RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372994.1

C9orf16-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf16, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-201ENST00000372994 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.78■■□□□ 1.72
C9orf16-201ENST00000372994 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
C9orf16-201ENST00000372994 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
C9orf16-201ENST00000372994 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf16-201ENST00000372994 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.57■■□□□ 1.68
C9orf16-201ENST00000372994 IQGAP2Q13576 1575 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf16-201ENST00000372994 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.47■■□□□ 1.67
C9orf16-201ENST00000372994 PTPRGP23470 1445 aa25.44■■□□□ 1.66
C9orf16-201ENST00000372994 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.42■■□□□ 1.66
C9orf16-201ENST00000372994 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
C9orf16-201ENST00000372994 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.42■■□□□ 1.66
C9orf16-201ENST00000372994 PRXQ9BXM0 1461 aa25.4■■□□□ 1.66
C9orf16-201ENST00000372994 DISP1Q96F81 1524 aa25.38■■□□□ 1.65
C9orf16-201ENST00000372994 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.38■■□□□ 1.65
C9orf16-201ENST00000372994 MAPKBP1O60336 1514 aa25.35■■□□□ 1.65
C9orf16-201ENST00000372994 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.33■■□□□ 1.64
C9orf16-201ENST00000372994 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.32■■□□□ 1.64
C9orf16-201ENST00000372994 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
C9orf16-201ENST00000372994 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.31■■□□□ 1.64
C9orf16-201ENST00000372994 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.28■■□□□ 1.64
C9orf16-201ENST00000372994 KIAA0556O60303 1618 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf16-201ENST00000372994 EEA1Q15075 1411 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf16-201ENST00000372994 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf16-201ENST00000372994 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf16-201ENST00000372994 UACAQ9BZF9 1416 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf16-201ENST00000372994 ABCC2Q92887 1545 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf16-201ENST00000372994 DIP2BQ9P265 1576 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf16-201ENST00000372994 GOLGA3Q08378 1498 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf16-201ENST00000372994 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.14■■□□□ 1.62
C9orf16-201ENST00000372994 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.13■■□□□ 1.61
C9orf16-201ENST00000372994 ASXL2Q76L83 1435 aa25.12■■□□□ 1.61
C9orf16-201ENST00000372994 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.12■■□□□ 1.61
C9orf16-201ENST00000372994 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
C9orf16-201ENST00000372994 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
C9orf16-201ENST00000372994 ABCA8O94911 1581 aa25.03■■□□□ 1.6
C9orf16-201ENST00000372994 GLI2P10070 1586 aa25.03■■□□□ 1.6
C9orf16-201ENST00000372994 TSPOAP1O95153 1857 aa25■■□□□ 1.59
C9orf16-201ENST00000372994 P3H3Q8IVL6 736 aa25■■□□□ 1.59
C9orf16-201ENST00000372994 KIF21BO75037 1637 aa25■■□□□ 1.59
C9orf16-201ENST00000372994 SAMD9Q5K651 1589 aa24.99■■□□□ 1.59
C9orf16-201ENST00000372994 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
C9orf16-201ENST00000372994 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf16-201ENST00000372994 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
C9orf16-201ENST00000372994 KDM6BO15054 1643 aa24.89■■□□□ 1.57
C9orf16-201ENST00000372994 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.88■■□□□ 1.57
C9orf16-201ENST00000372994 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
C9orf16-201ENST00000372994 ATP10BO94823 1461 aa24.85■■□□□ 1.57
C9orf16-201ENST00000372994 KCNH8Q96L42 1107 aa24.82■■□□□ 1.56
C9orf16-201ENST00000372994 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.82■■□□□ 1.56
C9orf16-201ENST00000372994 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.81■■□□□ 1.56
C9orf16-201ENST00000372994 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
C9orf16-201ENST00000372994 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.81■■□□□ 1.56
C9orf16-201ENST00000372994 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.79■■□□□ 1.56
C9orf16-201ENST00000372994 ARID3CA6NKF2 412 aa24.79■■□□□ 1.56
C9orf16-201ENST00000372994 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf16-201ENST00000372994 CD109Q6YHK3 1445 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf16-201ENST00000372994 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
C9orf16-201ENST00000372994 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf16-201ENST00000372994 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
C9orf16-201ENST00000372994 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf16-201ENST00000372994 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
C9orf16-201ENST00000372994 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
C9orf16-201ENST00000372994 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
C9orf16-201ENST00000372994 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf16-201ENST00000372994 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf16-201ENST00000372994 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.61■■□□□ 1.53
C9orf16-201ENST00000372994 FMN1Q68DA7 1419 aa24.61■■□□□ 1.53
C9orf16-201ENST00000372994 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.55■■□□□ 1.52
C9orf16-201ENST00000372994 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.54■■□□□ 1.52
C9orf16-201ENST00000372994 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.54■■□□□ 1.52
C9orf16-201ENST00000372994 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
C9orf16-201ENST00000372994 NEO1Q92859 1461 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf16-201ENST00000372994 HECW1Q76N89 1606 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf16-201ENST00000372994 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
C9orf16-201ENST00000372994 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.518e-8■■□□□ 12
C9orf16-201ENST00000372994 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
C9orf16-201ENST00000372994 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.39■■□□□ 1.5
C9orf16-201ENST00000372994 RAPGEF3O95398 923 aa24.39■■□□□ 1.49
C9orf16-201ENST00000372994 ADGRL1O94910 1474 aa24.38■■□□□ 1.49
C9orf16-201ENST00000372994 CLIP1P30622 1438 aa24.37■■□□□ 1.49
C9orf16-201ENST00000372994 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.37■■□□□ 1.49
C9orf16-201ENST00000372994 FANCAO15360 1455 aa24.36■■□□□ 1.49
C9orf16-201ENST00000372994 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.35■■□□□ 1.49
C9orf16-201ENST00000372994 AKNAQ7Z591 1439 aa24.35■■□□□ 1.49
C9orf16-201ENST00000372994 PLCH2O75038 1416 aa24.34■■□□□ 1.49
C9orf16-201ENST00000372994 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
C9orf16-201ENST00000372994 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.33■■□□□ 1.48
C9orf16-201ENST00000372994 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
C9orf16-201ENST00000372994 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.3■■□□□ 1.48
C9orf16-201ENST00000372994 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
C9orf16-201ENST00000372994 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.29■■□□□ 1.48
C9orf16-201ENST00000372994 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf16-201ENST00000372994 KIF14Q15058 1648 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf16-201ENST00000372994 RICTORQ6R327 1708 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf16-201ENST00000372994 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf16-201ENST00000372994 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf16-201ENST00000372994 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf16-201ENST00000372994 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf16-201ENST00000372994 CEP162Q5TB80 1403 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf16-201ENST00000372994 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms