RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317508.10

PRSS8-201, Transcript of serine protease 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRSS8, Length 1,872 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS8-201ENST00000317508 IGF1RP08069 1367 aa22.32■■□□□ 1.16
PRSS8-201ENST00000317508 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PRSS8-201ENST00000317508 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRSS8-201ENST00000317508 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PRSS8-201ENST00000317508 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PRSS8-201ENST00000317508 NEUROD1Q13562 356 aa22.24■■□□□ 1.15
PRSS8-201ENST00000317508 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PRSS8-201ENST00000317508 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.23■■□□□ 1.15
PRSS8-201ENST00000317508 WDR97A6NE52 1622 aa22.23■■□□□ 1.15
PRSS8-201ENST00000317508 TIAM1Q13009 1591 aa22.22■■□□□ 1.15
PRSS8-201ENST00000317508 IFT140Q96RY7 1462 aa22.22■■□□□ 1.15
PRSS8-201ENST00000317508 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.21■■□□□ 1.15
PRSS8-201ENST00000317508 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.18■■□□□ 1.14
PRSS8-201ENST00000317508 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.16■■□□□ 1.14
PRSS8-201ENST00000317508 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.15■■□□□ 1.14
PRSS8-201ENST00000317508 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.15■■□□□ 1.14
PRSS8-201ENST00000317508 CUL7Q14999 1698 aa22.13■■□□□ 1.13
PRSS8-201ENST00000317508 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.134e-9■■■■■ 26.9
PRSS8-201ENST00000317508 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.11■■□□□ 1.13
PRSS8-201ENST00000317508 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRSS8-201ENST00000317508 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.09■■□□□ 1.13
PRSS8-201ENST00000317508 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.05■■□□□ 1.12
PRSS8-201ENST00000317508 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PRSS8-201ENST00000317508 GRIN2BQ13224 1484 aa22.03■■□□□ 1.12
PRSS8-201ENST00000317508 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.02■■□□□ 1.12
PRSS8-201ENST00000317508 MIER1Q8N108 512 aa22.01■■□□□ 1.11
PRSS8-201ENST00000317508 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.01■■□□□ 1.11
PRSS8-201ENST00000317508 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PRSS8-201ENST00000317508 PBRM1Q86U86 1689 aa21.98■■□□□ 1.11
PRSS8-201ENST00000317508 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.95■■□□□ 1.1
PRSS8-201ENST00000317508 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.94■■□□□ 1.1
PRSS8-201ENST00000317508 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
PRSS8-201ENST00000317508 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.93■■□□□ 1.1
PRSS8-201ENST00000317508 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.91■■□□□ 1.1
PRSS8-201ENST00000317508 MAPKBP1O60336 1514 aa21.91■■□□□ 1.1
PRSS8-201ENST00000317508 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.9■■□□□ 1.1
PRSS8-201ENST00000317508 ADAMTS12P58397 1594 aa21.89■■□□□ 1.1
PRSS8-201ENST00000317508 FMN1Q68DA7 1419 aa21.88■■□□□ 1.09
PRSS8-201ENST00000317508 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.87■■□□□ 1.09
PRSS8-201ENST00000317508 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRSS8-201ENST00000317508 SAMD9Q5K651 1589 aa21.85■■□□□ 1.09
PRSS8-201ENST00000317508 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PRSS8-201ENST00000317508 ITGAEP38570 1179 aa21.79■■□□□ 1.08
PRSS8-201ENST00000317508 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PRSS8-201ENST00000317508 SYNJ2O15056 1496 aa21.78■■□□□ 1.08
PRSS8-201ENST00000317508 FBLN2P98095 1184 aa21.77■■□□□ 1.08
PRSS8-201ENST00000317508 GRIN2AQ12879 1464 aa21.76■■□□□ 1.07
PRSS8-201ENST00000317508 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.76■■□□□ 1.07
PRSS8-201ENST00000317508 P3H3Q8IVL6 736 aa21.73■■□□□ 1.07
PRSS8-201ENST00000317508 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PRSS8-201ENST00000317508 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.72■■□□□ 1.07
PRSS8-201ENST00000317508 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.68■■□□□ 1.06
PRSS8-201ENST00000317508 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.67■■□□□ 1.06
PRSS8-201ENST00000317508 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PRSS8-201ENST00000317508 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PRSS8-201ENST00000317508 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.65■■□□□ 1.06
PRSS8-201ENST00000317508 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.64■■□□□ 1.05
PRSS8-201ENST00000317508 IQGAP2Q13576 1575 aa21.63■■□□□ 1.05
PRSS8-201ENST00000317508 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.62■■□□□ 1.05
PRSS8-201ENST00000317508 HFM1A2PYH4 1435 aa21.62■■□□□ 1.05
PRSS8-201ENST00000317508 NUP160Q12769 1436 aa21.61■■□□□ 1.05
PRSS8-201ENST00000317508 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.61■■□□□ 1.05
PRSS8-201ENST00000317508 NCOA2Q15596 1464 aa21.6■■□□□ 1.05
PRSS8-201ENST00000317508 CEP170Q5SW79 1584 aa21.6■■□□□ 1.05
PRSS8-201ENST00000317508 ARHGEF11O15085 1522 aa21.59■■□□□ 1.05
PRSS8-201ENST00000317508 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.59■■□□□ 1.05
PRSS8-201ENST00000317508 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.57■■□□□ 1.04
PRSS8-201ENST00000317508 HECW1Q76N89 1606 aa21.57■■□□□ 1.04
PRSS8-201ENST00000317508 UACAQ9BZF9 1416 aa21.56■■□□□ 1.04
PRSS8-201ENST00000317508 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PRSS8-201ENST00000317508 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.51■■□□□ 1.03
PRSS8-201ENST00000317508 CHD1O14646 1710 aa21.51■■□□□ 1.03
PRSS8-201ENST00000317508 JPH4Q96JJ6 628 aa21.49■■□□□ 1.03
PRSS8-201ENST00000317508 NAIPQ13075 1403 aa21.49■■□□□ 1.03
PRSS8-201ENST00000317508 PTPRKQ15262 1439 aa21.49■■□□□ 1.03
PRSS8-201ENST00000317508 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRSS8-201ENST00000317508 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.49■■□□□ 1.03
PRSS8-201ENST00000317508 AKNAQ7Z591 1439 aa21.48■■□□□ 1.03
PRSS8-201ENST00000317508 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.45■■□□□ 1.02
PRSS8-201ENST00000317508 DISP1Q96F81 1524 aa21.44■■□□□ 1.02
PRSS8-201ENST00000317508 TONSLQ96HA7 1378 aa21.42■■□□□ 1.02
PRSS8-201ENST00000317508 MIA2Q96PC5 1412 aa21.42■■□□□ 1.02
PRSS8-201ENST00000317508 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PRSS8-201ENST00000317508 KIAA0556O60303 1618 aa21.4■■□□□ 1.02
PRSS8-201ENST00000317508 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.39■■□□□ 1.02
PRSS8-201ENST00000317508 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PRSS8-201ENST00000317508 CCER2I3L3R5 266 aa21.32■■□□□ 1
PRSS8-201ENST00000317508 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PRSS8-201ENST00000317508 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.32■■□□□ 1
PRSS8-201ENST00000317508 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PRSS8-201ENST00000317508 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.3■■□□□ 1
PRSS8-201ENST00000317508 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PRSS8-201ENST00000317508 SHROOM2Q13796 1616 aa21.28■■□□□ 1
PRSS8-201ENST00000317508 OSCARQ8IYS5 282 aa21.26■□□□□ 0.99
PRSS8-201ENST00000317508 ROCK1Q13464 1354 aa21.25■□□□□ 0.99
PRSS8-201ENST00000317508 ANP32CO43423 234 aa21.23■□□□□ 0.99
PRSS8-201ENST00000317508 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PRSS8-201ENST00000317508 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.23■□□□□ 0.99
PRSS8-201ENST00000317508 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PRSS8-201ENST00000317508 KCNH8Q96L42 1107 aa21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms