RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 NUP160Q12769 1436 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP5-203ENST00000408919 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP5-203ENST00000408919 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.85■■■□□ 2.21
SH3BP5-203ENST00000408919 IQGAP2Q13576 1575 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP5-203ENST00000408919 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
SH3BP5-203ENST00000408919 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.78■■■□□ 2.2
SH3BP5-203ENST00000408919 CEP162Q5TB80 1403 aa28.77■■■□□ 2.2
SH3BP5-203ENST00000408919 OSCARQ8IYS5 282 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BP5-203ENST00000408919 CLIP1P30622 1438 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP5-203ENST00000408919 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BP5-203ENST00000408919 SHROOM2Q13796 1616 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP5-203ENST00000408919 JPH4Q96JJ6 628 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP5-203ENST00000408919 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.65■■■□□ 2.18
SH3BP5-203ENST00000408919 SAMD9Q5K651 1589 aa28.64■■■□□ 2.17
SH3BP5-203ENST00000408919 DISP1Q96F81 1524 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5-203ENST00000408919 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-203ENST00000408919 P3H3Q8IVL6 736 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 KIAA0556O60303 1618 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.55■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 ARAP1Q96P48 1450 aa28.54■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.47■■■□□ 2.15
SH3BP5-203ENST00000408919 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SH3BP5-203ENST00000408919 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BP5-203ENST00000408919 ARHGEF11O15085 1522 aa28.34■■■□□ 2.13
SH3BP5-203ENST00000408919 FMN1Q68DA7 1419 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 PTPRGP23470 1445 aa28.29■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.28■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.28■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.28■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-203ENST00000408919 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.2■■■□□ 2.11
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCA8O94911 1581 aa28.2■■■□□ 2.1
SH3BP5-203ENST00000408919 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.19■■■□□ 2.1
SH3BP5-203ENST00000408919 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP5-203ENST00000408919 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.17■■■□□ 2.1
SH3BP5-203ENST00000408919 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SH3BP5-203ENST00000408919 UACAQ9BZF9 1416 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP5-203ENST00000408919 HECW1Q76N89 1606 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP5-203ENST00000408919 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCC2Q92887 1545 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP5-203ENST00000408919 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.07■■■□□ 2.08
SH3BP5-203ENST00000408919 ARID3CA6NKF2 412 aa28.06■■■□□ 2.08
SH3BP5-203ENST00000408919 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
SH3BP5-203ENST00000408919 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP5-203ENST00000408919 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SH3BP5-203ENST00000408919 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BP5-203ENST00000408919 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP5-203ENST00000408919 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP5-203ENST00000408919 TIAM1Q13009 1591 aa28■■■□□ 2.07
SH3BP5-203ENST00000408919 ATP10BO94823 1461 aa27.97■■■□□ 2.07
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.97■■■□□ 2.07
SH3BP5-203ENST00000408919 MAP3K1Q13233 1512 aa27.95■■■□□ 2.06
SH3BP5-203ENST00000408919 APLP2Q06481 763 aa27.95■■■□□ 2.06
SH3BP5-203ENST00000408919 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SH3BP5-203ENST00000408919 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SH3BP5-203ENST00000408919 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP5-203ENST00000408919 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
SH3BP5-203ENST00000408919 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.9■■■□□ 2.06
SH3BP5-203ENST00000408919 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
SH3BP5-203ENST00000408919 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SH3BP5-203ENST00000408919 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.86■■■□□ 2.05
SH3BP5-203ENST00000408919 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.79■■■□□ 2.04
SH3BP5-203ENST00000408919 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BP5-203ENST00000408919 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
SH3BP5-203ENST00000408919 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
SH3BP5-203ENST00000408919 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
SH3BP5-203ENST00000408919 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.74■■■□□ 2.03
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF14Q15058 1648 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP5-203ENST00000408919 ASXL2Q76L83 1435 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP5-203ENST00000408919 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SH3BP5-203ENST00000408919 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5-203ENST00000408919 MAPKBP1O60336 1514 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP5-203ENST00000408919 NCOA2Q15596 1464 aa27.65■■■□□ 2.02
SH3BP5-203ENST00000408919 KCNH8Q96L42 1107 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5-203ENST00000408919 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.58■■■□□ 2.01
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.57■■■□□ 2
SH3BP5-203ENST00000408919 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.57■■■□□ 2
SH3BP5-203ENST00000408919 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
SH3BP5-203ENST00000408919 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP5-203ENST00000408919 DIP2BQ9P265 1576 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5-203ENST00000408919 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5-203ENST00000408919 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5-203ENST00000408919 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5-203ENST00000408919 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP5-203ENST00000408919 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5-203ENST00000408919 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-203ENST00000408919 PREX2Q70Z35 1606 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP5-203ENST00000408919 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-203ENST00000408919 GLI2P10070 1586 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-203ENST00000408919 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-203ENST00000408919 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP5-203ENST00000408919 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-203ENST00000408919 PLCH2O75038 1416 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-203ENST00000408919 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-203ENST00000408919 MIA2Q96PC5 1412 aa27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms