RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400593.6

TPTEP1-202, Transcript of TPTE pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TPTEP1, Length 1,430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP1-202ENST00000400593 IGF1RP08069 1367 aa26.42■■□□□ 1.82
TPTEP1-202ENST00000400593 ADAMTS12P58397 1594 aa26.41■■□□□ 1.82
TPTEP1-202ENST00000400593 GRIN2AQ12879 1464 aa26.38■■□□□ 1.81
TPTEP1-202ENST00000400593 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.38■■□□□ 1.81
TPTEP1-202ENST00000400593 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.35■■□□□ 1.81
TPTEP1-202ENST00000400593 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.35■■□□□ 1.81
TPTEP1-202ENST00000400593 SHROOM2Q13796 1616 aa26.33■■□□□ 1.81
TPTEP1-202ENST00000400593 NUP160Q12769 1436 aa26.31■■□□□ 1.8
TPTEP1-202ENST00000400593 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.3■■□□□ 1.8
TPTEP1-202ENST00000400593 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.27■■□□□ 1.8
TPTEP1-202ENST00000400593 KDM6BO15054 1643 aa26.26■■□□□ 1.79
TPTEP1-202ENST00000400593 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.25■■□□□ 1.79
TPTEP1-202ENST00000400593 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.22■■□□□ 1.79
TPTEP1-202ENST00000400593 PRXQ9BXM0 1461 aa26.21■■□□□ 1.79
TPTEP1-202ENST00000400593 DIP2BQ9P265 1576 aa26.2■■□□□ 1.78
TPTEP1-202ENST00000400593 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.2■■□□□ 1.78
TPTEP1-202ENST00000400593 TSPOAP1O95153 1857 aa26.18■■□□□ 1.78
TPTEP1-202ENST00000400593 KIF21BO75037 1637 aa26.16■■□□□ 1.78
TPTEP1-202ENST00000400593 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
TPTEP1-202ENST00000400593 MAPKBP1O60336 1514 aa26.14■■□□□ 1.77
TPTEP1-202ENST00000400593 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
TPTEP1-202ENST00000400593 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.05■■□□□ 1.76
TPTEP1-202ENST00000400593 JPH4Q96JJ6 628 aa26.03■■□□□ 1.76
TPTEP1-202ENST00000400593 GOLGA3Q08378 1498 aa26.01■■□□□ 1.75
TPTEP1-202ENST00000400593 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.01■■□□□ 1.75
TPTEP1-202ENST00000400593 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.99■■□□□ 1.75
TPTEP1-202ENST00000400593 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TPTEP1-202ENST00000400593 ADGRL1O94910 1474 aa25.98■■□□□ 1.75
TPTEP1-202ENST00000400593 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.97■■□□□ 1.75
TPTEP1-202ENST00000400593 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.96■■□□□ 1.75
TPTEP1-202ENST00000400593 IQGAP2Q13576 1575 aa25.92■■□□□ 1.74
TPTEP1-202ENST00000400593 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TPTEP1-202ENST00000400593 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
TPTEP1-202ENST00000400593 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.78■■□□□ 1.72
TPTEP1-202ENST00000400593 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.74■■□□□ 1.71
TPTEP1-202ENST00000400593 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.68■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 FBXO41Q8TF61 875 aa25.68■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 P3H3Q8IVL6 736 aa25.66■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 KIAA0556O60303 1618 aa25.66■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.66■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 GLI2P10070 1586 aa25.66■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 SAMD9Q5K651 1589 aa25.66■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 DISP1Q96F81 1524 aa25.64■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 ASXL2Q76L83 1435 aa25.64■■□□□ 1.7
TPTEP1-202ENST00000400593 ABCC2Q92887 1545 aa25.61■■□□□ 1.69
TPTEP1-202ENST00000400593 PTPRGP23470 1445 aa25.6■■□□□ 1.69
TPTEP1-202ENST00000400593 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.6■■□□□ 1.69
TPTEP1-202ENST00000400593 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.53■■□□□ 1.68
TPTEP1-202ENST00000400593 CLIP1P30622 1438 aa25.53■■□□□ 1.68
TPTEP1-202ENST00000400593 CEP162Q5TB80 1403 aa25.53■■□□□ 1.68
TPTEP1-202ENST00000400593 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.51■■□□□ 1.67
TPTEP1-202ENST00000400593 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.5■■□□□ 1.67
TPTEP1-202ENST00000400593 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.48■■□□□ 1.67
TPTEP1-202ENST00000400593 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TPTEP1-202ENST00000400593 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.41■■□□□ 1.66
TPTEP1-202ENST00000400593 FMN1Q68DA7 1419 aa25.38■■□□□ 1.65
TPTEP1-202ENST00000400593 UACAQ9BZF9 1416 aa25.38■■□□□ 1.65
TPTEP1-202ENST00000400593 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.35■■□□□ 1.65
TPTEP1-202ENST00000400593 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TPTEP1-202ENST00000400593 ABCA8O94911 1581 aa25.33■■□□□ 1.65
TPTEP1-202ENST00000400593 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.32■■□□□ 1.64
TPTEP1-202ENST00000400593 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.31■■□□□ 1.64
TPTEP1-202ENST00000400593 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TPTEP1-202ENST00000400593 ARID3CA6NKF2 412 aa25.25■■□□□ 1.63
TPTEP1-202ENST00000400593 HECW1Q76N89 1606 aa25.23■■□□□ 1.63
TPTEP1-202ENST00000400593 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.22■■□□□ 1.63
TPTEP1-202ENST00000400593 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TPTEP1-202ENST00000400593 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.21■■□□□ 1.63
TPTEP1-202ENST00000400593 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.2■■□□□ 1.62
TPTEP1-202ENST00000400593 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.2■■□□□ 1.62
TPTEP1-202ENST00000400593 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.19■■□□□ 1.62
TPTEP1-202ENST00000400593 PTPRMP28827 1452 aa25.17■■□□□ 1.62
TPTEP1-202ENST00000400593 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TPTEP1-202ENST00000400593 CD109Q6YHK3 1445 aa25.17■■□□□ 1.62
TPTEP1-202ENST00000400593 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.16■■□□□ 1.62
TPTEP1-202ENST00000400593 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TPTEP1-202ENST00000400593 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TPTEP1-202ENST00000400593 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.13■■□□□ 1.61
TPTEP1-202ENST00000400593 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.11■■□□□ 1.61
TPTEP1-202ENST00000400593 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.1■■□□□ 1.61
TPTEP1-202ENST00000400593 KCNH8Q96L42 1107 aa25.09■■□□□ 1.61
TPTEP1-202ENST00000400593 ATP10BO94823 1461 aa25.07■■□□□ 1.6
TPTEP1-202ENST00000400593 ILDR2Q71H61 639 aa25.07■■□□□ 1.6
TPTEP1-202ENST00000400593 SOCS7O14512 581 aa25.06■■□□□ 1.6
TPTEP1-202ENST00000400593 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.03■■□□□ 1.6
TPTEP1-202ENST00000400593 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TPTEP1-202ENST00000400593 MADDQ8WXG6 1647 aa25.01■■□□□ 1.59
TPTEP1-202ENST00000400593 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25■■□□□ 1.59
TPTEP1-202ENST00000400593 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.99■■□□□ 1.59
TPTEP1-202ENST00000400593 APLP2Q06481 763 aa24.99■■□□□ 1.59
TPTEP1-202ENST00000400593 MAP3K1Q13233 1512 aa24.97■■□□□ 1.59
TPTEP1-202ENST00000400593 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.95■■□□□ 1.59
TPTEP1-202ENST00000400593 CERKQ8TCT0 537 aa24.95■■□□□ 1.59
TPTEP1-202ENST00000400593 TIAM1Q13009 1591 aa24.95■■□□□ 1.59
TPTEP1-202ENST00000400593 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TPTEP1-202ENST00000400593 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TPTEP1-202ENST00000400593 HSPA2P54652 639 aa24.92■■□□□ 1.58
TPTEP1-202ENST00000400593 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms