RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM2Q13029 1718 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.355e-7■■■■■ 27.7
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM52Q96A61 297 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 TSPY4P0CV99 314 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 TSPY10P0CW01 314 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHG5O94827 1062 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA3Q08378 1498 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 IGF1RP08069 1367 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRGP23470 1445 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 GGT6Q6P531 493 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 IFT140Q96RY7 1462 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 WDR62O43379 1518 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 CEP162Q5TB80 1403 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 PRXQ9BXM0 1461 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 CLIP1P30622 1438 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 GRIN2BQ13224 1484 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JS52 829 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 KIF21BO75037 1637 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 MYT1Q01538 1121 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 CUL7Q14999 1698 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 WDR97A6NE52 1622 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 KIF3BO15066 747 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 RAPGEF3O95398 923 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 SYNJ2O15056 1496 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 PBRM1Q86U86 1689 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 GRIN2AQ12879 1464 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS12P58397 1594 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 PIP4K2BP78356 416 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 EID1Q9Y6B2 187 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 SLC24A1O60721 1099 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 NEUROD1Q13562 356 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-201ENST00000348564 ARAP1Q96P48 1450 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 RGL3Q3MIN7 710 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 FMN1Q68DA7 1419 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 IQGAP2Q13576 1575 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 AFAP1Q8N556 730 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 HSPA2P54652 639 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 NUP160Q12769 1436 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 CEP170Q5SW79 1584 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 KANK1Q14678 1352 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 DMRT2Q9Y5R5 561 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-201ENST00000348564 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 POGKQ9P215 609 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 CD109Q6YHK3 1445 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-201ENST00000348564 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.32□□□□□ -1.4
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