RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.26■■■□□ 2.11
RABGEF1-204ENST00000442563 EEA1Q15075 1411 aa28.24■■■□□ 2.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ARAP1Q96P48 1450 aa28.23■■■□□ 2.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.23■■■□□ 2.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SHROOM2Q13796 1616 aa28.21■■■□□ 2.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PRXQ9BXM0 1461 aa28.19■■■□□ 2.1
RABGEF1-204ENST00000442563 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
RABGEF1-204ENST00000442563 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.11■■■□□ 2.09
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
RABGEF1-204ENST00000442563 IQGAP2Q13576 1575 aa28.03■■■□□ 2.08
RABGEF1-204ENST00000442563 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.96■■■□□ 2.07
RABGEF1-204ENST00000442563 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.92■■■□□ 2.06
RABGEF1-204ENST00000442563 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.87■■■□□ 2.05
RABGEF1-204ENST00000442563 DISP1Q96F81 1524 aa27.87■■■□□ 2.05
RABGEF1-204ENST00000442563 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.86■■■□□ 2.05
RABGEF1-204ENST00000442563 PTPRGP23470 1445 aa27.85■■■□□ 2.05
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF21BO75037 1637 aa27.85■■■□□ 2.05
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA3Q08378 1498 aa27.79■■■□□ 2.04
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA0556O60303 1618 aa27.74■■■□□ 2.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
RABGEF1-204ENST00000442563 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
RABGEF1-204ENST00000442563 UACAQ9BZF9 1416 aa27.66■■■□□ 2.02
RABGEF1-204ENST00000442563 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.64■■■□□ 2.02
RABGEF1-204ENST00000442563 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.64■■■□□ 2.01
RABGEF1-204ENST00000442563 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.61■■■□□ 2.01
RABGEF1-204ENST00000442563 P3H3Q8IVL6 736 aa27.59■■■□□ 2.01
RABGEF1-204ENST00000442563 SAMD9Q5K651 1589 aa27.58■■■□□ 2.01
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCC2Q92887 1545 aa27.57■■■□□ 2
RABGEF1-204ENST00000442563 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPKBP1O60336 1514 aa27.52■■■□□ 2
RABGEF1-204ENST00000442563 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.51■■□□□ 1.99
RABGEF1-204ENST00000442563 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.5■■□□□ 1.99
RABGEF1-204ENST00000442563 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.49■■□□□ 1.99
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCA8O94911 1581 aa27.48■■□□□ 1.99
RABGEF1-204ENST00000442563 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.43■■□□□ 1.98
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.42■■□□□ 1.98
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.38■■□□□ 1.97
RABGEF1-204ENST00000442563 ASXL2Q76L83 1435 aa27.38■■□□□ 1.97
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.37■■□□□ 1.97
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
RABGEF1-204ENST00000442563 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.3■■□□□ 1.96
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP10BO94823 1461 aa27.3■■□□□ 1.96
RABGEF1-204ENST00000442563 DIP2BQ9P265 1576 aa27.3■■□□□ 1.96
RABGEF1-204ENST00000442563 FMN1Q68DA7 1419 aa27.29■■□□□ 1.96
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.28■■□□□ 1.96
RABGEF1-204ENST00000442563 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.24■■□□□ 1.95
RABGEF1-204ENST00000442563 CLIP1P30622 1438 aa27.23■■□□□ 1.95
RABGEF1-204ENST00000442563 GLI2P10070 1586 aa27.22■■□□□ 1.95
RABGEF1-204ENST00000442563 ARID3CA6NKF2 412 aa27.22■■□□□ 1.95
RABGEF1-204ENST00000442563 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.21■■□□□ 1.95
RABGEF1-204ENST00000442563 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
RABGEF1-204ENST00000442563 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNH8Q96L42 1107 aa27.15■■□□□ 1.94
RABGEF1-204ENST00000442563 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.13■■□□□ 1.93
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP162Q5TB80 1403 aa27.09■■□□□ 1.93
RABGEF1-204ENST00000442563 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.07■■□□□ 1.92
RABGEF1-204ENST00000442563 HECW1Q76N89 1606 aa27.06■■□□□ 1.92
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.04■■□□□ 1.92
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
RABGEF1-204ENST00000442563 CD109Q6YHK3 1445 aa27.02■■□□□ 1.92
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPOAP1O95153 1857 aa26.99■■□□□ 1.91
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.98■■□□□ 1.91
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.97■■□□□ 1.91
RABGEF1-204ENST00000442563 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.97■■□□□ 1.91
RABGEF1-204ENST00000442563 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.96■■□□□ 1.91
RABGEF1-204ENST00000442563 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
RABGEF1-204ENST00000442563 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.94■■□□□ 1.9
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGEF1-204ENST00000442563 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.85■■□□□ 1.89
RABGEF1-204ENST00000442563 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGEF1-204ENST00000442563 KDM6BO15054 1643 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGEF1-204ENST00000442563 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.893e-6■■□□□ 14.4
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.8■■□□□ 1.88
RABGEF1-204ENST00000442563 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
RABGEF1-204ENST00000442563 NEO1Q92859 1461 aa26.77■■□□□ 1.88
RABGEF1-204ENST00000442563 PLCH2O75038 1416 aa26.74■■□□□ 1.87
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.74■■□□□ 1.87
RABGEF1-204ENST00000442563 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.74■■□□□ 1.87
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF14Q15058 1648 aa26.73■■□□□ 1.87
RABGEF1-204ENST00000442563 FANCAO15360 1455 aa26.68■■□□□ 1.86
RABGEF1-204ENST00000442563 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.68■■□□□ 1.86
RABGEF1-204ENST00000442563 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.68■■□□□ 1.86
RABGEF1-204ENST00000442563 AKNAQ7Z591 1439 aa26.66■■□□□ 1.86
RABGEF1-204ENST00000442563 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.63■■□□□ 1.85
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K1Q13233 1512 aa26.6■■□□□ 1.85
RABGEF1-204ENST00000442563 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGEF1-204ENST00000442563 RAPGEF3O95398 923 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGEF1-204ENST00000442563 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.58■■□□□ 1.85
RABGEF1-204ENST00000442563 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
RABGEF1-204ENST00000442563 TIAM1Q13009 1591 aa26.57■■□□□ 1.84
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.55■■□□□ 1.84
RABGEF1-204ENST00000442563 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms