RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 SHROOM2Q13796 1616 aa33.95■■■■□ 3.03
PMS1-211ENST00000424766 JPH4Q96JJ6 628 aa33.95■■■■□ 3.03
PMS1-211ENST00000424766 ARHGEF11O15085 1522 aa33.91■■■■□ 3.02
PMS1-211ENST00000424766 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.9■■■■□ 3.02
PMS1-211ENST00000424766 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.9■■■■□ 3.02
PMS1-211ENST00000424766 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.9■■■■□ 3.02
PMS1-211ENST00000424766 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.9■■■■□ 3.02
PMS1-211ENST00000424766 IQGAP2Q13576 1575 aa33.88■■■■□ 3.01
PMS1-211ENST00000424766 GOLGA3Q08378 1498 aa33.81■■■■□ 3
PMS1-211ENST00000424766 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
PMS1-211ENST00000424766 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.74■■■□□ 2.99
PMS1-211ENST00000424766 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.73■■■□□ 2.99
PMS1-211ENST00000424766 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
PMS1-211ENST00000424766 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.7■■■□□ 2.99
PMS1-211ENST00000424766 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.68■■■□□ 2.98
PMS1-211ENST00000424766 ARAP1Q96P48 1450 aa33.66■■■□□ 2.98
PMS1-211ENST00000424766 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.62■■■□□ 2.97
PMS1-211ENST00000424766 DISP1Q96F81 1524 aa33.61■■■□□ 2.97
PMS1-211ENST00000424766 KIAA0556O60303 1618 aa33.53■■■□□ 2.96
PMS1-211ENST00000424766 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.52■■■□□ 2.96
PMS1-211ENST00000424766 PTPRGP23470 1445 aa33.47■■■□□ 2.95
PMS1-211ENST00000424766 SAMD9Q5K651 1589 aa33.46■■■□□ 2.95
PMS1-211ENST00000424766 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
PMS1-211ENST00000424766 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.41■■■□□ 2.94
PMS1-211ENST00000424766 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.39■■■□□ 2.94
PMS1-211ENST00000424766 P3H3Q8IVL6 736 aa33.38■■■□□ 2.93
PMS1-211ENST00000424766 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
PMS1-211ENST00000424766 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.27■■■□□ 2.92
PMS1-211ENST00000424766 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.25■■■□□ 2.91
PMS1-211ENST00000424766 UACAQ9BZF9 1416 aa33.25■■■□□ 2.91
PMS1-211ENST00000424766 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.22■■■□□ 2.91
PMS1-211ENST00000424766 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.22■■■□□ 2.91
PMS1-211ENST00000424766 CLIP1P30622 1438 aa33.21■■■□□ 2.91
PMS1-211ENST00000424766 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.17■■■□□ 2.9
PMS1-211ENST00000424766 ABCC2Q92887 1545 aa33.17■■■□□ 2.9
PMS1-211ENST00000424766 ABCA8O94911 1581 aa33.17■■■□□ 2.9
PMS1-211ENST00000424766 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.15■■■□□ 2.9
PMS1-211ENST00000424766 CEP162Q5TB80 1403 aa33.14■■■□□ 2.9
PMS1-211ENST00000424766 FMN1Q68DA7 1419 aa33.1■■■□□ 2.89
PMS1-211ENST00000424766 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.08■■■□□ 2.89
PMS1-211ENST00000424766 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.04■■■□□ 2.88
PMS1-211ENST00000424766 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
PMS1-211ENST00000424766 MAPKBP1O60336 1514 aa32.96■■■□□ 2.87
PMS1-211ENST00000424766 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
PMS1-211ENST00000424766 ATP10BO94823 1461 aa32.92■■■□□ 2.86
PMS1-211ENST00000424766 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.87■■■□□ 2.85
PMS1-211ENST00000424766 HECW1Q76N89 1606 aa32.87■■■□□ 2.85
PMS1-211ENST00000424766 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
PMS1-211ENST00000424766 ARID3CA6NKF2 412 aa32.85■■■□□ 2.85
PMS1-211ENST00000424766 ASXL2Q76L83 1435 aa32.85■■■□□ 2.85
PMS1-211ENST00000424766 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
PMS1-211ENST00000424766 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.8■■■□□ 2.84
PMS1-211ENST00000424766 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
PMS1-211ENST00000424766 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
PMS1-211ENST00000424766 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
PMS1-211ENST00000424766 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
PMS1-211ENST00000424766 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.75■■■□□ 2.83
PMS1-211ENST00000424766 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.74■■■□□ 2.83
PMS1-211ENST00000424766 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.74■■■□□ 2.83
PMS1-211ENST00000424766 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.73■■■□□ 2.83
PMS1-211ENST00000424766 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
PMS1-211ENST00000424766 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.71■■■□□ 2.83
PMS1-211ENST00000424766 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.7■■■□□ 2.83
PMS1-211ENST00000424766 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.7■■■□□ 2.83
PMS1-211ENST00000424766 DIP2BQ9P265 1576 aa32.69■■■□□ 2.82
PMS1-211ENST00000424766 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.68■■■□□ 2.82
PMS1-211ENST00000424766 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
PMS1-211ENST00000424766 GLI2P10070 1586 aa32.64■■■□□ 2.82
PMS1-211ENST00000424766 KCNH8Q96L42 1107 aa32.63■■■□□ 2.81
PMS1-211ENST00000424766 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.8
PMS1-211ENST00000424766 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.49■■■□□ 2.79
PMS1-211ENST00000424766 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.48■■■□□ 2.79
PMS1-211ENST00000424766 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.47■■■□□ 2.79
PMS1-211ENST00000424766 MAP3K1Q13233 1512 aa32.46■■■□□ 2.79
PMS1-211ENST00000424766 TSPOAP1O95153 1857 aa32.45■■■□□ 2.79
PMS1-211ENST00000424766 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.45■■■□□ 2.78
PMS1-211ENST00000424766 TIAM1Q13009 1591 aa32.44■■■□□ 2.78
PMS1-211ENST00000424766 CD109Q6YHK3 1445 aa32.43■■■□□ 2.78
PMS1-211ENST00000424766 APLP2Q06481 763 aa32.41■■■□□ 2.78
PMS1-211ENST00000424766 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.4■■■□□ 2.78
PMS1-211ENST00000424766 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.4■■■□□ 2.78
PMS1-211ENST00000424766 KIF14Q15058 1648 aa32.4■■■□□ 2.78
PMS1-211ENST00000424766 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
PMS1-211ENST00000424766 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.33■■■□□ 2.77
PMS1-211ENST00000424766 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.32■■■□□ 2.77
PMS1-211ENST00000424766 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.31■■■□□ 2.76
PMS1-211ENST00000424766 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.3■■■□□ 2.76
PMS1-211ENST00000424766 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
PMS1-211ENST00000424766 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.25■■■□□ 2.75
PMS1-211ENST00000424766 PLCH2O75038 1416 aa32.25■■■□□ 2.75
PMS1-211ENST00000424766 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
PMS1-211ENST00000424766 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.2■■■□□ 2.74
PMS1-211ENST00000424766 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.19■■■□□ 2.74
PMS1-211ENST00000424766 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.17■■■□□ 2.74
PMS1-211ENST00000424766 NEO1Q92859 1461 aa32.16■■■□□ 2.74
PMS1-211ENST00000424766 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.15■■■□□ 2.74
PMS1-211ENST00000424766 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.15■■■□□ 2.74
PMS1-211ENST00000424766 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.14■■■□□ 2.74
PMS1-211ENST00000424766 FANCAO15360 1455 aa32.14■■■□□ 2.74
PMS1-211ENST00000424766 NCOA2Q15596 1464 aa32.14■■■□□ 2.74
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