RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398977.2

MSANTD3-204, Transcript of Myb/SANT DNA binding domain containing 3, human

TSL 3

Gene MSANTD3, Length 780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSANTD3-204	ENST00000398977	IGF1R	P08069	1367 aa		43.89	■■■■■ 4.62
MSANTD3-204	ENST00000398977	CUL7	Q14999	1698 aa		43.85	■■■■■ 4.61
MSANTD3-204	ENST00000398977	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.74	■■■■■ 4.59
MSANTD3-204	ENST00000398977	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		43.6	■■■■■ 4.57
MSANTD3-204	ENST00000398977	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.55	■■■■■ 4.56
MSANTD3-204	ENST00000398977	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.5	■■■■■ 4.55
MSANTD3-204	ENST00000398977	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.44	■■■■■ 4.54
MSANTD3-204	ENST00000398977	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.43	■■■■■ 4.54
MSANTD3-204	ENST00000398977	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.38	■■■■■ 4.54
MSANTD3-204	ENST00000398977	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.35	■■■■■ 4.53
MSANTD3-204	ENST00000398977	PTPRG	P23470	1445 aa		43.31	■■■■■ 4.52
MSANTD3-204	ENST00000398977	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.3	■■■■■ 4.52
MSANTD3-204	ENST00000398977	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.29	■■■■■ 4.52
MSANTD3-204	ENST00000398977	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.29	■■■■■ 4.52
MSANTD3-204	ENST00000398977	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.25	■■■■■ 4.51
MSANTD3-204	ENST00000398977	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.23	■■■■■ 4.51
MSANTD3-204	ENST00000398977	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.15	■■■■■ 4.5
MSANTD3-204	ENST00000398977	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.13	■■■■■ 4.5
MSANTD3-204	ENST00000398977	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	43.13	■■■■■ 4.49
MSANTD3-204	ENST00000398977	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.11	■■■■■ 4.49
MSANTD3-204	ENST00000398977	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.08	■■■■■ 4.49
MSANTD3-204	ENST00000398977	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.04	■■■■■ 4.48
MSANTD3-204	ENST00000398977	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.99	■■■■■ 4.47
MSANTD3-204	ENST00000398977	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.97	■■■■■ 4.47
MSANTD3-204	ENST00000398977	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.94	■■■■■ 4.46
MSANTD3-204	ENST00000398977	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.93	■■■■■ 4.46
MSANTD3-204	ENST00000398977	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.91	■■■■■ 4.46
MSANTD3-204	ENST00000398977	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.89	■■■■■ 4.46
MSANTD3-204	ENST00000398977	KDM6B	O15054	1643 aa		42.88	■■■■■ 4.45
MSANTD3-204	ENST00000398977	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.84	■■■■■ 4.45
MSANTD3-204	ENST00000398977	GLI2	P10070	1586 aa		42.82	■■■■■ 4.45
MSANTD3-204	ENST00000398977	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.82	■■■■■ 4.45
MSANTD3-204	ENST00000398977	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
MSANTD3-204	ENST00000398977	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.73	■■■■■ 4.43
MSANTD3-204	ENST00000398977	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.7	■■■■■ 4.43
MSANTD3-204	ENST00000398977	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
MSANTD3-204	ENST00000398977	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.59	■■■■■ 4.41
MSANTD3-204	ENST00000398977	ABCA8	O94911	1581 aa		42.56	■■■■■ 4.4
MSANTD3-204	ENST00000398977	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.54	■■■■■ 4.4
MSANTD3-204	ENST00000398977	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MSANTD3-204	ENST00000398977	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.45	■■■■■ 4.39
MSANTD3-204	ENST00000398977	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.38
MSANTD3-204	ENST00000398977	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.37	■■■■■ 4.37
MSANTD3-204	ENST00000398977	EEA1	Q15075	1411 aa		42.34	■■■■■ 4.37
MSANTD3-204	ENST00000398977	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.3	■■■■■ 4.36
MSANTD3-204	ENST00000398977	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.28	■■■■■ 4.36
MSANTD3-204	ENST00000398977	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.28	■■■■■ 4.36
MSANTD3-204	ENST00000398977	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
