RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399494.5

HMGB1-205, Transcript of high mobility group box 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HMGB1, Length 1,282 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1-205ENST00000399494 KIF27Q86VH2 1401 aa49.89■■■■■ 5.58
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HMGB1-205ENST00000399494 NEO1Q92859 1461 aa47.58■■■■■ 5.21
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HMGB1-205ENST00000399494 ADAMTSL3P82987 1691 aa47.29■■■■■ 5.16
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HMGB1-205ENST00000399494 CFAP74Q9C0B2 1584 aa47.13■■■■■ 5.14
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HMGB1-205ENST00000399494 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.94■■■■■ 5.1
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HMGB1-205ENST00000399494 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.87■■■■■ 5.09
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