RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334569.3

AC003669.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC003669.1, Length 611 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC003669.1-201ENST00000334569 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.79■■■□□ 2.2
AC003669.1-201ENST00000334569 ARAP1Q96P48 1450 aa28.79■■■□□ 2.2
AC003669.1-201ENST00000334569 KIF21BO75037 1637 aa28.78■■■□□ 2.2
AC003669.1-201ENST00000334569 NUP160Q12769 1436 aa28.68■■■□□ 2.18
AC003669.1-201ENST00000334569 GOLGA3Q08378 1498 aa28.67■■■□□ 2.18
AC003669.1-201ENST00000334569 CEP170Q5SW79 1584 aa28.63■■■□□ 2.17
AC003669.1-201ENST00000334569 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.55■■■□□ 2.16
AC003669.1-201ENST00000334569 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.53■■■□□ 2.16
AC003669.1-201ENST00000334569 IQGAP2Q13576 1575 aa28.49■■■□□ 2.15
AC003669.1-201ENST00000334569 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
AC003669.1-201ENST00000334569 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.45■■■□□ 2.14
AC003669.1-201ENST00000334569 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
AC003669.1-201ENST00000334569 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.41■■■□□ 2.14
AC003669.1-201ENST00000334569 SHROOM2Q13796 1616 aa28.4■■■□□ 2.14
AC003669.1-201ENST00000334569 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.37■■■□□ 2.13
AC003669.1-201ENST00000334569 JPH4Q96JJ6 628 aa28.34■■■□□ 2.13
AC003669.1-201ENST00000334569 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.33■■■□□ 2.13
AC003669.1-201ENST00000334569 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.29■■■□□ 2.12
AC003669.1-201ENST00000334569 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
AC003669.1-201ENST00000334569 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.26■■■□□ 2.12
AC003669.1-201ENST00000334569 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.23■■■□□ 2.11
AC003669.1-201ENST00000334569 KIAA0556O60303 1618 aa28.21■■■□□ 2.11
AC003669.1-201ENST00000334569 SAMD9Q5K651 1589 aa28.2■■■□□ 2.1
AC003669.1-201ENST00000334569 DISP1Q96F81 1524 aa28.19■■■□□ 2.1
AC003669.1-201ENST00000334569 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
AC003669.1-201ENST00000334569 CLIP1P30622 1438 aa28.14■■■□□ 2.1
AC003669.1-201ENST00000334569 CEP162Q5TB80 1403 aa28.14■■■□□ 2.1
AC003669.1-201ENST00000334569 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.08■■■□□ 2.09
AC003669.1-201ENST00000334569 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.02■■■□□ 2.08
AC003669.1-201ENST00000334569 PTPRGP23470 1445 aa28.01■■■□□ 2.08
AC003669.1-201ENST00000334569 P3H3Q8IVL6 736 aa28.01■■■□□ 2.07
AC003669.1-201ENST00000334569 FMN1Q68DA7 1419 aa27.95■■■□□ 2.07
AC003669.1-201ENST00000334569 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
AC003669.1-201ENST00000334569 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.87■■■□□ 2.05
AC003669.1-201ENST00000334569 UACAQ9BZF9 1416 aa27.86■■■□□ 2.05
AC003669.1-201ENST00000334569 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.86■■■□□ 2.05
AC003669.1-201ENST00000334569 ABCA8O94911 1581 aa27.84■■■□□ 2.05
AC003669.1-201ENST00000334569 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.82■■■□□ 2.04
AC003669.1-201ENST00000334569 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.82■■■□□ 2.04
AC003669.1-201ENST00000334569 ABCC2Q92887 1545 aa27.82■■■□□ 2.04
AC003669.1-201ENST00000334569 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.81■■■□□ 2.04
AC003669.1-201ENST00000334569 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.79■■■□□ 2.04
AC003669.1-201ENST00000334569 HECW1Q76N89 1606 aa27.77■■■□□ 2.04
AC003669.1-201ENST00000334569 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.76■■■□□ 2.03
AC003669.1-201ENST00000334569 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.75■■■□□ 2.03
AC003669.1-201ENST00000334569 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
AC003669.1-201ENST00000334569 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
AC003669.1-201ENST00000334569 MAPKBP1O60336 1514 aa27.73■■■□□ 2.03
AC003669.1-201ENST00000334569 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.7■■■□□ 2.02
AC003669.1-201ENST00000334569 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
AC003669.1-201ENST00000334569 DIP2BQ9P265 1576 aa27.69■■■□□ 2.02
AC003669.1-201ENST00000334569 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.67■■■□□ 2.02
AC003669.1-201ENST00000334569 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.67■■■□□ 2.02
AC003669.1-201ENST00000334569 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
AC003669.1-201ENST00000334569 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.64■■■□□ 2.01
AC003669.1-201ENST00000334569 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
AC003669.1-201ENST00000334569 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
AC003669.1-201ENST00000334569 ATP10BO94823 1461 aa27.57■■■□□ 2
AC003669.1-201ENST00000334569 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
AC003669.1-201ENST00000334569 TSPOAP1O95153 1857 aa27.53■■■□□ 2
AC003669.1-201ENST00000334569 ARID3CA6NKF2 412 aa27.53■■■□□ 2
AC003669.1-201ENST00000334569 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
AC003669.1-201ENST00000334569 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
AC003669.1-201ENST00000334569 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.5■■□□□ 1.99
AC003669.1-201ENST00000334569 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
AC003669.1-201ENST00000334569 APLP2Q06481 763 aa27.49■■□□□ 1.99
AC003669.1-201ENST00000334569 MAP3K1Q13233 1512 aa27.49■■□□□ 1.99
AC003669.1-201ENST00000334569 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.49■■□□□ 1.99
AC003669.1-201ENST00000334569 ASXL2Q76L83 1435 aa27.47■■□□□ 1.99
AC003669.1-201ENST00000334569 TIAM1Q13009 1591 aa27.47■■□□□ 1.99
AC003669.1-201ENST00000334569 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
AC003669.1-201ENST00000334569 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.44■■□□□ 1.98
AC003669.1-201ENST00000334569 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.43■■□□□ 1.98
AC003669.1-201ENST00000334569 KDM6BO15054 1643 aa27.41■■□□□ 1.98
AC003669.1-201ENST00000334569 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
AC003669.1-201ENST00000334569 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.37■■□□□ 1.97
AC003669.1-201ENST00000334569 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.36■■□□□ 1.97
AC003669.1-201ENST00000334569 GLI2P10070 1586 aa27.35■■□□□ 1.97
AC003669.1-201ENST00000334569 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
AC003669.1-201ENST00000334569 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.32■■□□□ 1.96
AC003669.1-201ENST00000334569 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.32■■□□□ 1.96
AC003669.1-201ENST00000334569 KIF14Q15058 1648 aa27.3■■□□□ 1.96
AC003669.1-201ENST00000334569 KCNH8Q96L42 1107 aa27.25■■□□□ 1.95
AC003669.1-201ENST00000334569 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.25■■□□□ 1.95
AC003669.1-201ENST00000334569 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
AC003669.1-201ENST00000334569 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
AC003669.1-201ENST00000334569 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.2■■□□□ 1.95
AC003669.1-201ENST00000334569 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
AC003669.1-201ENST00000334569 NCOA2Q15596 1464 aa27.16■■□□□ 1.94
AC003669.1-201ENST00000334569 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.15■■□□□ 1.94
AC003669.1-201ENST00000334569 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
AC003669.1-201ENST00000334569 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.11■■□□□ 1.93
AC003669.1-201ENST00000334569 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.1■■□□□ 1.93
AC003669.1-201ENST00000334569 CD109Q6YHK3 1445 aa27.1■■□□□ 1.93
AC003669.1-201ENST00000334569 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.08■■□□□ 1.93
AC003669.1-201ENST00000334569 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.07■■□□□ 1.92
AC003669.1-201ENST00000334569 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.07■■□□□ 1.92
AC003669.1-201ENST00000334569 PREX2Q70Z35 1606 aa27.05■■□□□ 1.92
AC003669.1-201ENST00000334569 PLCH2O75038 1416 aa27.04■■□□□ 1.92
AC003669.1-201ENST00000334569 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms