RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 GOLGA3Q08378 1498 aa33.57■■■□□ 2.96
TSTA3-201ENST00000425753 SHROOM2Q13796 1616 aa33.53■■■□□ 2.96
TSTA3-201ENST00000425753 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.5■■■□□ 2.95
TSTA3-201ENST00000425753 IQGAP2Q13576 1575 aa33.49■■■□□ 2.95
TSTA3-201ENST00000425753 JPH4Q96JJ6 628 aa33.42■■■□□ 2.94
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGEF11O15085 1522 aa33.38■■■□□ 2.93
TSTA3-201ENST00000425753 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.38■■■□□ 2.93
TSTA3-201ENST00000425753 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
TSTA3-201ENST00000425753 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
TSTA3-201ENST00000425753 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.29■■■□□ 2.92
TSTA3-201ENST00000425753 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.29■■■□□ 2.92
TSTA3-201ENST00000425753 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.29■■■□□ 2.92
TSTA3-201ENST00000425753 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.28■■■□□ 2.92
TSTA3-201ENST00000425753 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.25■■■□□ 2.91
TSTA3-201ENST00000425753 DISP1Q96F81 1524 aa33.25■■■□□ 2.91
TSTA3-201ENST00000425753 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.24■■■□□ 2.91
TSTA3-201ENST00000425753 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.21■■■□□ 2.91
TSTA3-201ENST00000425753 KIAA0556O60303 1618 aa33.18■■■□□ 2.9
TSTA3-201ENST00000425753 SAMD9Q5K651 1589 aa33.17■■■□□ 2.9
TSTA3-201ENST00000425753 ARAP1Q96P48 1450 aa33.16■■■□□ 2.9
TSTA3-201ENST00000425753 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.12■■■□□ 2.89
TSTA3-201ENST00000425753 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.09■■■□□ 2.89
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.01■■■□□ 2.87
TSTA3-201ENST00000425753 PTPRGP23470 1445 aa32.99■■■□□ 2.87
TSTA3-201ENST00000425753 CLIP1P30622 1438 aa32.95■■■□□ 2.86
TSTA3-201ENST00000425753 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.86
TSTA3-201ENST00000425753 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.94■■■□□ 2.86
TSTA3-201ENST00000425753 CEP162Q5TB80 1403 aa32.93■■■□□ 2.86
TSTA3-201ENST00000425753 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.92■■■□□ 2.86
TSTA3-201ENST00000425753 P3H3Q8IVL6 736 aa32.89■■■□□ 2.86
TSTA3-201ENST00000425753 UACAQ9BZF9 1416 aa32.82■■■□□ 2.84
TSTA3-201ENST00000425753 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.82■■■□□ 2.84
TSTA3-201ENST00000425753 ABCA8O94911 1581 aa32.8■■■□□ 2.84
TSTA3-201ENST00000425753 FMN1Q68DA7 1419 aa32.78■■■□□ 2.84
TSTA3-201ENST00000425753 ABCC2Q92887 1545 aa32.78■■■□□ 2.84
TSTA3-201ENST00000425753 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.78■■■□□ 2.84
TSTA3-201ENST00000425753 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
TSTA3-201ENST00000425753 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.77■■■□□ 2.84
TSTA3-201ENST00000425753 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.69■■■□□ 2.82
TSTA3-201ENST00000425753 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.65■■■□□ 2.82
TSTA3-201ENST00000425753 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
TSTA3-201ENST00000425753 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.59■■■□□ 2.81
TSTA3-201ENST00000425753 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
TSTA3-201ENST00000425753 HECW1Q76N89 1606 aa32.55■■■□□ 2.8
TSTA3-201ENST00000425753 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.55■■■□□ 2.8
TSTA3-201ENST00000425753 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.53■■■□□ 2.8
TSTA3-201ENST00000425753 MAPKBP1O60336 1514 aa32.52■■■□□ 2.8
TSTA3-201ENST00000425753 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
TSTA3-201ENST00000425753 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.51■■■□□ 2.79
TSTA3-201ENST00000425753 ATP10BO94823 1461 aa32.5■■■□□ 2.79
TSTA3-201ENST00000425753 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.41■■■□□ 2.78
TSTA3-201ENST00000425753 ASXL2Q76L83 1435 aa32.39■■■□□ 2.78
TSTA3-201ENST00000425753 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
TSTA3-201ENST00000425753 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.38■■■□□ 2.77
TSTA3-201ENST00000425753 ARID3CA6NKF2 412 aa32.34■■■□□ 2.77
TSTA3-201ENST00000425753 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.33■■■□□ 2.77
TSTA3-201ENST00000425753 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
TSTA3-201ENST00000425753 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.28■■■□□ 2.76
TSTA3-201ENST00000425753 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
TSTA3-201ENST00000425753 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
TSTA3-201ENST00000425753 MAP3K1Q13233 1512 aa32.24■■■□□ 2.75
TSTA3-201ENST00000425753 DIP2BQ9P265 1576 aa32.23■■■□□ 2.75
TSTA3-201ENST00000425753 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
TSTA3-201ENST00000425753 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.21■■■□□ 2.75
TSTA3-201ENST00000425753 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.2■■■□□ 2.75
TSTA3-201ENST00000425753 TIAM1Q13009 1591 aa32.2■■■□□ 2.74
TSTA3-201ENST00000425753 GLI2P10070 1586 aa32.19■■■□□ 2.74
TSTA3-201ENST00000425753 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
TSTA3-201ENST00000425753 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.17■■■□□ 2.74
TSTA3-201ENST00000425753 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.13■■■□□ 2.73
TSTA3-201ENST00000425753 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.08■■■□□ 2.73
TSTA3-201ENST00000425753 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.07■■■□□ 2.73
TSTA3-201ENST00000425753 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.06■■■□□ 2.72
TSTA3-201ENST00000425753 KCNH8Q96L42 1107 aa32.06■■■□□ 2.72
TSTA3-201ENST00000425753 KIF14Q15058 1648 aa32.05■■■□□ 2.72
TSTA3-201ENST00000425753 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.05■■■□□ 2.72
TSTA3-201ENST00000425753 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.05■■■□□ 2.72
TSTA3-201ENST00000425753 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.03■■■□□ 2.72
TSTA3-201ENST00000425753 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
TSTA3-201ENST00000425753 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.02■■■□□ 2.72
TSTA3-201ENST00000425753 APLP2Q06481 763 aa32.01■■■□□ 2.71
TSTA3-201ENST00000425753 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.97■■■□□ 2.71
TSTA3-201ENST00000425753 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
TSTA3-201ENST00000425753 CD109Q6YHK3 1445 aa31.94■■■□□ 2.7
TSTA3-201ENST00000425753 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
TSTA3-201ENST00000425753 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
TSTA3-201ENST00000425753 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.88■■■□□ 2.69
TSTA3-201ENST00000425753 NCOA2Q15596 1464 aa31.87■■■□□ 2.69
TSTA3-201ENST00000425753 PLCH2O75038 1416 aa31.85■■■□□ 2.69
TSTA3-201ENST00000425753 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.83■■■□□ 2.69
TSTA3-201ENST00000425753 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.82■■■□□ 2.68
TSTA3-201ENST00000425753 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
TSTA3-201ENST00000425753 PREX2Q70Z35 1606 aa31.79■■■□□ 2.68
TSTA3-201ENST00000425753 TSPOAP1O95153 1857 aa31.77■■■□□ 2.68
TSTA3-201ENST00000425753 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.77■■■□□ 2.68
TSTA3-201ENST00000425753 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.76■■■□□ 2.68
TSTA3-201ENST00000425753 NEO1Q92859 1461 aa31.76■■■□□ 2.67
TSTA3-201ENST00000425753 FANCAO15360 1455 aa31.73■■■□□ 2.67
TSTA3-201ENST00000425753 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms