RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440239.5

CHTF18-204, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CHTF18, Length 1,801 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-204ENST00000440239 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.92■■■■□ 3.66
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CHTF18-204ENST00000440239 ARHGEF11O15085 1522 aa37.84■■■■□ 3.65
CHTF18-204ENST00000440239 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.84■■■■□ 3.65
CHTF18-204ENST00000440239 IQGAP2Q13576 1575 aa37.82■■■■□ 3.64
CHTF18-204ENST00000440239 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.81■■■■□ 3.64
CHTF18-204ENST00000440239 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.81■■■■□ 3.64
CHTF18-204ENST00000440239 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.81■■■■□ 3.64
CHTF18-204ENST00000440239 SHROOM2Q13796 1616 aa37.8■■■■□ 3.64
CHTF18-204ENST00000440239 GOLGA3Q08378 1498 aa37.77■■■■□ 3.64
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CHTF18-204ENST00000440239 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.72■■■■□ 3.63
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CHTF18-204ENST00000440239 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.54■■■■□ 3.6
CHTF18-204ENST00000440239 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
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CHTF18-204ENST00000440239 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.47■■■■□ 3.59
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CHTF18-204ENST00000440239 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.37■■■■□ 3.57
CHTF18-204ENST00000440239 PTPRGP23470 1445 aa37.34■■■■□ 3.57
CHTF18-204ENST00000440239 SAMD9Q5K651 1589 aa37.32■■■■□ 3.57
CHTF18-204ENST00000440239 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.24■■■■□ 3.55
CHTF18-204ENST00000440239 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.22■■■■□ 3.55
CHTF18-204ENST00000440239 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.17■■■■□ 3.54
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CHTF18-204ENST00000440239 CEP162Q5TB80 1403 aa37.08■■■■□ 3.53
CHTF18-204ENST00000440239 UACAQ9BZF9 1416 aa37.08■■■■□ 3.53
CHTF18-204ENST00000440239 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.08■■■■□ 3.53
CHTF18-204ENST00000440239 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.07■■■■□ 3.53
CHTF18-204ENST00000440239 ABCC2Q92887 1545 aa37■■■■□ 3.51
CHTF18-204ENST00000440239 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.99■■■■□ 3.51
CHTF18-204ENST00000440239 ABCA8O94911 1581 aa36.97■■■■□ 3.51
CHTF18-204ENST00000440239 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.95■■■■□ 3.51
CHTF18-204ENST00000440239 ARID3CA6NKF2 412 aa36.93■■■■□ 3.5
CHTF18-204ENST00000440239 FMN1Q68DA7 1419 aa36.92■■■■□ 3.5
CHTF18-204ENST00000440239 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.92■■■■□ 3.5
CHTF18-204ENST00000440239 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
CHTF18-204ENST00000440239 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
CHTF18-204ENST00000440239 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.8■■■■□ 3.48
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CHTF18-204ENST00000440239 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
CHTF18-204ENST00000440239 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
CHTF18-204ENST00000440239 HECW1Q76N89 1606 aa36.72■■■■□ 3.47
CHTF18-204ENST00000440239 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
CHTF18-204ENST00000440239 ATP10BO94823 1461 aa36.71■■■■□ 3.47
CHTF18-204ENST00000440239 MAPKBP1O60336 1514 aa36.69■■■■□ 3.46
CHTF18-204ENST00000440239 ASXL2Q76L83 1435 aa36.67■■■■□ 3.46
CHTF18-204ENST00000440239 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.67■■■■□ 3.46
CHTF18-204ENST00000440239 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
CHTF18-204ENST00000440239 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.61■■■■□ 3.45
CHTF18-204ENST00000440239 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
CHTF18-204ENST00000440239 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.58■■■■□ 3.45
CHTF18-204ENST00000440239 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.57■■■■□ 3.45
CHTF18-204ENST00000440239 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.54■■■■□ 3.44
CHTF18-204ENST00000440239 KCNH8Q96L42 1107 aa36.53■■■■□ 3.44
CHTF18-204ENST00000440239 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.51■■■■□ 3.44
CHTF18-204ENST00000440239 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.49■■■■□ 3.43
CHTF18-204ENST00000440239 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.49■■■■□ 3.43
CHTF18-204ENST00000440239 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.48■■■■□ 3.43
CHTF18-204ENST00000440239 DIP2BQ9P265 1576 aa36.47■■■■□ 3.43
CHTF18-204ENST00000440239 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.46■■■■□ 3.43
CHTF18-204ENST00000440239 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
CHTF18-204ENST00000440239 GLI2P10070 1586 aa36.3■■■■□ 3.4
CHTF18-204ENST00000440239 TSPOAP1O95153 1857 aa36.29■■■■□ 3.4
CHTF18-204ENST00000440239 APLP2Q06481 763 aa36.28■■■■□ 3.4
CHTF18-204ENST00000440239 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CHTF18-204ENST00000440239 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.27■■■■□ 3.4
CHTF18-204ENST00000440239 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.25■■■■□ 3.39
CHTF18-204ENST00000440239 TIAM1Q13009 1591 aa36.24■■■■□ 3.39
CHTF18-204ENST00000440239 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.23■■■■□ 3.39
CHTF18-204ENST00000440239 KIF14Q15058 1648 aa36.2■■■■□ 3.39
CHTF18-204ENST00000440239 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.2■■■■□ 3.39
CHTF18-204ENST00000440239 CD109Q6YHK3 1445 aa36.18■■■■□ 3.38
CHTF18-204ENST00000440239 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.17■■■■□ 3.38
CHTF18-204ENST00000440239 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.16■■■■□ 3.386e-8■■■□□ 19.1
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CHTF18-204ENST00000440239 MAP3K1Q13233 1512 aa36.1■■■■□ 3.37
CHTF18-204ENST00000440239 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CHTF18-204ENST00000440239 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.08■■■■□ 3.37
CHTF18-204ENST00000440239 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
CHTF18-204ENST00000440239 TEX14Q8IWB6 1497 aa36■■■■□ 3.35
CHTF18-204ENST00000440239 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.99■■■■□ 3.35
CHTF18-204ENST00000440239 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
CHTF18-204ENST00000440239 PLCH2O75038 1416 aa35.93■■■■□ 3.34
CHTF18-204ENST00000440239 NCOA2Q15596 1464 aa35.93■■■■□ 3.34
CHTF18-204ENST00000440239 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
CHTF18-204ENST00000440239 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.92■■■■□ 3.34
CHTF18-204ENST00000440239 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.9■■■■□ 3.34
CHTF18-204ENST00000440239 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.9■■■■□ 3.34
CHTF18-204ENST00000440239 FANCAO15360 1455 aa35.89■■■■□ 3.34
CHTF18-204ENST00000440239 PREX2Q70Z35 1606 aa35.87■■■■□ 3.33
CHTF18-204ENST00000440239 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.86■■■■□ 3.33
CHTF18-204ENST00000440239 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
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