RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313683.14

PNMA8A-201, Transcript of PNMA family member 8A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PNMA8A, Length 3,689 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8A-201ENST00000313683 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.64■□□□□ 0.25
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PNMA8A-201ENST00000313683 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PNMA8A-201ENST00000313683 FOXD1Q16676 465 aa16.57■□□□□ 0.24
PNMA8A-201ENST00000313683 TOPBP1Q92547 1522 aa16.55■□□□□ 0.24
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PNMA8A-201ENST00000313683 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.52■□□□□ 0.24
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PNMA8A-201ENST00000313683 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.47■□□□□ 0.23
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PNMA8A-201ENST00000313683 KIF21BO75037 1637 aa16.46■□□□□ 0.23
PNMA8A-201ENST00000313683 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.46■□□□□ 0.22
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PNMA8A-201ENST00000313683 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PNMA8A-201ENST00000313683 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
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PNMA8A-201ENST00000313683 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
PNMA8A-201ENST00000313683 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.42■□□□□ 0.22
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PNMA8A-201ENST00000313683 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.42■□□□□ 0.22
PNMA8A-201ENST00000313683 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PNMA8A-201ENST00000313683 MIER1Q8N108 512 aa16.37■□□□□ 0.21
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PNMA8A-201ENST00000313683 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.34■□□□□ 0.21
PNMA8A-201ENST00000313683 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.33■□□□□ 0.21
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PNMA8A-201ENST00000313683 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
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PNMA8A-201ENST00000313683 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.27■□□□□ 0.2
PNMA8A-201ENST00000313683 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.27■□□□□ 0.2
PNMA8A-201ENST00000313683 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.25■□□□□ 0.19
PNMA8A-201ENST00000313683 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.24■□□□□ 0.19
PNMA8A-201ENST00000313683 FMN1Q68DA7 1419 aa16.23■□□□□ 0.19
PNMA8A-201ENST00000313683 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PNMA8A-201ENST00000313683 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.2■□□□□ 0.18
PNMA8A-201ENST00000313683 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.2■□□□□ 0.18
PNMA8A-201ENST00000313683 GRIN2BQ13224 1484 aa16.19■□□□□ 0.18
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PNMA8A-201ENST00000313683 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.16■□□□□ 0.18
PNMA8A-201ENST00000313683 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.15■□□□□ 0.18
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PNMA8A-201ENST00000313683 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.12■□□□□ 0.17
PNMA8A-201ENST00000313683 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PNMA8A-201ENST00000313683 MLECQ14165 292 aa16.12■□□□□ 0.17
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PNMA8A-201ENST00000313683 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
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PNMA8A-201ENST00000313683 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.09■□□□□ 0.17
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PNMA8A-201ENST00000313683 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.07■□□□□ 0.16
PNMA8A-201ENST00000313683 IFT140Q96RY7 1462 aa16.07■□□□□ 0.16
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PNMA8A-201ENST00000313683 AFAP1Q8N556 730 aa16.03■□□□□ 0.16
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PNMA8A-201ENST00000313683 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.01■□□□□ 0.15
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PNMA8A-201ENST00000313683 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
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PNMA8A-201ENST00000313683 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PNMA8A-201ENST00000313683 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.93■□□□□ 0.14
PNMA8A-201ENST00000313683 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.92■□□□□ 0.14
PNMA8A-201ENST00000313683 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PNMA8A-201ENST00000313683 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.92■□□□□ 0.14
PNMA8A-201ENST00000313683 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PNMA8A-201ENST00000313683 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
PNMA8A-201ENST00000313683 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.91■□□□□ 0.14
PNMA8A-201ENST00000313683 IQGAP2Q13576 1575 aa15.9■□□□□ 0.14
PNMA8A-201ENST00000313683 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
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