RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428426.2

AC002511.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC002511.1, Length 1,000 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC002511.1-201ENST00000428426 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.01■□□□□ 0.63
AC002511.1-201ENST00000428426 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19■□□□□ 0.63
AC002511.1-201ENST00000428426 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.63
AC002511.1-201ENST00000428426 IGF1RP08069 1367 aa18.94■□□□□ 0.62
AC002511.1-201ENST00000428426 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.93■□□□□ 0.62
AC002511.1-201ENST00000428426 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.93■□□□□ 0.62
AC002511.1-201ENST00000428426 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
AC002511.1-201ENST00000428426 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.89■□□□□ 0.61
AC002511.1-201ENST00000428426 TSPOAP1O95153 1857 aa18.88■□□□□ 0.61
AC002511.1-201ENST00000428426 DIP2BQ9P265 1576 aa18.88■□□□□ 0.61
AC002511.1-201ENST00000428426 MAPKBP1O60336 1514 aa18.87■□□□□ 0.61
AC002511.1-201ENST00000428426 KIF27Q86VH2 1401 aa18.85■□□□□ 0.61
AC002511.1-201ENST00000428426 CUL7Q14999 1698 aa18.82■□□□□ 0.6
AC002511.1-201ENST00000428426 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.81■□□□□ 0.6
AC002511.1-201ENST00000428426 PTPRGP23470 1445 aa18.79■□□□□ 0.6
AC002511.1-201ENST00000428426 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa18.78■□□□□ 0.6
AC002511.1-201ENST00000428426 KDM6BO15054 1643 aa18.78■□□□□ 0.6
AC002511.1-201ENST00000428426 TNIKQ9UKE5 1360 aa18.72■□□□□ 0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.69■□□□□ 0.58
AC002511.1-201ENST00000428426 ASXL2Q76L83 1435 aa18.68■□□□□ 0.58
AC002511.1-201ENST00000428426 ABCC2Q92887 1545 aa18.68■□□□□ 0.58
AC002511.1-201ENST00000428426 IQGAP2Q13576 1575 aa18.68■□□□□ 0.58
AC002511.1-201ENST00000428426 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
AC002511.1-201ENST00000428426 DISP1Q96F81 1524 aa18.64■□□□□ 0.58
AC002511.1-201ENST00000428426 UACAQ9BZF9 1416 aa18.63■□□□□ 0.57
AC002511.1-201ENST00000428426 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.62■□□□□ 0.57
AC002511.1-201ENST00000428426 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.6■□□□□ 0.57
AC002511.1-201ENST00000428426 GLI2P10070 1586 aa18.59■□□□□ 0.57
AC002511.1-201ENST00000428426 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
AC002511.1-201ENST00000428426 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.57■□□□□ 0.56
AC002511.1-201ENST00000428426 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
AC002511.1-201ENST00000428426 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.54■□□□□ 0.56
AC002511.1-201ENST00000428426 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.54■□□□□ 0.56
AC002511.1-201ENST00000428426 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
AC002511.1-201ENST00000428426 KIAA0556O60303 1618 aa18.52■□□□□ 0.55
AC002511.1-201ENST00000428426 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa18.52■□□□□ 0.55
AC002511.1-201ENST00000428426 ADGRL1O94910 1474 aa18.5■□□□□ 0.55
AC002511.1-201ENST00000428426 KCNH8Q96L42 1107 aa18.47■□□□□ 0.55
AC002511.1-201ENST00000428426 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
AC002511.1-201ENST00000428426 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.43■□□□□ 0.54
AC002511.1-201ENST00000428426 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.43■□□□□ 0.54
AC002511.1-201ENST00000428426 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.42■□□□□ 0.54
AC002511.1-201ENST00000428426 ARID3CA6NKF2 412 aa18.39■□□□□ 0.53
AC002511.1-201ENST00000428426 P3H3Q8IVL6 736 aa18.38■□□□□ 0.53
AC002511.1-201ENST00000428426 CD109Q6YHK3 1445 aa18.38■□□□□ 0.53
AC002511.1-201ENST00000428426 ABCA8O94911 1581 aa18.38■□□□□ 0.53
AC002511.1-201ENST00000428426 GOLGA3Q08378 1498 aa18.34■□□□□ 0.53
AC002511.1-201ENST00000428426 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.33■□□□□ 0.52
AC002511.1-201ENST00000428426 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.32■□□□□ 0.52
AC002511.1-201ENST00000428426 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.32■□□□□ 0.52
AC002511.1-201ENST00000428426 PRXQ9BXM0 1461 aa18.32■□□□□ 0.52
AC002511.1-201ENST00000428426 ATP10BO94823 1461 aa18.26■□□□□ 0.51
AC002511.1-201ENST00000428426 KIF21BO75037 1637 aa18.26■□□□□ 0.51
AC002511.1-201ENST00000428426 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
AC002511.1-201ENST00000428426 RAPGEF3O95398 923 aa18.2■□□□□ 0.5
AC002511.1-201ENST00000428426 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
AC002511.1-201ENST00000428426 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
AC002511.1-201ENST00000428426 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.18■□□□□ 0.5
AC002511.1-201ENST00000428426 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
AC002511.1-201ENST00000428426 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.18■□□□□ 0.5
AC002511.1-201ENST00000428426 ABCA9Q8IUA7 1624 aa18.15■□□□□ 0.5
AC002511.1-201ENST00000428426 SAMD9Q5K651 1589 aa18.13■□□□□ 0.49
AC002511.1-201ENST00000428426 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.13■□□□□ 0.49
AC002511.1-201ENST00000428426 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.09■□□□□ 0.49
AC002511.1-201ENST00000428426 PTPRMP28827 1452 aa18.08■□□□□ 0.49
AC002511.1-201ENST00000428426 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.08■□□□□ 0.49
AC002511.1-201ENST00000428426 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
AC002511.1-201ENST00000428426 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.07■□□□□ 0.48
AC002511.1-201ENST00000428426 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
AC002511.1-201ENST00000428426 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.06■□□□□ 0.48
AC002511.1-201ENST00000428426 NEO1Q92859 1461 aa18.05■□□□□ 0.48
AC002511.1-201ENST00000428426 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.03■□□□□ 0.48
AC002511.1-201ENST00000428426 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.03■□□□□ 0.48
AC002511.1-201ENST00000428426 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.01■□□□□ 0.47
AC002511.1-201ENST00000428426 MADDQ8WXG6 1647 aa18.01■□□□□ 0.47
AC002511.1-201ENST00000428426 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18■□□□□ 0.47
AC002511.1-201ENST00000428426 AKNAQ7Z591 1439 aa17.98■□□□□ 0.47
AC002511.1-201ENST00000428426 RICTORQ6R327 1708 aa17.98■□□□□ 0.47
AC002511.1-201ENST00000428426 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
AC002511.1-201ENST00000428426 FBXO41Q8TF61 875 aa17.97■□□□□ 0.47
AC002511.1-201ENST00000428426 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
AC002511.1-201ENST00000428426 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
AC002511.1-201ENST00000428426 FANCAO15360 1455 aa17.95■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.94■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa17.94■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 EEA1Q15075 1411 aa17.93■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 HSPA2P54652 639 aa17.93■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 LMTK3Q96Q04 1460 aa17.93■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.93■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.92■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 MLECQ14165 292 aa17.92■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
AC002511.1-201ENST00000428426 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.87■□□□□ 0.45
AC002511.1-201ENST00000428426 HECW1Q76N89 1606 aa17.87■□□□□ 0.45
AC002511.1-201ENST00000428426 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.86■□□□□ 0.45
AC002511.1-201ENST00000428426 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.86■□□□□ 0.45
AC002511.1-201ENST00000428426 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.86■□□□□ 0.45
AC002511.1-201ENST00000428426 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms