RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.46■■■□□ 2.95
RAB11B-201ENST00000328024 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.46■■■□□ 2.95
RAB11B-201ENST00000328024 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.46■■■□□ 2.95
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RAB11B-201ENST00000328024 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.36■■■□□ 2.93
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RAB11B-201ENST00000328024 ABCC2Q92887 1545 aa32.63■■■□□ 2.81
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RAB11B-201ENST00000328024 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.51■■■□□ 2.79
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RAB11B-201ENST00000328024 ARID3CA6NKF2 412 aa32.45■■■□□ 2.78
RAB11B-201ENST00000328024 MAPKBP1O60336 1514 aa32.44■■■□□ 2.78
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RAB11B-201ENST00000328024 FMN1Q68DA7 1419 aa32.44■■■□□ 2.78
RAB11B-201ENST00000328024 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
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RAB11B-201ENST00000328024 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
RAB11B-201ENST00000328024 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.28■■■□□ 2.76
RAB11B-201ENST00000328024 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
RAB11B-201ENST00000328024 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.26■■■□□ 2.76
RAB11B-201ENST00000328024 HECW1Q76N89 1606 aa32.24■■■□□ 2.75
RAB11B-201ENST00000328024 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.23■■■□□ 2.75
RAB11B-201ENST00000328024 DIP2BQ9P265 1576 aa32.23■■■□□ 2.75
RAB11B-201ENST00000328024 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
RAB11B-201ENST00000328024 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
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RAB11B-201ENST00000328024 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.22■■■□□ 2.75
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RAB11B-201ENST00000328024 KCNH8Q96L42 1107 aa32.14■■■□□ 2.74
RAB11B-201ENST00000328024 GLI2P10070 1586 aa32.1■■■□□ 2.73
RAB11B-201ENST00000328024 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.1■■■□□ 2.73
RAB11B-201ENST00000328024 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.09■■■□□ 2.73
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.05■■■□□ 2.72
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RAB11B-201ENST00000328024 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.98■■■□□ 2.71
RAB11B-201ENST00000328024 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
RAB11B-201ENST00000328024 TSPOAP1O95153 1857 aa31.96■■■□□ 2.71
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RAB11B-201ENST00000328024 CD109Q6YHK3 1445 aa31.9■■■□□ 2.7
RAB11B-201ENST00000328024 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.89■■■□□ 2.7
RAB11B-201ENST00000328024 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.7
RAB11B-201ENST00000328024 KIF14Q15058 1648 aa31.87■■■□□ 2.69
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RAB11B-201ENST00000328024 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
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RAB11B-201ENST00000328024 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.58■■■□□ 2.65
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RAB11B-201ENST00000328024 NCOA2Q15596 1464 aa31.58■■■□□ 2.65
RAB11B-201ENST00000328024 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
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