RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

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Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.9□□□□□ -1.46
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SNORD17-201ENST00000390930 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa5.89□□□□□ -1.47
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SNORD17-201ENST00000390930 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.74□□□□□ -1.49
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SNORD17-201ENST00000390930 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa5.72□□□□□ -1.49
SNORD17-201ENST00000390930 ABCC10Q5T3U5 1492 aa5.71□□□□□ -1.49
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SNORD17-201ENST00000390930 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5not detected■□□□□ 10.1
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SNORD17-201ENST00000390930 CD109Q6YHK3 1445 aa5.63□□□□□ -1.51
SNORD17-201ENST00000390930 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.63□□□□□ -1.51
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SNORD17-201ENST00000390930 RICTORQ6R327 1708 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD17-201ENST00000390930 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SNORD17-201ENST00000390930 FANCAO15360 1455 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD17-201ENST00000390930 TIAM1Q13009 1591 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD17-201ENST00000390930 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD17-201ENST00000390930 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD17-201ENST00000390930 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SNORD17-201ENST00000390930 PREX2Q70Z35 1606 aa5.54□□□□□ -1.52
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