RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419348.6

HTATIP2-201, Transcript of HIV-1 Tat interactive protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HTATIP2, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATIP2-201ENST00000419348 EEA1Q15075 1411 aa36.67■■■■□ 3.46
HTATIP2-201ENST00000419348 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.63■■■■□ 3.45
HTATIP2-201ENST00000419348 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.62■■■■□ 3.45
HTATIP2-201ENST00000419348 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.59■■■■□ 3.45
HTATIP2-201ENST00000419348 JPH4Q96JJ6 628 aa36.58■■■■□ 3.45
HTATIP2-201ENST00000419348 PRXQ9BXM0 1461 aa36.55■■■■□ 3.44
HTATIP2-201ENST00000419348 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.52■■■■□ 3.44
HTATIP2-201ENST00000419348 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
HTATIP2-201ENST00000419348 SHROOM2Q13796 1616 aa36.49■■■■□ 3.43
HTATIP2-201ENST00000419348 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
HTATIP2-201ENST00000419348 IQGAP2Q13576 1575 aa36.28■■■■□ 3.4
HTATIP2-201ENST00000419348 KIF21BO75037 1637 aa36.19■■■■□ 3.38
HTATIP2-201ENST00000419348 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.16■■■■□ 3.38
HTATIP2-201ENST00000419348 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.14■■■■□ 3.38
HTATIP2-201ENST00000419348 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.14■■■■□ 3.38
HTATIP2-201ENST00000419348 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.12■■■■□ 3.37
HTATIP2-201ENST00000419348 GOLGA3Q08378 1498 aa36.03■■■■□ 3.36
HTATIP2-201ENST00000419348 DISP1Q96F81 1524 aa36.03■■■■□ 3.36
HTATIP2-201ENST00000419348 TNIKQ9UKE5 1360 aa36■■■■□ 3.35
HTATIP2-201ENST00000419348 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
HTATIP2-201ENST00000419348 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.99■■■■□ 3.35
HTATIP2-201ENST00000419348 PTPRGP23470 1445 aa35.98■■■■□ 3.35
HTATIP2-201ENST00000419348 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.93■■■■□ 3.34
HTATIP2-201ENST00000419348 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
HTATIP2-201ENST00000419348 KIAA0556O60303 1618 aa35.92■■■■□ 3.34
HTATIP2-201ENST00000419348 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.89■■■■□ 3.34
HTATIP2-201ENST00000419348 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.86■■■■□ 3.33
HTATIP2-201ENST00000419348 MAPKBP1O60336 1514 aa35.84■■■■□ 3.33
HTATIP2-201ENST00000419348 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
HTATIP2-201ENST00000419348 P3H3Q8IVL6 736 aa35.77■■■■□ 3.32
HTATIP2-201ENST00000419348 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.76■■■■□ 3.32
HTATIP2-201ENST00000419348 SAMD9Q5K651 1589 aa35.75■■■■□ 3.31
HTATIP2-201ENST00000419348 UACAQ9BZF9 1416 aa35.71■■■■□ 3.31
HTATIP2-201ENST00000419348 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.67■■■■□ 3.3
HTATIP2-201ENST00000419348 ABCC2Q92887 1545 aa35.67■■■■□ 3.3
HTATIP2-201ENST00000419348 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.66■■■■□ 3.3
HTATIP2-201ENST00000419348 DIP2BQ9P265 1576 aa35.65■■■■□ 3.3
HTATIP2-201ENST00000419348 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
HTATIP2-201ENST00000419348 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.58■■■■□ 3.29
HTATIP2-201ENST00000419348 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.58■■■■□ 3.29
HTATIP2-201ENST00000419348 ASXL2Q76L83 1435 aa35.56■■■■□ 3.28
HTATIP2-201ENST00000419348 ABCA8O94911 1581 aa35.53■■■■□ 3.28
HTATIP2-201ENST00000419348 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.52■■■■□ 3.28
HTATIP2-201ENST00000419348 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.49■■■■□ 3.27
HTATIP2-201ENST00000419348 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.48■■■■□ 3.27
HTATIP2-201ENST00000419348 CLIP1P30622 1438 aa35.4■■■■□ 3.26
HTATIP2-201ENST00000419348 FMN1Q68DA7 1419 aa35.38■■■■□ 3.25
HTATIP2-201ENST00000419348 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.38■■■■□ 3.25
HTATIP2-201ENST00000419348 GLI2P10070 1586 aa35.36■■■■□ 3.25
HTATIP2-201ENST00000419348 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
HTATIP2-201ENST00000419348 TSPOAP1O95153 1857 aa35.34■■■■□ 3.25
HTATIP2-201ENST00000419348 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
HTATIP2-201ENST00000419348 KDM6BO15054 1643 aa35.3■■■■□ 3.24
HTATIP2-201ENST00000419348 ATP10BO94823 1461 aa35.29■■■■□ 3.24
HTATIP2-201ENST00000419348 ARID3CA6NKF2 412 aa35.28■■■■□ 3.24
HTATIP2-201ENST00000419348 CEP162Q5TB80 1403 aa35.28■■■■□ 3.24
HTATIP2-201ENST00000419348 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
HTATIP2-201ENST00000419348 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.21■■■■□ 3.23
HTATIP2-201ENST00000419348 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
HTATIP2-201ENST00000419348 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
HTATIP2-201ENST00000419348 KCNH8Q96L42 1107 aa35.19■■■■□ 3.22
HTATIP2-201ENST00000419348 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
HTATIP2-201ENST00000419348 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
HTATIP2-201ENST00000419348 HECW1Q76N89 1606 aa35.12■■■■□ 3.21
HTATIP2-201ENST00000419348 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.11■■■■□ 3.21
HTATIP2-201ENST00000419348 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.1■■■■□ 3.21
HTATIP2-201ENST00000419348 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.1■■■■□ 3.21
HTATIP2-201ENST00000419348 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.07■■■■□ 3.2
HTATIP2-201ENST00000419348 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
HTATIP2-201ENST00000419348 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.05■■■■□ 3.2
HTATIP2-201ENST00000419348 CD109Q6YHK3 1445 aa35.04■■■■□ 3.2
HTATIP2-201ENST00000419348 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
HTATIP2-201ENST00000419348 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
HTATIP2-201ENST00000419348 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.01■■■■□ 3.2
HTATIP2-201ENST00000419348 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
HTATIP2-201ENST00000419348 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.95■■■■□ 3.19
HTATIP2-201ENST00000419348 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.94■■■■□ 3.18
HTATIP2-201ENST00000419348 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.88■■■■□ 3.17
HTATIP2-201ENST00000419348 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.86■■■■□ 3.17
HTATIP2-201ENST00000419348 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.85■■■■□ 3.17
HTATIP2-201ENST00000419348 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.81■■■■□ 3.16
HTATIP2-201ENST00000419348 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
HTATIP2-201ENST00000419348 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.72■■■■□ 3.15
HTATIP2-201ENST00000419348 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.71■■■■□ 3.15
HTATIP2-201ENST00000419348 ADGRL1O94910 1474 aa34.7■■■■□ 3.15
HTATIP2-201ENST00000419348 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.68■■■■□ 3.14
HTATIP2-201ENST00000419348 KIF14Q15058 1648 aa34.65■■■■□ 3.14
HTATIP2-201ENST00000419348 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.63■■■■□ 3.13
HTATIP2-201ENST00000419348 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.63■■■■□ 3.13
HTATIP2-201ENST00000419348 RAPGEF3O95398 923 aa34.58■■■■□ 3.13
HTATIP2-201ENST00000419348 NEO1Q92859 1461 aa34.57■■■■□ 3.13
HTATIP2-201ENST00000419348 PLCH2O75038 1416 aa34.57■■■■□ 3.12
HTATIP2-201ENST00000419348 TIAM1Q13009 1591 aa34.55■■■■□ 3.12
HTATIP2-201ENST00000419348 MAP3K1Q13233 1512 aa34.54■■■■□ 3.12
HTATIP2-201ENST00000419348 APLP2Q06481 763 aa34.52■■■■□ 3.12
HTATIP2-201ENST00000419348 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.51■■■■□ 3.11
HTATIP2-201ENST00000419348 FANCAO15360 1455 aa34.51■■■■□ 3.11
HTATIP2-201ENST00000419348 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.49■■■■□ 3.11
HTATIP2-201ENST00000419348 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.48■■■■□ 3.11
HTATIP2-201ENST00000419348 AKNAQ7Z591 1439 aa34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms