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.56■■■■■ 4.24
PMS1-214ENST00000446877 PRXQ9BXM0 1461 aa41.53■■■■■ 4.24
PMS1-214ENST00000446877 ABCA8O94911 1581 aa41.51■■■■■ 4.24
PMS1-214ENST00000446877 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.5■■■■■ 4.23
PMS1-214ENST00000446877 P3H3Q8IVL6 736 aa41.41■■■■■ 4.22
PMS1-214ENST00000446877 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
PMS1-214ENST00000446877 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.39■■■■■ 4.22
PMS1-214ENST00000446877 ARID3CA6NKF2 412 aa41.39■■■■■ 4.22
PMS1-214ENST00000446877 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.26■■■■■ 4.2
PMS1-214ENST00000446877 ATP10BO94823 1461 aa41.26■■■■■ 4.2
PMS1-214ENST00000446877 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.24■■■■■ 4.19
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PMS1-214ENST00000446877 SAMD9Q5K651 1589 aa41.03■■■■■ 4.16
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PMS1-214ENST00000446877 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.42■■■■■ 4.06
PMS1-214ENST00000446877 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.41■■■■■ 4.06
PMS1-214ENST00000446877 MLECQ14165 292 aa40.4■■■■■ 4.06
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