RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PRPF39-201ENST00000355765 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.58■■□□□ 1.85
PRPF39-201ENST00000355765 ANP32CO43423 234 aa26.58■■□□□ 1.85
PRPF39-201ENST00000355765 CCER2I3L3R5 266 aa26.54■■□□□ 1.84
PRPF39-201ENST00000355765 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.53■■□□□ 1.84
PRPF39-201ENST00000355765 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PRPF39-201ENST00000355765 PRXQ9BXM0 1461 aa26.47■■□□□ 1.83
PRPF39-201ENST00000355765 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.45■■□□□ 1.82
PRPF39-201ENST00000355765 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.44■■□□□ 1.82
PRPF39-201ENST00000355765 TOP2BQ02880 1626 aa26.4■■□□□ 1.82
PRPF39-201ENST00000355765 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
PRPF39-201ENST00000355765 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PRPF39-201ENST00000355765 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PRPF39-201ENST00000355765 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.36■■□□□ 1.81
PRPF39-201ENST00000355765 CFTRP13569 1480 aa26.31■■□□□ 1.8
PRPF39-201ENST00000355765 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PRPF39-201ENST00000355765 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.25■■□□□ 1.79
PRPF39-201ENST00000355765 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.22■■□□□ 1.79
PRPF39-201ENST00000355765 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.21■■□□□ 1.79
PRPF39-201ENST00000355765 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.21■■□□□ 1.79
PRPF39-201ENST00000355765 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.21■■□□□ 1.79
PRPF39-201ENST00000355765 NBR1Q14596 966 aa26.2■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 TIAM1Q13009 1591 aa26.18■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.17■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.17■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.17■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 KIF27Q86VH2 1401 aa26.16■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 TONSLQ96HA7 1378 aa26.15■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PRPF39-201ENST00000355765 CUX1P39880 1505 aa26.13■■□□□ 1.77
PRPF39-201ENST00000355765 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.12■■□□□ 1.77
PRPF39-201ENST00000355765 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PRPF39-201ENST00000355765 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 NESP48681 1621 aa26.07■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC184Q52MB2 194 aa26.05■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 P3H3Q8IVL6 736 aa26.04■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 PRDM2Q13029 1718 aa26.03■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.02■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PRPF39-201ENST00000355765 MAP3K1Q13233 1512 aa25.98■■□□□ 1.75
PRPF39-201ENST00000355765 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.98■■□□□ 1.75
PRPF39-201ENST00000355765 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.96■■□□□ 1.75
PRPF39-201ENST00000355765 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.95■■□□□ 1.74
PRPF39-201ENST00000355765 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.86■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.86■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 IGF1RP08069 1367 aa25.85■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 MRS2Q9HD23 443 aa25.84■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.81■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.81■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.78■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 UACAQ9BZF9 1416 aa25.78■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.78■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.77■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 IL27Q8NEV9 243 aa25.77■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.76■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 PTPRKQ15262 1439 aa25.75■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.75■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.712e-7■■■■□ 20.5
PRPF39-201ENST00000355765 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.75■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 AKNAQ7Z591 1439 aa25.72■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.71■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.71■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.7■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 TOPBP1Q92547 1522 aa25.69■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 HFM1A2PYH4 1435 aa25.68■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.68■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 NCOA2Q15596 1464 aa25.67■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.67■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.67■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.64■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 NAIPQ13075 1403 aa25.63■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC7Q96M83 1385 aa25.62■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.6■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.59■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.58■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.57■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.57■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.55■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 FMN1Q68DA7 1419 aa25.55■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.54■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 NCOA1Q15788 1441 aa25.54■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 FOXD1Q16676 465 aa25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms