RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440239.5

CHTF18-204, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CHTF18, Length 1,801 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-204ENST00000440239 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.94■■■■■ 6.39
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CHTF18-204ENST00000440239 ABCC9O60706 1549 aa47.26■■■■■ 5.16
CHTF18-204ENST00000440239 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.99■■■■■ 4.95
CHTF18-204ENST00000440239 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
CHTF18-204ENST00000440239 NACADO15069 1562 aa45.58■■■■■ 4.89
CHTF18-204ENST00000440239 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.56■■■■■ 4.88
CHTF18-204ENST00000440239 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.37■■■■■ 4.85
CHTF18-204ENST00000440239 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.35■■■■■ 4.85
CHTF18-204ENST00000440239 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.58■■■■■ 4.73
CHTF18-204ENST00000440239 SCRIBQ14160 1630 aa44.54■■■■■ 4.72
CHTF18-204ENST00000440239 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.29■■■■■ 4.681e-6■■■■■ 32.8
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CHTF18-204ENST00000440239 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.93■■■■■ 4.62
CHTF18-204ENST00000440239 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
CHTF18-204ENST00000440239 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.9■■■■■ 4.46
CHTF18-204ENST00000440239 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.81■■■■■ 4.44
CHTF18-204ENST00000440239 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.71■■■■■ 4.43
CHTF18-204ENST00000440239 SMARCA4P51532 1647 aa42.56■■■■■ 4.4
CHTF18-204ENST00000440239 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
CHTF18-204ENST00000440239 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.4■■■■■ 4.38
CHTF18-204ENST00000440239 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.18■■■■■ 4.34
CHTF18-204ENST00000440239 SMARCA2P51531 1590 aa42.15■■■■■ 4.34
CHTF18-204ENST00000440239 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
CHTF18-204ENST00000440239 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.03■■■■■ 4.32
CHTF18-204ENST00000440239 NCAPD3P42695 1498 aa42.03■■■■■ 4.32
CHTF18-204ENST00000440239 WIZO95785 1651 aa42.01■■■■■ 4.32
CHTF18-204ENST00000440239 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
CHTF18-204ENST00000440239 HMGXB3Q12766 1538 aa41.88■■■■■ 4.29
CHTF18-204ENST00000440239 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
CHTF18-204ENST00000440239 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
CHTF18-204ENST00000440239 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.07■■■■■ 4.16
CHTF18-204ENST00000440239 NESP48681 1621 aa41.02■■■■■ 4.16
CHTF18-204ENST00000440239 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.9■■■■■ 4.14
CHTF18-204ENST00000440239 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.89■■■■■ 4.14
CHTF18-204ENST00000440239 CFTRP13569 1480 aa40.73■■■■■ 4.11
CHTF18-204ENST00000440239 ERCC6Q03468 1493 aa40.71■■■■■ 4.11
CHTF18-204ENST00000440239 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.62■■■■■ 4.09
CHTF18-204ENST00000440239 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.54■■■■■ 4.08
CHTF18-204ENST00000440239 PRDM2Q13029 1718 aa40.49■■■■■ 4.07
CHTF18-204ENST00000440239 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.46■■■■■ 4.07
CHTF18-204ENST00000440239 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.37■■■■■ 4.05
CHTF18-204ENST00000440239 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CHTF18-204ENST00000440239 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.18■■■■■ 4.02
CHTF18-204ENST00000440239 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CHTF18-204ENST00000440239 WDR62O43379 1518 aa40.01■■■■□ 3.99
CHTF18-204ENST00000440239 CUX2O14529 1486 aa39.95■■■■□ 3.99
CHTF18-204ENST00000440239 TOPBP1Q92547 1522 aa39.86■■■■□ 3.97
CHTF18-204ENST00000440239 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.84■■■■□ 3.97
CHTF18-204ENST00000440239 ABCC8Q09428 1581 aa39.82■■■■□ 3.96
CHTF18-204ENST00000440239 CUX1P39880 1505 aa39.74■■■■□ 3.95
CHTF18-204ENST00000440239 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.68■■■■□ 3.94
CHTF18-204ENST00000440239 SYNJ1O43426 1573 aa39.57■■■■□ 3.92
CHTF18-204ENST00000440239 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
CHTF18-204ENST00000440239 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.56■■■■□ 3.92
CHTF18-204ENST00000440239 TOP2BQ02880 1626 aa39.51■■■■□ 3.91
CHTF18-204ENST00000440239 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.48■■■■□ 3.91
CHTF18-204ENST00000440239 IFT140Q96RY7 1462 aa39.46■■■■□ 3.91
CHTF18-204ENST00000440239 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.43■■■■□ 3.9
CHTF18-204ENST00000440239 SOGA1O94964 1423 aa39.42■■■■□ 3.9
CHTF18-204ENST00000440239 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
CHTF18-204ENST00000440239 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
CHTF18-204ENST00000440239 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
CHTF18-204ENST00000440239 TRIM41Q8WV44 630 aa39.18■■■■□ 3.86
CHTF18-204ENST00000440239 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.17■■■■□ 3.864e-7■■■■■ 37
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CHTF18-204ENST00000440239 WDR97A6NE52 1622 aa39.15■■■■□ 3.86
CHTF18-204ENST00000440239 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.13■■■■□ 3.85
CHTF18-204ENST00000440239 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.97■■■■□ 3.83
CHTF18-204ENST00000440239 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.96■■■■□ 3.83
CHTF18-204ENST00000440239 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.94■■■■□ 3.82
CHTF18-204ENST00000440239 PBRM1Q86U86 1689 aa38.88■■■■□ 3.81
CHTF18-204ENST00000440239 GRIN2BQ13224 1484 aa38.87■■■■□ 3.81
CHTF18-204ENST00000440239 KIF27Q86VH2 1401 aa38.81■■■■□ 3.8
CHTF18-204ENST00000440239 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.8■■■■□ 3.8
CHTF18-204ENST00000440239 FBLN2P98095 1184 aa38.73■■■■□ 3.79
CHTF18-204ENST00000440239 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
CHTF18-204ENST00000440239 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.67■■■■□ 3.78
CHTF18-204ENST00000440239 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.66■■■■□ 3.78
CHTF18-204ENST00000440239 CHD1O14646 1710 aa38.61■■■■□ 3.77
CHTF18-204ENST00000440239 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
CHTF18-204ENST00000440239 IGF1RP08069 1367 aa38.56■■■■□ 3.76
CHTF18-204ENST00000440239 SYNJ2O15056 1496 aa38.56■■■■□ 3.76
CHTF18-204ENST00000440239 ADAMTS12P58397 1594 aa38.55■■■■□ 3.76
CHTF18-204ENST00000440239 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.51■■■■□ 3.75
CHTF18-204ENST00000440239 OSCARQ8IYS5 282 aa38.49■■■■□ 3.75
CHTF18-204ENST00000440239 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
CHTF18-204ENST00000440239 CUL7Q14999 1698 aa38.44■■■■□ 3.74
CHTF18-204ENST00000440239 GRIN2AQ12879 1464 aa38.38■■■■□ 3.74
CHTF18-204ENST00000440239 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.38■■■■□ 3.74
CHTF18-204ENST00000440239 EEA1Q15075 1411 aa38.32■■■■□ 3.72
CHTF18-204ENST00000440239 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.3■■■■□ 3.72
CHTF18-204ENST00000440239 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.22■■■■□ 3.71
CHTF18-204ENST00000440239 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.2■■■■□ 3.71
CHTF18-204ENST00000440239 CEP170Q5SW79 1584 aa38.19■■■■□ 3.7
CHTF18-204ENST00000440239 NUP160Q12769 1436 aa38.14■■■■□ 3.7
CHTF18-204ENST00000440239 PRXQ9BXM0 1461 aa38.13■■■■□ 3.69
CHTF18-204ENST00000440239 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.1■■■■□ 3.69
CHTF18-204ENST00000440239 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.04■■■■□ 3.68
CHTF18-204ENST00000440239 KIF21BO75037 1637 aa37.92■■■■□ 3.66
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