RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398977.2

MSANTD3-204, Transcript of Myb/SANT DNA binding domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene MSANTD3, Length 780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3-204ENST00000398977 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.87■■■■■ 7.66
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MSANTD3-204ENST00000398977 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.9■■■■■ 6.06
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MSANTD3-204ENST00000398977 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.65■■■■■ 5.7
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MSANTD3-204ENST00000398977 SMARCA2P51531 1590 aa48.93■■■■■ 5.42
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MSANTD3-204ENST00000398977 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.21■■■■■ 5.31
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MSANTD3-204ENST00000398977 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.73■■■■■ 5.23
MSANTD3-204ENST00000398977 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.66■■■■■ 5.22
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MSANTD3-204ENST00000398977 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.19■■■■■ 5.14
MSANTD3-204ENST00000398977 CFTRP13569 1480 aa47.17■■■■■ 5.14
MSANTD3-204ENST00000398977 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.14■■■■■ 5.14
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MSANTD3-204ENST00000398977 IFT140Q96RY7 1462 aa46.24■■■■■ 4.99
MSANTD3-204ENST00000398977 OSCARQ8IYS5 282 aa46.18■■■■■ 4.98
MSANTD3-204ENST00000398977 ABCC8Q09428 1581 aa46.17■■■■■ 4.98
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MSANTD3-204ENST00000398977 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.12■■■■■ 4.97
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MSANTD3-204ENST00000398977 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.61■■■■■ 4.89
MSANTD3-204ENST00000398977 SOGA1O94964 1423 aa45.56■■■■■ 4.88
MSANTD3-204ENST00000398977 CHD1O14646 1710 aa45.53■■■■■ 4.88
MSANTD3-204ENST00000398977 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.53■■■■■ 4.88
MSANTD3-204ENST00000398977 CUX1P39880 1505 aa45.52■■■■■ 4.88
MSANTD3-204ENST00000398977 ARHGEF11O15085 1522 aa45.5■■■■■ 4.87
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MSANTD3-204ENST00000398977 GRIN2BQ13224 1484 aa45.18■■■■■ 4.82
MSANTD3-204ENST00000398977 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.08■■■■■ 4.81
MSANTD3-204ENST00000398977 ARAP1Q96P48 1450 aa45.06■■■■■ 4.8
MSANTD3-204ENST00000398977 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.05■■■■■ 4.8
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MSANTD3-204ENST00000398977 SYNJ2O15056 1496 aa45.03■■■■■ 4.8
MSANTD3-204ENST00000398977 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.03■■■■■ 4.8
MSANTD3-204ENST00000398977 PBRM1Q86U86 1689 aa45.02■■■■■ 4.8
MSANTD3-204ENST00000398977 SYNJ1O43426 1573 aa45.01■■■■■ 4.8
MSANTD3-204ENST00000398977 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.97■■■■■ 4.79
MSANTD3-204ENST00000398977 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.85■■■■■ 4.77
MSANTD3-204ENST00000398977 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.83■■■■■ 4.77
MSANTD3-204ENST00000398977 TOP2BQ02880 1626 aa44.83■■■■■ 4.77
MSANTD3-204ENST00000398977 ADAMTS12P58397 1594 aa44.62■■■■■ 4.73
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MSANTD3-204ENST00000398977 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.47■■■■■ 4.71
MSANTD3-204ENST00000398977 NUP160Q12769 1436 aa44.47■■■■■ 4.71
MSANTD3-204ENST00000398977 CEP170Q5SW79 1584 aa44.44■■■■■ 4.71
MSANTD3-204ENST00000398977 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.31■■■■■ 4.68
MSANTD3-204ENST00000398977 SHROOM2Q13796 1616 aa44.26■■■■■ 4.68
MSANTD3-204ENST00000398977 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
MSANTD3-204ENST00000398977 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.99■■■■■ 4.63
MSANTD3-204ENST00000398977 KIF27Q86VH2 1401 aa43.94■■■■■ 4.62
MSANTD3-204ENST00000398977 JPH4Q96JJ6 628 aa43.94■■■■■ 4.62
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