RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415537.1

HLA-C-204, Transcript of major histocompatibility complex, class I, C, humanhuman

Gene HLA-C, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-C-204ENST00000415537 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.97■■■■■ 4.47
HLA-C-204ENST00000415537 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
HLA-C-204ENST00000415537 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.88■■■■■ 4.45
HLA-C-204ENST00000415537 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.83■■■■■ 4.45
HLA-C-204ENST00000415537 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.55■■■■■ 4.4
HLA-C-204ENST00000415537 IQGAP2Q13576 1575 aa42.51■■■■■ 4.4
HLA-C-204ENST00000415537 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.48■■■■■ 4.39
HLA-C-204ENST00000415537 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.45■■■■■ 4.39
HLA-C-204ENST00000415537 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.39■■■■■ 4.38
HLA-C-204ENST00000415537 PTPRGP23470 1445 aa42.37■■■■■ 4.37
HLA-C-204ENST00000415537 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
HLA-C-204ENST00000415537 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.33■■■■■ 4.37
HLA-C-204ENST00000415537 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.3■■■■■ 4.36
HLA-C-204ENST00000415537 MAPKBP1O60336 1514 aa42.25■■■■■ 4.35
HLA-C-204ENST00000415537 DISP1Q96F81 1524 aa42.22■■■■■ 4.35
HLA-C-204ENST00000415537 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.22■■■■■ 4.35
HLA-C-204ENST00000415537 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.21■■■■■ 4.35
HLA-C-204ENST00000415537 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.17■■■■■ 4.34
HLA-C-204ENST00000415537 PRXQ9BXM0 1461 aa42.17■■■■■ 4.34
HLA-C-204ENST00000415537 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.16■■■■■ 4.34
HLA-C-204ENST00000415537 KIAA0556O60303 1618 aa42.09■■■■■ 4.33
HLA-C-204ENST00000415537 DIP2BQ9P265 1576 aa42.07■■■■■ 4.33
HLA-C-204ENST00000415537 ABCC2Q92887 1545 aa42.06■■■■■ 4.32
HLA-C-204ENST00000415537 UACAQ9BZF9 1416 aa42.06■■■■■ 4.32
HLA-C-204ENST00000415537 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.03■■■■■ 4.32
HLA-C-204ENST00000415537 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.02■■■■■ 4.32
HLA-C-204ENST00000415537 GOLGA3Q08378 1498 aa41.98■■■■■ 4.31
HLA-C-204ENST00000415537 EEA1Q15075 1411 aa41.93■■■■■ 4.3
HLA-C-204ENST00000415537 ASXL2Q76L83 1435 aa41.88■■■■■ 4.3
HLA-C-204ENST00000415537 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.87■■■■■ 4.29
HLA-C-204ENST00000415537 TSPOAP1O95153 1857 aa41.85■■■■■ 4.29
HLA-C-204ENST00000415537 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.84■■■■■ 4.29
HLA-C-204ENST00000415537 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
HLA-C-204ENST00000415537 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
HLA-C-204ENST00000415537 GLI2P10070 1586 aa41.7■■■■■ 4.27
HLA-C-204ENST00000415537 ABCA8O94911 1581 aa41.67■■■■■ 4.26
HLA-C-204ENST00000415537 P3H3Q8IVL6 736 aa41.66■■■■■ 4.26
HLA-C-204ENST00000415537 KDM6BO15054 1643 aa41.63■■■■■ 4.26
HLA-C-204ENST00000415537 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.62■■■■■ 4.25
HLA-C-204ENST00000415537 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
HLA-C-204ENST00000415537 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
HLA-C-204ENST00000415537 SAMD9Q5K651 1589 aa41.56■■■■■ 4.24
HLA-C-204ENST00000415537 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.55■■■■■ 4.24
HLA-C-204ENST00000415537 KIF21BO75037 1637 aa41.54■■■■■ 4.24
HLA-C-204ENST00000415537 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
HLA-C-204ENST00000415537 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
HLA-C-204ENST00000415537 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.5■■■■■ 4.23
HLA-C-204ENST00000415537 KCNH8Q96L42 1107 aa41.41■■■■■ 4.22
HLA-C-204ENST00000415537 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.4■■■■■ 4.22
HLA-C-204ENST00000415537 ARID3CA6NKF2 412 aa41.39■■■■■ 4.22
HLA-C-204ENST00000415537 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.36■■■■■ 4.21
HLA-C-204ENST00000415537 ATP10BO94823 1461 aa41.34■■■■■ 4.21
HLA-C-204ENST00000415537 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.32■■■■■ 4.21
HLA-C-204ENST00000415537 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.31■■■■■ 4.2
HLA-C-204ENST00000415537 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.3■■■■■ 4.2
HLA-C-204ENST00000415537 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
HLA-C-204ENST00000415537 CD109Q6YHK3 1445 aa41.27■■■■■ 4.2
HLA-C-204ENST00000415537 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.27■■■■■ 4.2
HLA-C-204ENST00000415537 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
HLA-C-204ENST00000415537 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
HLA-C-204ENST00000415537 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.18■■■■■ 4.18
HLA-C-204ENST00000415537 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
HLA-C-204ENST00000415537 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
HLA-C-204ENST00000415537 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.04■■■■■ 4.16
HLA-C-204ENST00000415537 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.99■■■■■ 4.15
HLA-C-204ENST00000415537 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.96■■■■■ 4.15
HLA-C-204ENST00000415537 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.93■■■■■ 4.14
HLA-C-204ENST00000415537 FMN1Q68DA7 1419 aa40.93■■■■■ 4.14
HLA-C-204ENST00000415537 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
HLA-C-204ENST00000415537 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.86■■■■■ 4.13
HLA-C-204ENST00000415537 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.85■■■■■ 4.13
HLA-C-204ENST00000415537 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
HLA-C-204ENST00000415537 HECW1Q76N89 1606 aa40.81■■■■■ 4.12
HLA-C-204ENST00000415537 NEO1Q92859 1461 aa40.78■■■■■ 4.12
HLA-C-204ENST00000415537 ADGRL1O94910 1474 aa40.77■■■■■ 4.12
HLA-C-204ENST00000415537 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.72■■■■■ 4.11
HLA-C-204ENST00000415537 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
HLA-C-204ENST00000415537 RAPGEF3O95398 923 aa40.65■■■■■ 4.1
HLA-C-204ENST00000415537 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.65■■■■■ 4.1
HLA-C-204ENST00000415537 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.62■■■■■ 4.09
HLA-C-204ENST00000415537 FANCAO15360 1455 aa40.6■■■■■ 4.09
HLA-C-204ENST00000415537 AKNAQ7Z591 1439 aa40.57■■■■■ 4.08
HLA-C-204ENST00000415537 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.54■■■■■ 4.08
HLA-C-204ENST00000415537 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.52■■■■■ 4.08
HLA-C-204ENST00000415537 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
HLA-C-204ENST00000415537 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.5■■■■■ 4.07
HLA-C-204ENST00000415537 CLIP1P30622 1438 aa40.49■■■■■ 4.07
HLA-C-204ENST00000415537 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
HLA-C-204ENST00000415537 PLCH2O75038 1416 aa40.48■■■■■ 4.07
HLA-C-204ENST00000415537 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
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HLA-C-204ENST00000415537 RICTORQ6R327 1708 aa40.45■■■■■ 4.07
HLA-C-204ENST00000415537 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.45■■■■■ 4.07
HLA-C-204ENST00000415537 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.44■■■■■ 4.06
HLA-C-204ENST00000415537 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.37■■■■■ 4.05
HLA-C-204ENST00000415537 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.37■■■■■ 4.05
HLA-C-204ENST00000415537 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.33■■■■■ 4.05
HLA-C-204ENST00000415537 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
HLA-C-204ENST00000415537 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.31■■■■■ 4.04
HLA-C-204ENST00000415537 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.27■■■■■ 4.04
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