RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
SNX15-202ENST00000377244 CEP170Q5SW79 1584 aa40.89■■■■■ 4.14
SNX15-202ENST00000377244 CEP162Q5TB80 1403 aa40.88■■■■■ 4.14
SNX15-202ENST00000377244 NUP160Q12769 1436 aa40.82■■■■■ 4.13
SNX15-202ENST00000377244 IQGAP2Q13576 1575 aa40.74■■■■■ 4.11
SNX15-202ENST00000377244 CLIP1P30622 1438 aa40.73■■■■■ 4.11
SNX15-202ENST00000377244 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.73■■■■■ 4.11
SNX15-202ENST00000377244 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.59■■■■■ 4.09
SNX15-202ENST00000377244 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.51■■■■■ 4.08
SNX15-202ENST00000377244 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.51■■■■■ 4.08
SNX15-202ENST00000377244 P3H3Q8IVL6 736 aa40.49■■■■■ 4.07
SNX15-202ENST00000377244 SAMD9Q5K651 1589 aa40.48■■■■■ 4.07
SNX15-202ENST00000377244 ARAP1Q96P48 1450 aa40.47■■■■■ 4.07
SNX15-202ENST00000377244 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.47■■■■■ 4.07
SNX15-202ENST00000377244 JPH4Q96JJ6 628 aa40.46■■■■■ 4.07
SNX15-202ENST00000377244 OSCARQ8IYS5 282 aa40.42■■■■■ 4.06
SNX15-202ENST00000377244 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.4■■■■■ 4.06
SNX15-202ENST00000377244 DISP1Q96F81 1524 aa40.39■■■■■ 4.06
SNX15-202ENST00000377244 SHROOM2Q13796 1616 aa40.37■■■■■ 4.05
SNX15-202ENST00000377244 KIAA0556O60303 1618 aa40.35■■■■■ 4.05
SNX15-202ENST00000377244 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
SNX15-202ENST00000377244 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.25■■■■■ 4.03
SNX15-202ENST00000377244 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.23■■■■■ 4.03
SNX15-202ENST00000377244 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.23■■■■■ 4.03
SNX15-202ENST00000377244 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
SNX15-202ENST00000377244 FMN1Q68DA7 1419 aa40.09■■■■■ 4.01
SNX15-202ENST00000377244 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4
SNX15-202ENST00000377244 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.94■■■■□ 3.98
SNX15-202ENST00000377244 PTPRGP23470 1445 aa39.94■■■■□ 3.98
SNX15-202ENST00000377244 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
SNX15-202ENST00000377244 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.92■■■■□ 3.98
SNX15-202ENST00000377244 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.91■■■■□ 3.98
SNX15-202ENST00000377244 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.85■■■■□ 3.97
SNX15-202ENST00000377244 ARHGEF11O15085 1522 aa39.83■■■■□ 3.97
SNX15-202ENST00000377244 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.82■■■■□ 3.97
SNX15-202ENST00000377244 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
SNX15-202ENST00000377244 ABCA8O94911 1581 aa39.8■■■■□ 3.96
SNX15-202ENST00000377244 HECW1Q76N89 1606 aa39.8■■■■□ 3.96
SNX15-202ENST00000377244 APLP2Q06481 763 aa39.77■■■■□ 3.96
SNX15-202ENST00000377244 ARID3CA6NKF2 412 aa39.76■■■■□ 3.96
SNX15-202ENST00000377244 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
SNX15-202ENST00000377244 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.71■■■■□ 3.95
SNX15-202ENST00000377244 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.71■■■■□ 3.95
SNX15-202ENST00000377244 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.71■■■■□ 3.95
SNX15-202ENST00000377244 TIAM1Q13009 1591 aa39.7■■■■□ 3.95
SNX15-202ENST00000377244 UACAQ9BZF9 1416 aa39.7■■■■□ 3.95
SNX15-202ENST00000377244 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.68■■■■□ 3.94
SNX15-202ENST00000377244 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
SNX15-202ENST00000377244 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
SNX15-202ENST00000377244 ABCC2Q92887 1545 aa39.62■■■■□ 3.93
SNX15-202ENST00000377244 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
SNX15-202ENST00000377244 MAP3K1Q13233 1512 aa39.62■■■■□ 3.93
SNX15-202ENST00000377244 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.61■■■■□ 3.93
SNX15-202ENST00000377244 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.54■■■■□ 3.92
SNX15-202ENST00000377244 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.52■■■■□ 3.92
SNX15-202ENST00000377244 ATP10BO94823 1461 aa39.52■■■■□ 3.92
SNX15-202ENST00000377244 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.51■■■■□ 3.92
SNX15-202ENST00000377244 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
SNX15-202ENST00000377244 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
SNX15-202ENST00000377244 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.48■■■■□ 3.91
SNX15-202ENST00000377244 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.46■■■■□ 3.91
SNX15-202ENST00000377244 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.41■■■■□ 3.9
SNX15-202ENST00000377244 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
SNX15-202ENST00000377244 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.39■■■■□ 3.9
SNX15-202ENST00000377244 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.35■■■■□ 3.89
SNX15-202ENST00000377244 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
SNX15-202ENST00000377244 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
SNX15-202ENST00000377244 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.23■■■■□ 3.87
SNX15-202ENST00000377244 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
SNX15-202ENST00000377244 NCOA2Q15596 1464 aa39.18■■■■□ 3.86
SNX15-202ENST00000377244 KIF14Q15058 1648 aa39.18■■■■□ 3.86
SNX15-202ENST00000377244 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.16■■■■□ 3.86
SNX15-202ENST00000377244 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.15■■■■□ 3.86
SNX15-202ENST00000377244 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.15■■■■□ 3.86
SNX15-202ENST00000377244 ASXL2Q76L83 1435 aa39.08■■■■□ 3.85
SNX15-202ENST00000377244 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.06■■■■□ 3.84
SNX15-202ENST00000377244 KCNH8Q96L42 1107 aa39.04■■■■□ 3.84
SNX15-202ENST00000377244 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
SNX15-202ENST00000377244 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.97■■■■□ 3.83
SNX15-202ENST00000377244 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.95■■■■□ 3.83
SNX15-202ENST00000377244 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.94■■■■□ 3.82
SNX15-202ENST00000377244 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.94■■■■□ 3.82
SNX15-202ENST00000377244 MAPKBP1O60336 1514 aa38.93■■■■□ 3.82
SNX15-202ENST00000377244 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.93■■■■□ 3.82
SNX15-202ENST00000377244 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
SNX15-202ENST00000377244 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.89■■■■□ 3.82
SNX15-202ENST00000377244 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.89■■■■□ 3.82
SNX15-202ENST00000377244 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.87■■■■□ 3.81
SNX15-202ENST00000377244 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
SNX15-202ENST00000377244 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.83■■■■□ 3.81
SNX15-202ENST00000377244 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.77■■■■□ 3.8
SNX15-202ENST00000377244 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.77■■■■□ 3.8
SNX15-202ENST00000377244 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
SNX15-202ENST00000377244 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.76■■■■□ 3.8
SNX15-202ENST00000377244 PREX2Q70Z35 1606 aa38.76■■■■□ 3.8
SNX15-202ENST00000377244 MIA2Q96PC5 1412 aa38.75■■■■□ 3.79
SNX15-202ENST00000377244 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.74■■■■□ 3.79
SNX15-202ENST00000377244 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
SNX15-202ENST00000377244 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
SNX15-202ENST00000377244 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms