RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.54■■■■□ 3.76
PDSS1-201ENST00000376215 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.47■■■■□ 3.75
PDSS1-201ENST00000376215 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.45■■■■□ 3.75
PDSS1-201ENST00000376215 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
PDSS1-201ENST00000376215 IQGAP2Q13576 1575 aa38.41■■■■□ 3.74
PDSS1-201ENST00000376215 SHROOM2Q13796 1616 aa38.33■■■■□ 3.73
PDSS1-201ENST00000376215 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.28■■■■□ 3.72
PDSS1-201ENST00000376215 JPH4Q96JJ6 628 aa38.26■■■■□ 3.71
PDSS1-201ENST00000376215 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.22■■■■□ 3.71
PDSS1-201ENST00000376215 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
PDSS1-201ENST00000376215 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.14■■■■□ 3.7
PDSS1-201ENST00000376215 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
PDSS1-201ENST00000376215 DISP1Q96F81 1524 aa38.11■■■■□ 3.69
PDSS1-201ENST00000376215 SAMD9Q5K651 1589 aa38.08■■■■□ 3.69
PDSS1-201ENST00000376215 KIAA0556O60303 1618 aa38.05■■■■□ 3.68
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGEF11O15085 1522 aa38.05■■■■□ 3.68
PDSS1-201ENST00000376215 CEP162Q5TB80 1403 aa38.01■■■■□ 3.67
PDSS1-201ENST00000376215 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.99■■■■□ 3.67
PDSS1-201ENST00000376215 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.99■■■■□ 3.67
PDSS1-201ENST00000376215 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.99■■■■□ 3.67
PDSS1-201ENST00000376215 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.99■■■■□ 3.67
PDSS1-201ENST00000376215 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.99■■■■□ 3.67
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.97■■■■□ 3.67
PDSS1-201ENST00000376215 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.97■■■■□ 3.67
PDSS1-201ENST00000376215 CLIP1P30622 1438 aa37.96■■■■□ 3.67
PDSS1-201ENST00000376215 P3H3Q8IVL6 736 aa37.92■■■■□ 3.66
PDSS1-201ENST00000376215 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.87■■■■□ 3.65
PDSS1-201ENST00000376215 ARAP1Q96P48 1450 aa37.81■■■■□ 3.64
PDSS1-201ENST00000376215 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.63
PDSS1-201ENST00000376215 PTPRGP23470 1445 aa37.75■■■■□ 3.63
PDSS1-201ENST00000376215 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.61■■■■□ 3.61
PDSS1-201ENST00000376215 FMN1Q68DA7 1419 aa37.61■■■■□ 3.61
PDSS1-201ENST00000376215 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.6■■■■□ 3.61
PDSS1-201ENST00000376215 ABCA8O94911 1581 aa37.58■■■■□ 3.61
PDSS1-201ENST00000376215 UACAQ9BZF9 1416 aa37.54■■■■□ 3.6
PDSS1-201ENST00000376215 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.54■■■■□ 3.6
PDSS1-201ENST00000376215 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.52■■■■□ 3.6
PDSS1-201ENST00000376215 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
PDSS1-201ENST00000376215 ABCC2Q92887 1545 aa37.49■■■■□ 3.59
PDSS1-201ENST00000376215 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.47■■■■□ 3.59
PDSS1-201ENST00000376215 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.47■■■■□ 3.59
PDSS1-201ENST00000376215 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.43■■■■□ 3.58
PDSS1-201ENST00000376215 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
PDSS1-201ENST00000376215 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.39■■■■□ 3.58
PDSS1-201ENST00000376215 HECW1Q76N89 1606 aa37.38■■■■□ 3.57
PDSS1-201ENST00000376215 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.38■■■■□ 3.57
PDSS1-201ENST00000376215 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
PDSS1-201ENST00000376215 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.31■■■■□ 3.56
PDSS1-201ENST00000376215 ARID3CA6NKF2 412 aa37.29■■■■□ 3.56
PDSS1-201ENST00000376215 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
PDSS1-201ENST00000376215 ATP10BO94823 1461 aa37.26■■■■□ 3.56
PDSS1-201ENST00000376215 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
PDSS1-201ENST00000376215 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.18■■■■□ 3.54
PDSS1-201ENST00000376215 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
PDSS1-201ENST00000376215 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.12■■■■□ 3.53
PDSS1-201ENST00000376215 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
PDSS1-201ENST00000376215 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
PDSS1-201ENST00000376215 TIAM1Q13009 1591 aa37.09■■■■□ 3.53
PDSS1-201ENST00000376215 MAPKBP1O60336 1514 aa37.07■■■■□ 3.52
PDSS1-201ENST00000376215 ASXL2Q76L83 1435 aa37.04■■■■□ 3.52
PDSS1-201ENST00000376215 MAP3K1Q13233 1512 aa37.04■■■■□ 3.52
PDSS1-201ENST00000376215 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.02■■■■□ 3.52
PDSS1-201ENST00000376215 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.97■■■■□ 3.51
PDSS1-201ENST00000376215 APLP2Q06481 763 aa36.95■■■■□ 3.51
PDSS1-201ENST00000376215 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.94■■■■□ 3.5
PDSS1-201ENST00000376215 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
PDSS1-201ENST00000376215 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
PDSS1-201ENST00000376215 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.9■■■■□ 3.5
PDSS1-201ENST00000376215 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
PDSS1-201ENST00000376215 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.86■■■■□ 3.49
PDSS1-201ENST00000376215 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.86■■■■□ 3.49
PDSS1-201ENST00000376215 KIF14Q15058 1648 aa36.83■■■■□ 3.49
PDSS1-201ENST00000376215 KCNH8Q96L42 1107 aa36.82■■■■□ 3.49
PDSS1-201ENST00000376215 DIP2BQ9P265 1576 aa36.81■■■■□ 3.48
PDSS1-201ENST00000376215 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.79■■■■□ 3.48
PDSS1-201ENST00000376215 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.77■■■■□ 3.48
PDSS1-201ENST00000376215 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
PDSS1-201ENST00000376215 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.72■■■■□ 3.47
PDSS1-201ENST00000376215 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
PDSS1-201ENST00000376215 GLI2P10070 1586 aa36.71■■■■□ 3.47
PDSS1-201ENST00000376215 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.71■■■■□ 3.47
PDSS1-201ENST00000376215 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.7■■■■□ 3.47
PDSS1-201ENST00000376215 NCOA2Q15596 1464 aa36.66■■■■□ 3.46
PDSS1-201ENST00000376215 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.66■■■■□ 3.46
PDSS1-201ENST00000376215 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.63■■■■□ 3.45
PDSS1-201ENST00000376215 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.58■■■■□ 3.45
PDSS1-201ENST00000376215 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.56■■■■□ 3.44
PDSS1-201ENST00000376215 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
PDSS1-201ENST00000376215 CD109Q6YHK3 1445 aa36.53■■■■□ 3.44
PDSS1-201ENST00000376215 TSPOAP1O95153 1857 aa36.53■■■■□ 3.44
PDSS1-201ENST00000376215 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.51■■■■□ 3.43
PDSS1-201ENST00000376215 PREX2Q70Z35 1606 aa36.51■■■■□ 3.43
PDSS1-201ENST00000376215 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
PDSS1-201ENST00000376215 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.5■■■■□ 3.43
PDSS1-201ENST00000376215 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.49■■■■□ 3.43
PDSS1-201ENST00000376215 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
PDSS1-201ENST00000376215 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.47■■■■□ 3.43
PDSS1-201ENST00000376215 PLCH2O75038 1416 aa36.46■■■■□ 3.43
PDSS1-201ENST00000376215 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.43■■■■□ 3.42
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