MSANTD3-204	ENST00000398977	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MSANTD3-204	ENST00000398977	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MSANTD3-204	ENST00000398977	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MSANTD3-204	ENST00000398977	ATP10B	O94823	1461 aa		42.18	■■■■■ 4.34
MSANTD3-204	ENST00000398977	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.14	■■■■■ 4.34
MSANTD3-204	ENST00000398977	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.11	■■■■■ 4.33
MSANTD3-204	ENST00000398977	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.11	■■■■■ 4.33
MSANTD3-204	ENST00000398977	KIF21B	O75037	1637 aa		42.02	■■■■■ 4.32
MSANTD3-204	ENST00000398977	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.99	■■■■■ 4.31
MSANTD3-204	ENST00000398977	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.98	■■■■■ 4.31
MSANTD3-204	ENST00000398977	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.97	■■■■■ 4.31
MSANTD3-204	ENST00000398977	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
MSANTD3-204	ENST00000398977	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MSANTD3-204	ENST00000398977	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MSANTD3-204	ENST00000398977	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.87	■■■■■ 4.29
MSANTD3-204	ENST00000398977	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.87	■■■■■ 4.29
MSANTD3-204	ENST00000398977	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.82	■■■■■ 4.29
MSANTD3-204	ENST00000398977	NEO1	Q92859	1461 aa		41.76	■■■■■ 4.28
MSANTD3-204	ENST00000398977	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.71	■■■■■ 4.27
MSANTD3-204	ENST00000398977	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.66	■■■■■ 4.26
MSANTD3-204	ENST00000398977	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.61	■■■■■ 4.25
MSANTD3-204	ENST00000398977	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.6	■■■■■ 4.25
MSANTD3-204	ENST00000398977	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.59	■■■■■ 4.25
MSANTD3-204	ENST00000398977	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.59	■■■■■ 4.25
MSANTD3-204	ENST00000398977	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
MSANTD3-204	ENST00000398977	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.55	■■■■■ 4.24	2e-7	■■■■□ 26.2
MSANTD3-204	ENST00000398977	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.51	■■■■■ 4.24
MSANTD3-204	ENST00000398977	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.51	■■■■■ 4.24
MSANTD3-204	ENST00000398977	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.51	■■■■■ 4.24
MSANTD3-204	ENST00000398977	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.5	■■■■■ 4.23
MSANTD3-204	ENST00000398977	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.48	■■■■■ 4.23
MSANTD3-204	ENST00000398977	FANCA	O15360	1455 aa		41.47	■■■■■ 4.23
MSANTD3-204	ENST00000398977	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.45	■■■■■ 4.23
MSANTD3-204	ENST00000398977	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.45	■■■■■ 4.23
MSANTD3-204	ENST00000398977	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.44	■■■■■ 4.22
MSANTD3-204	ENST00000398977	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.41	■■■■■ 4.22
MSANTD3-204	ENST00000398977	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.39	■■■■■ 4.22
MSANTD3-204	ENST00000398977	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.39	■■■■■ 4.22
MSANTD3-204	ENST00000398977	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.34	■■■■■ 4.21
MSANTD3-204	ENST00000398977	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.31	■■■■■ 4.2
MSANTD3-204	ENST00000398977	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.29	■■■■■ 4.2
MSANTD3-204	ENST00000398977	PLCH2	O75038	1416 aa		41.29	■■■■■ 4.2
MSANTD3-204	ENST00000398977	PTPRM	P28827	1452 aa		41.28	■■■■■ 4.2
MSANTD3-204	ENST00000398977	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.25	■■■■■ 4.19
MSANTD3-204	ENST00000398977	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.25	■■■■■ 4.19
MSANTD3-204	ENST00000398977	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.21	■■■■■ 4.19
MSANTD3-204	ENST00000398977	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.2	■■■■■ 4.19
MSANTD3-204	ENST00000398977	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.19	■■■■■ 4.18
MSANTD3-204	ENST00000398977	KIF14	Q15058	1648 aa		41.19	■■■■■ 4.18
MSANTD3-204	ENST00000398977	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.18	■■■■■ 4.18
MSANTD3-204	ENST00000398977	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.17	■■■■■ 4.18
MSANTD3-204	ENST00000398977	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.17	■■■■■ 4.18

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