RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376707.4

VSX1-201, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 943 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-201ENST00000376707 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.54■■■■□ 3.44
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VSX1-201ENST00000376707 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.07■■■■□ 3.36
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VSX1-201ENST00000376707 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.29■■■■□ 3.24
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VSX1-201ENST00000376707 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
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VSX1-201ENST00000376707 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.28■■■■□ 3.08
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VSX1-201ENST00000376707 PTPRMP28827 1452 aa34.25■■■■□ 3.07
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