RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 NUP160Q12769 1436 aa33.62■■■□□ 2.97
HOXA4-202ENST00000428284 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
HOXA4-202ENST00000428284 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXA4-202ENST00000428284 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.49■■■□□ 2.95
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.49■■■□□ 2.95
HOXA4-202ENST00000428284 IQGAP2Q13576 1575 aa33.48■■■□□ 2.95
HOXA4-202ENST00000428284 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.38■■■□□ 2.93
HOXA4-202ENST00000428284 SHROOM2Q13796 1616 aa33.33■■■□□ 2.93
HOXA4-202ENST00000428284 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
HOXA4-202ENST00000428284 JPH4Q96JJ6 628 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXA4-202ENST00000428284 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXA4-202ENST00000428284 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXA4-202ENST00000428284 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXA4-202ENST00000428284 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF11O15085 1522 aa33.21■■■□□ 2.91
HOXA4-202ENST00000428284 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
HOXA4-202ENST00000428284 SAMD9Q5K651 1589 aa33.17■■■□□ 2.9
HOXA4-202ENST00000428284 CEP162Q5TB80 1403 aa33.17■■■□□ 2.9
HOXA4-202ENST00000428284 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.15■■■□□ 2.9
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA0556O60303 1618 aa33.15■■■□□ 2.9
HOXA4-202ENST00000428284 DISP1Q96F81 1524 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXA4-202ENST00000428284 CLIP1P30622 1438 aa33.13■■■□□ 2.89
HOXA4-202ENST00000428284 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.13■■■□□ 2.89
HOXA4-202ENST00000428284 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.12■■■□□ 2.89
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.08■■■□□ 2.89
HOXA4-202ENST00000428284 P3H3Q8IVL6 736 aa33.04■■■□□ 2.88
HOXA4-202ENST00000428284 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33■■■□□ 2.87
HOXA4-202ENST00000428284 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.98■■■□□ 2.87
HOXA4-202ENST00000428284 ARAP1Q96P48 1450 aa32.95■■■□□ 2.87
HOXA4-202ENST00000428284 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
HOXA4-202ENST00000428284 PTPRGP23470 1445 aa32.87■■■□□ 2.85
HOXA4-202ENST00000428284 FMN1Q68DA7 1419 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXA4-202ENST00000428284 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXA4-202ENST00000428284 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXA4-202ENST00000428284 ABCA8O94911 1581 aa32.71■■■□□ 2.83
HOXA4-202ENST00000428284 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
HOXA4-202ENST00000428284 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXA4-202ENST00000428284 UACAQ9BZF9 1416 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC2Q92887 1545 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXA4-202ENST00000428284 HECW1Q76N89 1606 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXA4-202ENST00000428284 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXA4-202ENST00000428284 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXA4-202ENST00000428284 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXA4-202ENST00000428284 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
HOXA4-202ENST00000428284 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXA4-202ENST00000428284 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXA4-202ENST00000428284 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
HOXA4-202ENST00000428284 ARID3CA6NKF2 412 aa32.5■■■□□ 2.79
HOXA4-202ENST00000428284 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
HOXA4-202ENST00000428284 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
HOXA4-202ENST00000428284 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.78
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.44■■■□□ 2.78
HOXA4-202ENST00000428284 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.44■■■□□ 2.78
HOXA4-202ENST00000428284 ATP10BO94823 1461 aa32.41■■■□□ 2.78
HOXA4-202ENST00000428284 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.41■■■□□ 2.78
HOXA4-202ENST00000428284 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
HOXA4-202ENST00000428284 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
HOXA4-202ENST00000428284 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.39■■■□□ 2.78
HOXA4-202ENST00000428284 TIAM1Q13009 1591 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXA4-202ENST00000428284 APLP2Q06481 763 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXA4-202ENST00000428284 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.77
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K1Q13233 1512 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXA4-202ENST00000428284 MAPKBP1O60336 1514 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXA4-202ENST00000428284 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
HOXA4-202ENST00000428284 ASXL2Q76L83 1435 aa32.22■■■□□ 2.75
HOXA4-202ENST00000428284 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXA4-202ENST00000428284 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.18■■■□□ 2.74
HOXA4-202ENST00000428284 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.18■■■□□ 2.74
HOXA4-202ENST00000428284 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXA4-202ENST00000428284 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
HOXA4-202ENST00000428284 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
HOXA4-202ENST00000428284 KIF14Q15058 1648 aa32.09■■■□□ 2.73
HOXA4-202ENST00000428284 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
HOXA4-202ENST00000428284 KCNH8Q96L42 1107 aa32.07■■■□□ 2.72
HOXA4-202ENST00000428284 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
HOXA4-202ENST00000428284 DIP2BQ9P265 1576 aa32.01■■■□□ 2.71
HOXA4-202ENST00000428284 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.98■■■□□ 2.71
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.98■■■□□ 2.71
HOXA4-202ENST00000428284 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.97■■■□□ 2.71
HOXA4-202ENST00000428284 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.97■■■□□ 2.71
HOXA4-202ENST00000428284 NCOA2Q15596 1464 aa31.96■■■□□ 2.71
HOXA4-202ENST00000428284 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.96■■■□□ 2.71
HOXA4-202ENST00000428284 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.94■■■□□ 2.7
HOXA4-202ENST00000428284 GLI2P10070 1586 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXA4-202ENST00000428284 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.91■■■□□ 2.7
HOXA4-202ENST00000428284 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.89■■■□□ 2.7
HOXA4-202ENST00000428284 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.87■■■□□ 2.69
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.87■■■□□ 2.69
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HOXA4-202ENST00000428284 TSPOAP1O95153 1857 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXA4-202ENST00000428284 PREX2Q70Z35 1606 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXA4-202ENST00000428284 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.81■■■□□ 2.68
HOXA4-202ENST00000428284 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXA4-202ENST00000428284 CD109Q6YHK3 1445 aa31.79■■■□□ 2.68
HOXA4-202ENST00000428284 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
HOXA4-202ENST00000428284 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.74■■■□□ 2.67
HOXA4-202ENST00000428284 PLCH2O75038 1416 aa31.73■■■□□ 2.67
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