RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.07■■■□□ 2.24
SEH1L-202ENST00000399892 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.06■■■□□ 2.24
SEH1L-202ENST00000399892 IQGAP2Q13576 1575 aa29.03■■■□□ 2.24
SEH1L-202ENST00000399892 JPH4Q96JJ6 628 aa29.03■■■□□ 2.24
SEH1L-202ENST00000399892 ARHGEF11O15085 1522 aa29.01■■■□□ 2.23
SEH1L-202ENST00000399892 SHROOM2Q13796 1616 aa29■■■□□ 2.23
SEH1L-202ENST00000399892 GOLGA3Q08378 1498 aa29■■■□□ 2.23
SEH1L-202ENST00000399892 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.99■■■□□ 2.23
SEH1L-202ENST00000399892 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.99■■■□□ 2.23
SEH1L-202ENST00000399892 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.99■■■□□ 2.23
SEH1L-202ENST00000399892 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
SEH1L-202ENST00000399892 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
SEH1L-202ENST00000399892 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.87■■■□□ 2.21
SEH1L-202ENST00000399892 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.84■■■□□ 2.21
SEH1L-202ENST00000399892 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.83■■■□□ 2.21
SEH1L-202ENST00000399892 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
SEH1L-202ENST00000399892 ARAP1Q96P48 1450 aa28.78■■■□□ 2.2
SEH1L-202ENST00000399892 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.78■■■□□ 2.2
SEH1L-202ENST00000399892 DISP1Q96F81 1524 aa28.74■■■□□ 2.19
SEH1L-202ENST00000399892 KIAA0556O60303 1618 aa28.73■■■□□ 2.19
SEH1L-202ENST00000399892 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
SEH1L-202ENST00000399892 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.69■■■□□ 2.18
SEH1L-202ENST00000399892 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.67■■■□□ 2.18
SEH1L-202ENST00000399892 P3H3Q8IVL6 736 aa28.65■■■□□ 2.18
SEH1L-202ENST00000399892 PTPRGP23470 1445 aa28.65■■■□□ 2.18
SEH1L-202ENST00000399892 SAMD9Q5K651 1589 aa28.63■■■□□ 2.17
SEH1L-202ENST00000399892 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.62■■■□□ 2.17
SEH1L-202ENST00000399892 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.52■■■□□ 2.16
SEH1L-202ENST00000399892 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.49■■■□□ 2.15
SEH1L-202ENST00000399892 CLIP1P30622 1438 aa28.49■■■□□ 2.15
SEH1L-202ENST00000399892 UACAQ9BZF9 1416 aa28.45■■■□□ 2.15
SEH1L-202ENST00000399892 CEP162Q5TB80 1403 aa28.45■■■□□ 2.14
SEH1L-202ENST00000399892 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.43■■■□□ 2.14
SEH1L-202ENST00000399892 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
SEH1L-202ENST00000399892 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.41■■■□□ 2.14
SEH1L-202ENST00000399892 ABCC2Q92887 1545 aa28.39■■■□□ 2.13
SEH1L-202ENST00000399892 FMN1Q68DA7 1419 aa28.37■■■□□ 2.13
SEH1L-202ENST00000399892 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.37■■■□□ 2.13
SEH1L-202ENST00000399892 ABCA8O94911 1581 aa28.36■■■□□ 2.13
SEH1L-202ENST00000399892 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.34■■■□□ 2.13
SEH1L-202ENST00000399892 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SEH1L-202ENST00000399892 ARID3CA6NKF2 412 aa28.25■■■□□ 2.11
SEH1L-202ENST00000399892 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.24■■■□□ 2.11
SEH1L-202ENST00000399892 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SEH1L-202ENST00000399892 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
SEH1L-202ENST00000399892 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
SEH1L-202ENST00000399892 HECW1Q76N89 1606 aa28.2■■■□□ 2.1
SEH1L-202ENST00000399892 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
SEH1L-202ENST00000399892 MAPKBP1O60336 1514 aa28.17■■■□□ 2.1
SEH1L-202ENST00000399892 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SEH1L-202ENST00000399892 ATP10BO94823 1461 aa28.14■■■□□ 2.1
SEH1L-202ENST00000399892 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.14■■■□□ 2.1
SEH1L-202ENST00000399892 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
SEH1L-202ENST00000399892 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.12■■■□□ 2.09
SEH1L-202ENST00000399892 ASXL2Q76L83 1435 aa28.12■■■□□ 2.09
SEH1L-202ENST00000399892 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.07■■■□□ 2.08
SEH1L-202ENST00000399892 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SEH1L-202ENST00000399892 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SEH1L-202ENST00000399892 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.03■■■□□ 2.08
SEH1L-202ENST00000399892 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.03■■■□□ 2.08
SEH1L-202ENST00000399892 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.03■■■□□ 2.08
SEH1L-202ENST00000399892 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.02■■■□□ 2.08
SEH1L-202ENST00000399892 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SEH1L-202ENST00000399892 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28■■■□□ 2.07
SEH1L-202ENST00000399892 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.99■■■□□ 2.07
SEH1L-202ENST00000399892 KCNH8Q96L42 1107 aa27.99■■■□□ 2.07
SEH1L-202ENST00000399892 DIP2BQ9P265 1576 aa27.97■■■□□ 2.07
SEH1L-202ENST00000399892 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.97■■■□□ 2.07
SEH1L-202ENST00000399892 APLP2Q06481 763 aa27.88■■■□□ 2.05
SEH1L-202ENST00000399892 GLI2P10070 1586 aa27.87■■■□□ 2.05
SEH1L-202ENST00000399892 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SEH1L-202ENST00000399892 TSPOAP1O95153 1857 aa27.83■■■□□ 2.05
SEH1L-202ENST00000399892 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.82■■■□□ 2.04
SEH1L-202ENST00000399892 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.82■■■□□ 2.04
SEH1L-202ENST00000399892 TIAM1Q13009 1591 aa27.81■■■□□ 2.04
SEH1L-202ENST00000399892 KIF14Q15058 1648 aa27.79■■■□□ 2.04
SEH1L-202ENST00000399892 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.78■■■□□ 2.04
SEH1L-202ENST00000399892 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.78■■■□□ 2.04
SEH1L-202ENST00000399892 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.77■■■□□ 2.04
SEH1L-202ENST00000399892 CD109Q6YHK3 1445 aa27.75■■■□□ 2.03
SEH1L-202ENST00000399892 MAP3K1Q13233 1512 aa27.74■■■□□ 2.03
SEH1L-202ENST00000399892 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.73■■■□□ 2.03
SEH1L-202ENST00000399892 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.032e-7■■■■□ 26.2
SEH1L-202ENST00000399892 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.71■■■□□ 2.03
SEH1L-202ENST00000399892 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.68■■■□□ 2.02
SEH1L-202ENST00000399892 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.66■■■□□ 2.02
SEH1L-202ENST00000399892 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SEH1L-202ENST00000399892 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.65■■■□□ 2.02
SEH1L-202ENST00000399892 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
SEH1L-202ENST00000399892 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
SEH1L-202ENST00000399892 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.57■■■□□ 2
SEH1L-202ENST00000399892 PLCH2O75038 1416 aa27.57■■■□□ 2
SEH1L-202ENST00000399892 NCOA2Q15596 1464 aa27.56■■■□□ 2
SEH1L-202ENST00000399892 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.55■■■□□ 2
SEH1L-202ENST00000399892 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.55■■■□□ 2
SEH1L-202ENST00000399892 FANCAO15360 1455 aa27.54■■■□□ 2
SEH1L-202ENST00000399892 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.54■■■□□ 2
SEH1L-202ENST00000399892 PREX2Q70Z35 1606 aa27.53■■■□□ 2
SEH1L-202ENST00000399892 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.52■■■□□ 2
SEH1L-202ENST00000399892 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms