RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
PITX3-201ENST00000370002 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.82■■■■□ 3.16
PITX3-201ENST00000370002 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.81■■■■□ 3.16
PITX3-201ENST00000370002 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.78■■■■□ 3.16
PITX3-201ENST00000370002 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.55■■■■□ 3.12
PITX3-201ENST00000370002 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.47■■■■□ 3.11
PITX3-201ENST00000370002 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.43■■■■□ 3.1
PITX3-201ENST00000370002 IQGAP2Q13576 1575 aa34.42■■■■□ 3.1
PITX3-201ENST00000370002 PTPRGP23470 1445 aa34.39■■■■□ 3.1
PITX3-201ENST00000370002 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.38■■■■□ 3.09
PITX3-201ENST00000370002 PRXQ9BXM0 1461 aa34.33■■■■□ 3.09
PITX3-201ENST00000370002 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.3■■■■□ 3.08
PITX3-201ENST00000370002 MAPKBP1O60336 1514 aa34.27■■■■□ 3.08
PITX3-201ENST00000370002 DISP1Q96F81 1524 aa34.26■■■■□ 3.07
PITX3-201ENST00000370002 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.25■■■■□ 3.07
PITX3-201ENST00000370002 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.21■■■■□ 3.07
PITX3-201ENST00000370002 EEA1Q15075 1411 aa34.2■■■■□ 3.07
PITX3-201ENST00000370002 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.19■■■■□ 3.06
PITX3-201ENST00000370002 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.17■■■■□ 3.06
PITX3-201ENST00000370002 UACAQ9BZF9 1416 aa34.14■■■■□ 3.06
PITX3-201ENST00000370002 ABCC2Q92887 1545 aa34.13■■■■□ 3.05
PITX3-201ENST00000370002 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.12■■■■□ 3.05
PITX3-201ENST00000370002 GOLGA3Q08378 1498 aa34.11■■■■□ 3.05
PITX3-201ENST00000370002 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
PITX3-201ENST00000370002 KIAA0556O60303 1618 aa34.08■■■■□ 3.05
PITX3-201ENST00000370002 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.04■■■■□ 3.04
PITX3-201ENST00000370002 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.01■■■■□ 3.04
PITX3-201ENST00000370002 PLB1Q6P1J6 1458 aa34■■■■□ 3.03
PITX3-201ENST00000370002 DIP2BQ9P265 1576 aa34■■■■□ 3.03
PITX3-201ENST00000370002 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.98■■■■□ 3.03
PITX3-201ENST00000370002 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
PITX3-201ENST00000370002 ASXL2Q76L83 1435 aa33.93■■■■□ 3.02
PITX3-201ENST00000370002 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.9■■■■□ 3.02
PITX3-201ENST00000370002 GLI2P10070 1586 aa33.82■■■■□ 3.01
PITX3-201ENST00000370002 ABCA8O94911 1581 aa33.79■■■■□ 3
PITX3-201ENST00000370002 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
PITX3-201ENST00000370002 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
PITX3-201ENST00000370002 KIF21BO75037 1637 aa33.71■■■□□ 2.99
PITX3-201ENST00000370002 SAMD9Q5K651 1589 aa33.7■■■□□ 2.99
PITX3-201ENST00000370002 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.7■■■□□ 2.98
PITX3-201ENST00000370002 P3H3Q8IVL6 736 aa33.68■■■□□ 2.98
PITX3-201ENST00000370002 KDM6BO15054 1643 aa33.58■■■□□ 2.97
PITX3-201ENST00000370002 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.57■■■□□ 2.96
PITX3-201ENST00000370002 ATP10BO94823 1461 aa33.54■■■□□ 2.96
PITX3-201ENST00000370002 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.54■■■□□ 2.96
PITX3-201ENST00000370002 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.53■■■□□ 2.96
PITX3-201ENST00000370002 TSPOAP1O95153 1857 aa33.51■■■□□ 2.95
PITX3-201ENST00000370002 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
PITX3-201ENST00000370002 KCNH8Q96L42 1107 aa33.48■■■□□ 2.95
PITX3-201ENST00000370002 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
PITX3-201ENST00000370002 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
PITX3-201ENST00000370002 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.47■■■□□ 2.95
PITX3-201ENST00000370002 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
PITX3-201ENST00000370002 CD109Q6YHK3 1445 aa33.46■■■□□ 2.95
PITX3-201ENST00000370002 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.45■■■□□ 2.95
PITX3-201ENST00000370002 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.45■■■□□ 2.95
PITX3-201ENST00000370002 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
PITX3-201ENST00000370002 ARID3CA6NKF2 412 aa33.37■■■□□ 2.93
PITX3-201ENST00000370002 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.37■■■□□ 2.93
PITX3-201ENST00000370002 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
PITX3-201ENST00000370002 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
PITX3-201ENST00000370002 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
PITX3-201ENST00000370002 FMN1Q68DA7 1419 aa33.3■■■□□ 2.92
PITX3-201ENST00000370002 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.3■■■□□ 2.92
PITX3-201ENST00000370002 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.3■■■□□ 2.92
PITX3-201ENST00000370002 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.26■■■□□ 2.92
PITX3-201ENST00000370002 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.25■■■□□ 2.91
PITX3-201ENST00000370002 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.23■■■□□ 2.91
PITX3-201ENST00000370002 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.18■■■□□ 2.9
PITX3-201ENST00000370002 NEO1Q92859 1461 aa33.14■■■□□ 2.9
PITX3-201ENST00000370002 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.13■■■□□ 2.89
PITX3-201ENST00000370002 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
PITX3-201ENST00000370002 HECW1Q76N89 1606 aa33.05■■■□□ 2.88
PITX3-201ENST00000370002 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
PITX3-201ENST00000370002 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
PITX3-201ENST00000370002 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.98■■■□□ 2.87
PITX3-201ENST00000370002 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.95■■■□□ 2.86
PITX3-201ENST00000370002 ADGRL1O94910 1474 aa32.92■■■□□ 2.86
PITX3-201ENST00000370002 CLIP1P30622 1438 aa32.91■■■□□ 2.86
PITX3-201ENST00000370002 FANCAO15360 1455 aa32.91■■■□□ 2.86
PITX3-201ENST00000370002 RAPGEF3O95398 923 aa32.91■■■□□ 2.86
PITX3-201ENST00000370002 PLCH2O75038 1416 aa32.9■■■□□ 2.86
PITX3-201ENST00000370002 AKNAQ7Z591 1439 aa32.9■■■□□ 2.86
PITX3-201ENST00000370002 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
PITX3-201ENST00000370002 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.87■■■□□ 2.85
PITX3-201ENST00000370002 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.86■■■□□ 2.85
PITX3-201ENST00000370002 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
PITX3-201ENST00000370002 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.85■■■□□ 2.85
PITX3-201ENST00000370002 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.81■■■□□ 2.84
PITX3-201ENST00000370002 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.81■■■□□ 2.84
PITX3-201ENST00000370002 KIF14Q15058 1648 aa32.75■■■□□ 2.83
PITX3-201ENST00000370002 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
PITX3-201ENST00000370002 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.74■■■□□ 2.83
PITX3-201ENST00000370002 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.72■■■□□ 2.83
PITX3-201ENST00000370002 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.7■■■□□ 2.82
PITX3-201ENST00000370002 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.67■■■□□ 2.82
PITX3-201ENST00000370002 RICTORQ6R327 1708 aa32.65■■■□□ 2.82
PITX3-201ENST00000370002 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.65■■■□□ 2.82
PITX3-201ENST00000370002 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.65■■■□□ 2.82
PITX3-201ENST00000370002 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms