RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAME-210ENST00000442481 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.56■□□□□ 0.88
PRAME-210ENST00000442481 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
PRAME-210ENST00000442481 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAME-210ENST00000442481 MAPKBP1O60336 1514 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAME-210ENST00000442481 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAME-210ENST00000442481 DIP2BQ9P265 1576 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAME-210ENST00000442481 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.43■□□□□ 0.86
PRAME-210ENST00000442481 CUL7Q14999 1698 aa20.43■□□□□ 0.86
PRAME-210ENST00000442481 KIF27Q86VH2 1401 aa20.42■□□□□ 0.86
PRAME-210ENST00000442481 KDM6BO15054 1643 aa20.41■□□□□ 0.86
PRAME-210ENST00000442481 IGF1RP08069 1367 aa20.39■□□□□ 0.85
PRAME-210ENST00000442481 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.38■□□□□ 0.85
PRAME-210ENST00000442481 TSPOAP1O95153 1857 aa20.37■□□□□ 0.85
PRAME-210ENST00000442481 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.3■□□□□ 0.84
PRAME-210ENST00000442481 PTPRGP23470 1445 aa20.29■□□□□ 0.84
PRAME-210ENST00000442481 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
PRAME-210ENST00000442481 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.25■□□□□ 0.83
PRAME-210ENST00000442481 ABCC2Q92887 1545 aa20.24■□□□□ 0.83
PRAME-210ENST00000442481 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.23■□□□□ 0.83
PRAME-210ENST00000442481 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRAME-210ENST00000442481 ASXL2Q76L83 1435 aa20.22■□□□□ 0.83
PRAME-210ENST00000442481 IQGAP2Q13576 1575 aa20.21■□□□□ 0.83
PRAME-210ENST00000442481 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.2■□□□□ 0.82
PRAME-210ENST00000442481 GLI2P10070 1586 aa20.2■□□□□ 0.82
PRAME-210ENST00000442481 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.17■□□□□ 0.82
PRAME-210ENST00000442481 DISP1Q96F81 1524 aa20.14■□□□□ 0.81
PRAME-210ENST00000442481 UACAQ9BZF9 1416 aa20.14■□□□□ 0.81
PRAME-210ENST00000442481 ADGRL1O94910 1474 aa20.13■□□□□ 0.81
PRAME-210ENST00000442481 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PRAME-210ENST00000442481 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRAME-210ENST00000442481 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PRAME-210ENST00000442481 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.09■□□□□ 0.81
PRAME-210ENST00000442481 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.08■□□□□ 0.81
PRAME-210ENST00000442481 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.07■□□□□ 0.8
PRAME-210ENST00000442481 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.06■□□□□ 0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PRAME-210ENST00000442481 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.05■□□□□ 0.8
PRAME-210ENST00000442481 KIAA0556O60303 1618 aa20.02■□□□□ 0.79
PRAME-210ENST00000442481 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.97■□□□□ 0.79
PRAME-210ENST00000442481 GOLGA3Q08378 1498 aa19.95■□□□□ 0.78
PRAME-210ENST00000442481 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.95■□□□□ 0.78
PRAME-210ENST00000442481 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
PRAME-210ENST00000442481 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.91■□□□□ 0.78
PRAME-210ENST00000442481 ABCA8O94911 1581 aa19.87■□□□□ 0.77
PRAME-210ENST00000442481 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.87■□□□□ 0.77
PRAME-210ENST00000442481 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.87■□□□□ 0.77
PRAME-210ENST00000442481 CD109Q6YHK3 1445 aa19.86■□□□□ 0.77
PRAME-210ENST00000442481 KCNH8Q96L42 1107 aa19.84■□□□□ 0.77
PRAME-210ENST00000442481 KIF21BO75037 1637 aa19.8■□□□□ 0.76
PRAME-210ENST00000442481 PRXQ9BXM0 1461 aa19.75■□□□□ 0.75
PRAME-210ENST00000442481 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.72■□□□□ 0.75
PRAME-210ENST00000442481 ARAP3Q8WWN8 1544 aa19.72■□□□□ 0.75
PRAME-210ENST00000442481 ARID3CA6NKF2 412 aa19.72■□□□□ 0.75
PRAME-210ENST00000442481 ATP10BO94823 1461 aa19.7■□□□□ 0.74
PRAME-210ENST00000442481 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.66■□□□□ 0.74
PRAME-210ENST00000442481 P3H3Q8IVL6 736 aa19.66■□□□□ 0.74
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.65■□□□□ 0.74
PRAME-210ENST00000442481 PTPRMP28827 1452 aa19.63■□□□□ 0.73
PRAME-210ENST00000442481 RAPGEF3O95398 923 aa19.62■□□□□ 0.73
PRAME-210ENST00000442481 NEO1Q92859 1461 aa19.6■□□□□ 0.73
PRAME-210ENST00000442481 SAMD9Q5K651 1589 aa19.59■□□□□ 0.73
PRAME-210ENST00000442481 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.59■□□□□ 0.73
PRAME-210ENST00000442481 FBXO41Q8TF61 875 aa19.59■□□□□ 0.73
PRAME-210ENST00000442481 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.58■□□□□ 0.73
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
PRAME-210ENST00000442481 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.56■□□□□ 0.72
PRAME-210ENST00000442481 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.55■□□□□ 0.72
PRAME-210ENST00000442481 MADDQ8WXG6 1647 aa19.54■□□□□ 0.72
PRAME-210ENST00000442481 EEA1Q15075 1411 aa19.53■□□□□ 0.72
PRAME-210ENST00000442481 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PRAME-210ENST00000442481 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PRAME-210ENST00000442481 LMTK3Q96Q04 1460 aa19.5■□□□□ 0.71
PRAME-210ENST00000442481 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
PRAME-210ENST00000442481 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.49■□□□□ 0.71
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.47■□□□□ 0.71
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.47■□□□□ 0.71
PRAME-210ENST00000442481 RICTORQ6R327 1708 aa19.45■□□□□ 0.7
PRAME-210ENST00000442481 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
PRAME-210ENST00000442481 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.44■□□□□ 0.7
PRAME-210ENST00000442481 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
PRAME-210ENST00000442481 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
PRAME-210ENST00000442481 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.42■□□□□ 0.7
PRAME-210ENST00000442481 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.42■□□□□ 0.7
PRAME-210ENST00000442481 AKNAQ7Z591 1439 aa19.42■□□□□ 0.7
PRAME-210ENST00000442481 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.41■□□□□ 0.7
PRAME-210ENST00000442481 FANCAO15360 1455 aa19.41■□□□□ 0.7
PRAME-210ENST00000442481 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.41■□□□□ 0.77e-13■□□□□ 11.3
PRAME-210ENST00000442481 HSPA2P54652 639 aa19.38■□□□□ 0.69
PRAME-210ENST00000442481 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.38■□□□□ 0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.37■□□□□ 0.69
PRAME-210ENST00000442481 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.36■□□□□ 0.69
PRAME-210ENST00000442481 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.36■□□□□ 0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.35■□□□□ 0.69
PRAME-210ENST00000442481 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.35■□□□□ 0.69
PRAME-210ENST00000442481 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.31■□□□□ 0.68
PRAME-210ENST00000442481 HECW1Q76N89 1606 aa19.31■□□□□ 0.68
PRAME-210ENST00000442481 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PRAME-210ENST00000442481 MLECQ14165 292 aa19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms