RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402613.3

VSTM2A-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VSTM2A, Length 1,076 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-202ENST00000402613 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.54■■■■■ 4.08
VSTM2A-202ENST00000402613 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
VSTM2A-202ENST00000402613 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.49■■■■■ 4.07
VSTM2A-202ENST00000402613 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
VSTM2A-202ENST00000402613 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.31■■■■■ 4.04
VSTM2A-202ENST00000402613 IQGAP2Q13576 1575 aa40.14■■■■■ 4.02
VSTM2A-202ENST00000402613 PRXQ9BXM0 1461 aa40.08■■■■■ 4.01
VSTM2A-202ENST00000402613 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.07■■■■■ 4
VSTM2A-202ENST00000402613 PTPRGP23470 1445 aa40■■■■□ 3.99
VSTM2A-202ENST00000402613 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.99■■■■□ 3.99
VSTM2A-202ENST00000402613 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.98■■■■□ 3.99
VSTM2A-202ENST00000402613 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.95■■■■□ 3.99
VSTM2A-202ENST00000402613 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.94■■■■□ 3.98
VSTM2A-202ENST00000402613 DISP1Q96F81 1524 aa39.94■■■■□ 3.98
VSTM2A-202ENST00000402613 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
VSTM2A-202ENST00000402613 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.91■■■■□ 3.98
VSTM2A-202ENST00000402613 EEA1Q15075 1411 aa39.89■■■■□ 3.98
VSTM2A-202ENST00000402613 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.87■■■■□ 3.97
VSTM2A-202ENST00000402613 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.8■■■■□ 3.96
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
VSTM2A-202ENST00000402613 KIAA0556O60303 1618 aa39.76■■■■□ 3.95
VSTM2A-202ENST00000402613 MAPKBP1O60336 1514 aa39.75■■■■□ 3.95
VSTM2A-202ENST00000402613 UACAQ9BZF9 1416 aa39.71■■■■□ 3.95
VSTM2A-202ENST00000402613 GOLGA3Q08378 1498 aa39.68■■■■□ 3.94
VSTM2A-202ENST00000402613 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.68■■■■□ 3.94
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCC2Q92887 1545 aa39.66■■■■□ 3.94
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.66■■■■□ 3.94
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.64■■■■□ 3.94
VSTM2A-202ENST00000402613 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.58■■■■□ 3.93
VSTM2A-202ENST00000402613 DIP2BQ9P265 1576 aa39.51■■■■□ 3.92
VSTM2A-202ENST00000402613 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.49■■■■□ 3.91
VSTM2A-202ENST00000402613 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.49■■■■□ 3.91
VSTM2A-202ENST00000402613 ASXL2Q76L83 1435 aa39.48■■■■□ 3.91
VSTM2A-202ENST00000402613 P3H3Q8IVL6 736 aa39.47■■■■□ 3.91
VSTM2A-202ENST00000402613 KIF21BO75037 1637 aa39.46■■■■□ 3.91
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCA8O94911 1581 aa39.38■■■■□ 3.9
VSTM2A-202ENST00000402613 SAMD9Q5K651 1589 aa39.35■■■■□ 3.89
VSTM2A-202ENST00000402613 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
VSTM2A-202ENST00000402613 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
VSTM2A-202ENST00000402613 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.29■■■■□ 3.88
VSTM2A-202ENST00000402613 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
VSTM2A-202ENST00000402613 GLI2P10070 1586 aa39.25■■■■□ 3.87
VSTM2A-202ENST00000402613 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
VSTM2A-202ENST00000402613 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.18■■■■□ 3.86
VSTM2A-202ENST00000402613 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.17■■■■□ 3.86
VSTM2A-202ENST00000402613 ARID3CA6NKF2 412 aa39.14■■■■□ 3.86
VSTM2A-202ENST00000402613 TSPOAP1O95153 1857 aa39.13■■■■□ 3.86
VSTM2A-202ENST00000402613 ATP10BO94823 1461 aa39.11■■■■□ 3.85
VSTM2A-202ENST00000402613 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.11■■■■□ 3.85
VSTM2A-202ENST00000402613 KCNH8Q96L42 1107 aa39.06■■■■□ 3.84
VSTM2A-202ENST00000402613 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.06■■■■□ 3.84
VSTM2A-202ENST00000402613 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.02■■■■□ 3.84
VSTM2A-202ENST00000402613 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
VSTM2A-202ENST00000402613 KDM6BO15054 1643 aa38.99■■■■□ 3.83
VSTM2A-202ENST00000402613 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
VSTM2A-202ENST00000402613 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
VSTM2A-202ENST00000402613 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
VSTM2A-202ENST00000402613 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.91■■■■□ 3.82
VSTM2A-202ENST00000402613 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.91■■■■□ 3.82
VSTM2A-202ENST00000402613 CD109Q6YHK3 1445 aa38.9■■■■□ 3.82
VSTM2A-202ENST00000402613 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.82■■■■□ 3.8
VSTM2A-202ENST00000402613 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.81■■■■□ 3.8
VSTM2A-202ENST00000402613 FMN1Q68DA7 1419 aa38.8■■■■□ 3.8
VSTM2A-202ENST00000402613 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
VSTM2A-202ENST00000402613 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.76■■■■□ 3.8
VSTM2A-202ENST00000402613 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.68■■■■□ 3.78
VSTM2A-202ENST00000402613 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
VSTM2A-202ENST00000402613 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
VSTM2A-202ENST00000402613 HECW1Q76N89 1606 aa38.6■■■■□ 3.77
VSTM2A-202ENST00000402613 CLIP1P30622 1438 aa38.55■■■■□ 3.76
VSTM2A-202ENST00000402613 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.53■■■■□ 3.76
VSTM2A-202ENST00000402613 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.5■■■■□ 3.75
VSTM2A-202ENST00000402613 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
VSTM2A-202ENST00000402613 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.48■■■■□ 3.75
VSTM2A-202ENST00000402613 NEO1Q92859 1461 aa38.47■■■■□ 3.75
VSTM2A-202ENST00000402613 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.46■■■■□ 3.75
VSTM2A-202ENST00000402613 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.42■■■■□ 3.74
VSTM2A-202ENST00000402613 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
VSTM2A-202ENST00000402613 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.38■■■■□ 3.73
VSTM2A-202ENST00000402613 RAPGEF3O95398 923 aa38.35■■■■□ 3.73
VSTM2A-202ENST00000402613 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
VSTM2A-202ENST00000402613 FANCAO15360 1455 aa38.33■■■■□ 3.73
VSTM2A-202ENST00000402613 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.32■■■■□ 3.73
VSTM2A-202ENST00000402613 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.32■■■■□ 3.72
VSTM2A-202ENST00000402613 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.31■■■■□ 3.72
VSTM2A-202ENST00000402613 PLCH2O75038 1416 aa38.29■■■■□ 3.72
VSTM2A-202ENST00000402613 AKNAQ7Z591 1439 aa38.29■■■■□ 3.72
VSTM2A-202ENST00000402613 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.27■■■■□ 3.72
VSTM2A-202ENST00000402613 CEP162Q5TB80 1403 aa38.27■■■■□ 3.72
VSTM2A-202ENST00000402613 KIF14Q15058 1648 aa38.23■■■■□ 3.71
VSTM2A-202ENST00000402613 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.22■■■■□ 3.71
VSTM2A-202ENST00000402613 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
VSTM2A-202ENST00000402613 ADGRL1O94910 1474 aa38.21■■■■□ 3.71
VSTM2A-202ENST00000402613 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.18■■■■□ 3.7
VSTM2A-202ENST00000402613 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.17■■■■□ 3.7
VSTM2A-202ENST00000402613 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.09■■■■□ 3.69
VSTM2A-202ENST00000402613 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.09■■■■□ 3.69
VSTM2A-202ENST00000402613 RICTORQ6R327 1708 aa38.06■■■■□ 3.68
VSTM2A-202ENST00000402613 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.03■■■■□ 3.68
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