RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347404.9

KITLG-202, Transcript of KIT ligand, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KITLG, Length 1,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KITLG-202ENST00000347404 FKBP8Q14318 412 aa22.28■■□□□ 1.16
KITLG-202ENST00000347404 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.26■■□□□ 1.15
KITLG-202ENST00000347404 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.24■■□□□ 1.15
KITLG-202ENST00000347404 ANP32CO43423 234 aa22.23■■□□□ 1.15
KITLG-202ENST00000347404 ITGAEP38570 1179 aa22.23■■□□□ 1.15
KITLG-202ENST00000347404 WDR97A6NE52 1622 aa22.22■■□□□ 1.15
KITLG-202ENST00000347404 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.21■■□□□ 1.15
KITLG-202ENST00000347404 CFTRP13569 1480 aa22.19■■□□□ 1.14
KITLG-202ENST00000347404 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
KITLG-202ENST00000347404 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
KITLG-202ENST00000347404 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
KITLG-202ENST00000347404 PRDM2Q13029 1718 aa22.17■■□□□ 1.14
KITLG-202ENST00000347404 BCANQ96GW7 911 aa22.16■■□□□ 1.14
KITLG-202ENST00000347404 NESP48681 1621 aa22.15■■□□□ 1.14
KITLG-202ENST00000347404 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.15■■□□□ 1.14
KITLG-202ENST00000347404 KCNH8Q96L42 1107 aa22.14■■□□□ 1.14
KITLG-202ENST00000347404 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
KITLG-202ENST00000347404 BCL11AQ9H165 835 aa22.11■■□□□ 1.13
KITLG-202ENST00000347404 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.09■■□□□ 1.13
KITLG-202ENST00000347404 IGF1RP08069 1367 aa22.07■■□□□ 1.12
KITLG-202ENST00000347404 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
KITLG-202ENST00000347404 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.05■■□□□ 1.12
KITLG-202ENST00000347404 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.04■■□□□ 1.12
KITLG-202ENST00000347404 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.04■■□□□ 1.12
KITLG-202ENST00000347404 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.04■■□□□ 1.12
KITLG-202ENST00000347404 TONSLQ96HA7 1378 aa22.03■■□□□ 1.12
KITLG-202ENST00000347404 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
KITLG-202ENST00000347404 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.02■■□□□ 1.11
KITLG-202ENST00000347404 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
KITLG-202ENST00000347404 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.01■■□□□ 1.11
KITLG-202ENST00000347404 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.99■■□□□ 1.11
KITLG-202ENST00000347404 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
KITLG-202ENST00000347404 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.96■■□□□ 1.11
KITLG-202ENST00000347404 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.96■■□□□ 1.11
KITLG-202ENST00000347404 TRIM52Q96A61 297 aa21.96■■□□□ 1.11
KITLG-202ENST00000347404 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.95■■□□□ 1.1
KITLG-202ENST00000347404 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.94■■□□□ 1.1
KITLG-202ENST00000347404 UACAQ9BZF9 1416 aa21.93■■□□□ 1.1
KITLG-202ENST00000347404 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.91■■□□□ 1.1
KITLG-202ENST00000347404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.91■■□□□ 1.1
KITLG-202ENST00000347404 HFM1A2PYH4 1435 aa21.89■■□□□ 1.09
KITLG-202ENST00000347404 FMN1Q68DA7 1419 aa21.88■■□□□ 1.09
KITLG-202ENST00000347404 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.87■■□□□ 1.09
KITLG-202ENST00000347404 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.86■■□□□ 1.09
KITLG-202ENST00000347404 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.83■■□□□ 1.08
KITLG-202ENST00000347404 CUL7Q14999 1698 aa21.83■■□□□ 1.08
KITLG-202ENST00000347404 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
KITLG-202ENST00000347404 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.79■■□□□ 1.08
KITLG-202ENST00000347404 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.78■■□□□ 1.08
KITLG-202ENST00000347404 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.78■■□□□ 1.08
KITLG-202ENST00000347404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
KITLG-202ENST00000347404 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
KITLG-202ENST00000347404 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.76■■□□□ 1.07
KITLG-202ENST00000347404 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
KITLG-202ENST00000347404 ERCC6Q03468 1493 aa21.75■■□□□ 1.07
KITLG-202ENST00000347404 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.75■■□□□ 1.07
KITLG-202ENST00000347404 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.72■■□□□ 1.07
KITLG-202ENST00000347404 NCOA2Q15596 1464 aa21.72■■□□□ 1.07
KITLG-202ENST00000347404 MSH5O43196 834 aa21.71■■□□□ 1.07
KITLG-202ENST00000347404 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.71■■□□□ 1.07
KITLG-202ENST00000347404 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 NAIPQ13075 1403 aa21.7■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.69■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.69■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.68■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.68■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 HECW1Q76N89 1606 aa21.68■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 AKNAQ7Z591 1439 aa21.67■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 P3H3Q8IVL6 736 aa21.67■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.66■■□□□ 1.06
KITLG-202ENST00000347404 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.64■■□□□ 1.05
KITLG-202ENST00000347404 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.62■■□□□ 1.05
KITLG-202ENST00000347404 SAMD9Q5K651 1589 aa21.61■■□□□ 1.05
KITLG-202ENST00000347404 TOPBP1Q92547 1522 aa21.61■■□□□ 1.05
KITLG-202ENST00000347404 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.61■■□□□ 1.05
KITLG-202ENST00000347404 PTPRKQ15262 1439 aa21.6■■□□□ 1.05
KITLG-202ENST00000347404 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.59■■□□□ 1.05
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KITLG-202ENST00000347404 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
KITLG-202ENST00000347404 GRIN2BQ13224 1484 aa21.56■■□□□ 1.04
KITLG-202ENST00000347404 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.56■■□□□ 1.04
KITLG-202ENST00000347404 NCOA1Q15788 1441 aa21.54■■□□□ 1.04
KITLG-202ENST00000347404 ARHGEF11O15085 1522 aa21.54■■□□□ 1.04
KITLG-202ENST00000347404 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
KITLG-202ENST00000347404 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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KITLG-202ENST00000347404 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
KITLG-202ENST00000347404 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.5■■□□□ 1.03
KITLG-202ENST00000347404 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
KITLG-202ENST00000347404 MRS2Q9HD23 443 aa21.49■■□□□ 1.03
KITLG-202ENST00000347404 WDR62O43379 1518 aa21.48■■□□□ 1.03
KITLG-202ENST00000347404 MIA2Q96PC5 1412 aa21.47■■□□□ 1.03
KITLG-202ENST00000347404 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.47■■□□□ 1.03
KITLG-202ENST00000347404 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
KITLG-202ENST00000347404 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.46■■□□□ 1.03
KITLG-202ENST00000347404 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
KITLG-202ENST00000347404 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.41■■□□□ 1.02
KITLG-202ENST00000347404 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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