RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 JPH4Q96JJ6 628 aa34.54■■■■□ 3.12
ANKRD39-201ENST00000393537 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.47■■■■□ 3.11
ANKRD39-201ENST00000393537 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
ANKRD39-201ENST00000393537 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD39-201ENST00000393537 IQGAP2Q13576 1575 aa34.26■■■■□ 3.07
ANKRD39-201ENST00000393537 PRXQ9BXM0 1461 aa34.13■■■■□ 3.05
ANKRD39-201ENST00000393537 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.13■■■■□ 3.05
ANKRD39-201ENST00000393537 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.08■■■■□ 3.05
ANKRD39-201ENST00000393537 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.06■■■■□ 3.04
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPRGP23470 1445 aa34.05■■■■□ 3.04
ANKRD39-201ENST00000393537 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.04■■■■□ 3.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.03■■■■□ 3.04
ANKRD39-201ENST00000393537 DISP1Q96F81 1524 aa34.03■■■■□ 3.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.01■■■■□ 3.03
ANKRD39-201ENST00000393537 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.98■■■■□ 3.03
ANKRD39-201ENST00000393537 EEA1Q15075 1411 aa33.97■■■■□ 3.03
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA0556O60303 1618 aa33.94■■■■□ 3.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.92■■■■□ 3.02
ANKRD39-201ENST00000393537 MAPKBP1O60336 1514 aa33.88■■■■□ 3.01
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.87■■■■□ 3.01
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA3Q08378 1498 aa33.82■■■■□ 3.01
ANKRD39-201ENST00000393537 UACAQ9BZF9 1416 aa33.81■■■■□ 3
ANKRD39-201ENST00000393537 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.79■■■■□ 3
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCC2Q92887 1545 aa33.79■■■■□ 3
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.77■■■■□ 3
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.73■■■□□ 2.99
ANKRD39-201ENST00000393537 DIP2BQ9P265 1576 aa33.72■■■□□ 2.99
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF21BO75037 1637 aa33.69■■■□□ 2.98
ANKRD39-201ENST00000393537 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.63■■■□□ 2.97
ANKRD39-201ENST00000393537 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.63■■■□□ 2.97
ANKRD39-201ENST00000393537 ASXL2Q76L83 1435 aa33.62■■■□□ 2.97
ANKRD39-201ENST00000393537 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
ANKRD39-201ENST00000393537 P3H3Q8IVL6 736 aa33.6■■■□□ 2.97
ANKRD39-201ENST00000393537 SAMD9Q5K651 1589 aa33.6■■■□□ 2.97
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCA8O94911 1581 aa33.59■■■□□ 2.97
ANKRD39-201ENST00000393537 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPOAP1O95153 1857 aa33.52■■■□□ 2.96
ANKRD39-201ENST00000393537 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.49■■■□□ 2.95
ANKRD39-201ENST00000393537 GLI2P10070 1586 aa33.46■■■□□ 2.95
ANKRD39-201ENST00000393537 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
ANKRD39-201ENST00000393537 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.39■■■□□ 2.94
ANKRD39-201ENST00000393537 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.38■■■□□ 2.93
ANKRD39-201ENST00000393537 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.37■■■□□ 2.93
ANKRD39-201ENST00000393537 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.35■■■□□ 2.93
ANKRD39-201ENST00000393537 ARID3CA6NKF2 412 aa33.34■■■□□ 2.93
ANKRD39-201ENST00000393537 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.31■■■□□ 2.92
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP10BO94823 1461 aa33.3■■■□□ 2.92
ANKRD39-201ENST00000393537 KDM6BO15054 1643 aa33.29■■■□□ 2.92
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNH8Q96L42 1107 aa33.25■■■□□ 2.91
ANKRD39-201ENST00000393537 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.17■■■□□ 2.9
ANKRD39-201ENST00000393537 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.17■■■□□ 2.9
ANKRD39-201ENST00000393537 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
ANKRD39-201ENST00000393537 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.15■■■□□ 2.9
ANKRD39-201ENST00000393537 CD109Q6YHK3 1445 aa33.12■■■□□ 2.89
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.07■■■□□ 2.88
ANKRD39-201ENST00000393537 FMN1Q68DA7 1419 aa33.05■■■□□ 2.88
ANKRD39-201ENST00000393537 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.02■■■□□ 2.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.97■■■□□ 2.87
ANKRD39-201ENST00000393537 HECW1Q76N89 1606 aa32.97■■■□□ 2.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
ANKRD39-201ENST00000393537 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CLIP1P30622 1438 aa32.85■■■□□ 2.85
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.81■■■□□ 2.84
ANKRD39-201ENST00000393537 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.81■■■□□ 2.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.79■■■□□ 2.84
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.78■■■□□ 2.84
ANKRD39-201ENST00000393537 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.77■■■□□ 2.84
ANKRD39-201ENST00000393537 NEO1Q92859 1461 aa32.77■■■□□ 2.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.77■■■□□ 2.84
ANKRD39-201ENST00000393537 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.67■■■□□ 2.82
ANKRD39-201ENST00000393537 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.67■■■□□ 2.82
ANKRD39-201ENST00000393537 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.66■■■□□ 2.82
ANKRD39-201ENST00000393537 FANCAO15360 1455 aa32.66■■■□□ 2.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.66■■■□□ 2.82
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF14Q15058 1648 aa32.66■■■□□ 2.82
ANKRD39-201ENST00000393537 RAPGEF3O95398 923 aa32.63■■■□□ 2.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP162Q5TB80 1403 aa32.61■■■□□ 2.81
ANKRD39-201ENST00000393537 AKNAQ7Z591 1439 aa32.61■■■□□ 2.81
ANKRD39-201ENST00000393537 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.6■■■□□ 2.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PLCH2O75038 1416 aa32.59■■■□□ 2.81
ANKRD39-201ENST00000393537 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.58■■■□□ 2.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRL1O94910 1474 aa32.58■■■□□ 2.81
ANKRD39-201ENST00000393537 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.55■■■□□ 2.8
ANKRD39-201ENST00000393537 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
ANKRD39-201ENST00000393537 RICTORQ6R327 1708 aa32.52■■■□□ 2.8
ANKRD39-201ENST00000393537 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.47■■■□□ 2.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.45■■■□□ 2.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.5 ms