RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 ARAP1Q96P48 1450 aa19.48■□□□□ 0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 CFTRP13569 1480 aa19.47■□□□□ 0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.47■□□□□ 0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.45■□□□□ 0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.45■□□□□ 0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.44■□□□□ 0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 TOP2BQ02880 1626 aa19.43■□□□□ 0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 BCANQ96GW7 911 aa19.39■□□□□ 0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 PRXQ9BXM0 1461 aa19.36■□□□□ 0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-210ENST00000437078 HMGXB3Q12766 1538 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXD1Q16676 465 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-210ENST00000437078 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-210ENST00000437078 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.27■□□□□ 0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.25■□□□□ 0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNH8Q96L42 1107 aa19.24■□□□□ 0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 TONSLQ96HA7 1378 aa19.23■□□□□ 0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.22■□□□□ 0.672e-7■■■□□ 15.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.2■□□□□ 0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.19■□□□□ 0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 ERCC6Q03468 1493 aa19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 BCL11AQ9H165 835 aa19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TOPBP1Q92547 1522 aa19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.14■□□□□ 0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.13■□□□□ 0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 ANP32CO43423 234 aa19.12■□□□□ 0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.1■□□□□ 0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.07■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 16.6
RABGEF1-210ENST00000437078 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 NEFLP07196 543 aa19.05■□□□□ 0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 FMN1Q68DA7 1419 aa19■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 FKBP8Q14318 412 aa18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1-210ENST00000437078 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1-210ENST00000437078 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
RABGEF1-210ENST00000437078 RGL3Q3MIN7 710 aa18.92■□□□□ 0.62
RABGEF1-210ENST00000437078 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1-210ENST00000437078 TIAM1Q13009 1591 aa18.9■□□□□ 0.62
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.89■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 JPH4Q96JJ6 628 aa18.89■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.88■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.87■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPY4P0CV99 314 aa18.86■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPY10P0CW01 314 aa18.86■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.84■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.84■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.64e-6■■■□□ 18.3
RABGEF1-210ENST00000437078 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 NCOA2Q15596 1464 aa18.82■□□□□ 0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.81■□□□□ 0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 PKD2Q13563 968 aa18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 MRS2Q9HD23 443 aa18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.75■□□□□ 0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 PRDM2Q13029 1718 aa18.75■□□□□ 0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPRKQ15262 1439 aa18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR97A6NE52 1622 aa18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 GRIN2BQ13224 1484 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 NUP155O75694 1391 aa18.63■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 MAPKBP1O60336 1514 aa18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 NAIPQ13075 1403 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms