RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 JPH4Q96JJ6 628 aa35.19■■■■□ 3.22
UBE2E3-201ENST00000392415 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.12■■■■□ 3.21
UBE2E3-201ENST00000392415 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.96■■■■□ 3.19
UBE2E3-201ENST00000392415 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
UBE2E3-201ENST00000392415 IQGAP2Q13576 1575 aa34.85■■■■□ 3.17
UBE2E3-201ENST00000392415 PRXQ9BXM0 1461 aa34.77■■■■□ 3.16
UBE2E3-201ENST00000392415 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.74■■■■□ 3.15
UBE2E3-201ENST00000392415 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.67■■■■□ 3.14
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRGP23470 1445 aa34.66■■■■□ 3.14
UBE2E3-201ENST00000392415 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.66■■■■□ 3.14
UBE2E3-201ENST00000392415 DISP1Q96F81 1524 aa34.65■■■■□ 3.14
UBE2E3-201ENST00000392415 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.65■■■■□ 3.14
UBE2E3-201ENST00000392415 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.64■■■■□ 3.14
UBE2E3-201ENST00000392415 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.64■■■■□ 3.14
UBE2E3-201ENST00000392415 EEA1Q15075 1411 aa34.61■■■■□ 3.13
UBE2E3-201ENST00000392415 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
UBE2E3-201ENST00000392415 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
UBE2E3-201ENST00000392415 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.54■■■■□ 3.12
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA0556O60303 1618 aa34.53■■■■□ 3.12
UBE2E3-201ENST00000392415 MAPKBP1O60336 1514 aa34.51■■■■□ 3.11
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.46■■■■□ 3.11
UBE2E3-201ENST00000392415 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.43■■■■□ 3.1
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA3Q08378 1498 aa34.43■■■■□ 3.1
UBE2E3-201ENST00000392415 UACAQ9BZF9 1416 aa34.42■■■■□ 3.1
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCC2Q92887 1545 aa34.41■■■■□ 3.1
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.4■■■■□ 3.1
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.32■■■■□ 3.09
UBE2E3-201ENST00000392415 DIP2BQ9P265 1576 aa34.32■■■■□ 3.08
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF21BO75037 1637 aa34.28■■■■□ 3.08
UBE2E3-201ENST00000392415 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.27■■■■□ 3.08
UBE2E3-201ENST00000392415 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.23■■■■□ 3.07
UBE2E3-201ENST00000392415 ASXL2Q76L83 1435 aa34.22■■■■□ 3.07
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCA8O94911 1581 aa34.19■■■■□ 3.06
UBE2E3-201ENST00000392415 SAMD9Q5K651 1589 aa34.19■■■■□ 3.06
UBE2E3-201ENST00000392415 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
UBE2E3-201ENST00000392415 P3H3Q8IVL6 736 aa34.15■■■■□ 3.06
UBE2E3-201ENST00000392415 GLI2P10070 1586 aa34.08■■■■□ 3.05
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPOAP1O95153 1857 aa34.05■■■■□ 3.04
UBE2E3-201ENST00000392415 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
UBE2E3-201ENST00000392415 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.99■■■■□ 3.03
UBE2E3-201ENST00000392415 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
UBE2E3-201ENST00000392415 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.96■■■■□ 3.03
UBE2E3-201ENST00000392415 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.96■■■■□ 3.03
UBE2E3-201ENST00000392415 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.95■■■■□ 3.03
UBE2E3-201ENST00000392415 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.92■■■■□ 3.02
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP10BO94823 1461 aa33.91■■■■□ 3.02
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.91■■■■□ 3.02
UBE2E3-201ENST00000392415 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
UBE2E3-201ENST00000392415 KDM6BO15054 1643 aa33.85■■■■□ 3.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ARID3CA6NKF2 412 aa33.84■■■■□ 3.01
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNH8Q96L42 1107 aa33.81■■■■□ 3
UBE2E3-201ENST00000392415 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.76■■■□□ 2.99
UBE2E3-201ENST00000392415 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.75■■■□□ 2.99
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.75■■■□□ 2.99
UBE2E3-201ENST00000392415 CD109Q6YHK3 1445 aa33.72■■■□□ 2.99
UBE2E3-201ENST00000392415 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
UBE2E3-201ENST00000392415 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.69■■■□□ 2.98
UBE2E3-201ENST00000392415 FMN1Q68DA7 1419 aa33.66■■■□□ 2.98
UBE2E3-201ENST00000392415 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.61■■■□□ 2.97
UBE2E3-201ENST00000392415 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.57■■■□□ 2.97
UBE2E3-201ENST00000392415 HECW1Q76N89 1606 aa33.52■■■□□ 2.96
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
UBE2E3-201ENST00000392415 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
UBE2E3-201ENST00000392415 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.42■■■□□ 2.94
UBE2E3-201ENST00000392415 CLIP1P30622 1438 aa33.41■■■□□ 2.94
UBE2E3-201ENST00000392415 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.41■■■□□ 2.94
UBE2E3-201ENST00000392415 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.39■■■□□ 2.94
UBE2E3-201ENST00000392415 NEO1Q92859 1461 aa33.37■■■□□ 2.93
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.36■■■□□ 2.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.36■■■□□ 2.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
UBE2E3-201ENST00000392415 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.93
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.32■■■□□ 2.93
UBE2E3-201ENST00000392415 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.27■■■□□ 2.92
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.26■■■□□ 2.92
UBE2E3-201ENST00000392415 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
UBE2E3-201ENST00000392415 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.25■■■□□ 2.91
UBE2E3-201ENST00000392415 FANCAO15360 1455 aa33.23■■■□□ 2.91
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.22■■■□□ 2.91
UBE2E3-201ENST00000392415 PLCH2O75038 1416 aa33.2■■■□□ 2.91
UBE2E3-201ENST00000392415 AKNAQ7Z591 1439 aa33.2■■■□□ 2.91
UBE2E3-201ENST00000392415 RAPGEF3O95398 923 aa33.2■■■□□ 2.91
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF14Q15058 1648 aa33.2■■■□□ 2.9
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP162Q5TB80 1403 aa33.17■■■□□ 2.9
UBE2E3-201ENST00000392415 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.15■■■□□ 2.9
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.14■■■□□ 2.9
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRL1O94910 1474 aa33.13■■■□□ 2.89
UBE2E3-201ENST00000392415 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.11■■■□□ 2.89
UBE2E3-201ENST00000392415 RICTORQ6R327 1708 aa33.09■■■□□ 2.89
UBE2E3-201ENST00000392415 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.07■■■□□ 2.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.01■■■□□ 2.87
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.99■■■□□ 2.87
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