RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436744.2

NICN1-204, Transcript of nicolin 1, humanhuman

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Gene NICN1, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-204ENST00000436744 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.57■■■□□ 2.48
NICN1-204ENST00000436744 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.41■■■□□ 2.46
NICN1-204ENST00000436744 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.4■■■□□ 2.46
NICN1-204ENST00000436744 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.38■■■□□ 2.45
NICN1-204ENST00000436744 MAPKBP1O60336 1514 aa30.33■■■□□ 2.45
NICN1-204ENST00000436744 IGF1RP08069 1367 aa30.33■■■□□ 2.45
NICN1-204ENST00000436744 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.33■■■□□ 2.45
NICN1-204ENST00000436744 DIP2BQ9P265 1576 aa30.32■■■□□ 2.45
NICN1-204ENST00000436744 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.31■■■□□ 2.44
NICN1-204ENST00000436744 KIF27Q86VH2 1401 aa30.28■■■□□ 2.44
NICN1-204ENST00000436744 CUL7Q14999 1698 aa30.26■■■□□ 2.43
NICN1-204ENST00000436744 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
NICN1-204ENST00000436744 TSPOAP1O95153 1857 aa30.2■■■□□ 2.42
NICN1-204ENST00000436744 KDM6BO15054 1643 aa30.14■■■□□ 2.42
NICN1-204ENST00000436744 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.13■■■□□ 2.41
NICN1-204ENST00000436744 PTPRGP23470 1445 aa30.12■■■□□ 2.41
NICN1-204ENST00000436744 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.03■■■□□ 2.4
NICN1-204ENST00000436744 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.03■■■□□ 2.4
NICN1-204ENST00000436744 IQGAP2Q13576 1575 aa30■■■□□ 2.39
NICN1-204ENST00000436744 ABCC2Q92887 1545 aa30■■■□□ 2.39
NICN1-204ENST00000436744 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.99■■■□□ 2.39
NICN1-204ENST00000436744 ASXL2Q76L83 1435 aa29.96■■■□□ 2.39
NICN1-204ENST00000436744 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
NICN1-204ENST00000436744 DISP1Q96F81 1524 aa29.92■■■□□ 2.38
NICN1-204ENST00000436744 UACAQ9BZF9 1416 aa29.88■■■□□ 2.37
NICN1-204ENST00000436744 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.87■■■□□ 2.37
NICN1-204ENST00000436744 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.87■■■□□ 2.37
NICN1-204ENST00000436744 GLI2P10070 1586 aa29.86■■■□□ 2.37
NICN1-204ENST00000436744 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.8■■■□□ 2.36
NICN1-204ENST00000436744 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.78■■■□□ 2.36
NICN1-204ENST00000436744 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
NICN1-204ENST00000436744 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
NICN1-204ENST00000436744 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
NICN1-204ENST00000436744 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.76■■■□□ 2.36
NICN1-204ENST00000436744 KIAA0556O60303 1618 aa29.76■■■□□ 2.35
NICN1-204ENST00000436744 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.73■■■□□ 2.35
NICN1-204ENST00000436744 ADGRL1O94910 1474 aa29.7■■■□□ 2.35
NICN1-204ENST00000436744 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.61■■■□□ 2.33
NICN1-204ENST00000436744 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.6■■■□□ 2.33
NICN1-204ENST00000436744 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.6■■■□□ 2.33
NICN1-204ENST00000436744 KCNH8Q96L42 1107 aa29.5■■■□□ 2.31
NICN1-204ENST00000436744 ABCA8O94911 1581 aa29.5■■■□□ 2.31
NICN1-204ENST00000436744 GOLGA3Q08378 1498 aa29.47■■■□□ 2.31
NICN1-204ENST00000436744 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
NICN1-204ENST00000436744 CD109Q6YHK3 1445 aa29.45■■■□□ 2.3
NICN1-204ENST00000436744 ARID3CA6NKF2 412 aa29.43■■■□□ 2.3
NICN1-204ENST00000436744 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.42■■■□□ 2.3
NICN1-204ENST00000436744 PRXQ9BXM0 1461 aa29.42■■■□□ 2.3
NICN1-204ENST00000436744 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.41■■■□□ 2.3
NICN1-204ENST00000436744 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.4■■■□□ 2.3
NICN1-204ENST00000436744 P3H3Q8IVL6 736 aa29.36■■■□□ 2.29
NICN1-204ENST00000436744 KIF21BO75037 1637 aa29.31■■■□□ 2.28
NICN1-204ENST00000436744 ATP10BO94823 1461 aa29.26■■■□□ 2.27
NICN1-204ENST00000436744 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.18■■■□□ 2.26
NICN1-204ENST00000436744 SAMD9Q5K651 1589 aa29.16■■■□□ 2.26
NICN1-204ENST00000436744 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.15■■■□□ 2.26
NICN1-204ENST00000436744 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.12■■■□□ 2.25
NICN1-204ENST00000436744 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
NICN1-204ENST00000436744 RAPGEF3O95398 923 aa29.11■■■□□ 2.25
NICN1-204ENST00000436744 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
NICN1-204ENST00000436744 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
NICN1-204ENST00000436744 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
NICN1-204ENST00000436744 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.09■■■□□ 2.25
NICN1-204ENST00000436744 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NICN1-204ENST00000436744 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.03■■■□□ 2.24
NICN1-204ENST00000436744 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.03■■■□□ 2.24
NICN1-204ENST00000436744 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.02■■■□□ 2.24
NICN1-204ENST00000436744 PTPRMP28827 1452 aa29■■■□□ 2.23
NICN1-204ENST00000436744 NEO1Q92859 1461 aa29■■■□□ 2.23
NICN1-204ENST00000436744 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.99■■■□□ 2.23
NICN1-204ENST00000436744 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
NICN1-204ENST00000436744 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.92■■■□□ 2.22
NICN1-204ENST00000436744 MADDQ8WXG6 1647 aa28.92■■■□□ 2.22
NICN1-204ENST00000436744 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.84■■■□□ 2.21
NICN1-204ENST00000436744 RICTORQ6R327 1708 aa28.84■■■□□ 2.21
NICN1-204ENST00000436744 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.84■■■□□ 2.21
NICN1-204ENST00000436744 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
NICN1-204ENST00000436744 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
NICN1-204ENST00000436744 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.83■■■□□ 2.21
NICN1-204ENST00000436744 EEA1Q15075 1411 aa28.82■■■□□ 2.2
NICN1-204ENST00000436744 AKNAQ7Z591 1439 aa28.82■■■□□ 2.2
NICN1-204ENST00000436744 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
NICN1-204ENST00000436744 FANCAO15360 1455 aa28.81■■■□□ 2.2
NICN1-204ENST00000436744 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
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NICN1-204ENST00000436744 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
NICN1-204ENST00000436744 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.78■■■□□ 2.2
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NICN1-204ENST00000436744 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.74■■■□□ 2.19
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NICN1-204ENST00000436744 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.74■■■□□ 2.19
NICN1-204ENST00000436744 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.69■■■□□ 2.18
NICN1-204ENST00000436744 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.69■■■□□ 2.18
NICN1-204ENST00000436744 HSPA2P54652 639 aa28.68■■■□□ 2.18
NICN1-204ENST00000436744 MLECQ14165 292 aa28.66■■■□□ 2.18
NICN1-204ENST00000436744 HECW1Q76N89 1606 aa28.65■■■□□ 2.18
NICN1-204ENST00000436744 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
NICN1-204ENST00000436744 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.61■■■□□ 2.17
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