RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311694.7

HECTD4-201, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 2,734 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-201ENST00000311694 BCL11AQ9H165 835 aa11.72□□□□□ -0.53
HECTD4-201ENST00000311694 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.71□□□□□ -0.54
HECTD4-201ENST00000311694 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
HECTD4-201ENST00000311694 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
HECTD4-201ENST00000311694 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HECTD4-201ENST00000311694 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.66□□□□□ -0.54
HECTD4-201ENST00000311694 MIER1Q8N108 512 aa11.66□□□□□ -0.54
HECTD4-201ENST00000311694 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.66□□□□□ -0.54
HECTD4-201ENST00000311694 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 19.7
HECTD4-201ENST00000311694 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.62□□□□□ -0.55
HECTD4-201ENST00000311694 WDR97A6NE52 1622 aa11.62□□□□□ -0.55
HECTD4-201ENST00000311694 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.61□□□□□ -0.55
HECTD4-201ENST00000311694 ERCC6Q03468 1493 aa11.61□□□□□ -0.55
HECTD4-201ENST00000311694 ITGAEP38570 1179 aa11.6□□□□□ -0.55
HECTD4-201ENST00000311694 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.6□□□□□ -0.55
HECTD4-201ENST00000311694 CUL7Q14999 1698 aa11.6□□□□□ -0.55
HECTD4-201ENST00000311694 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
HECTD4-201ENST00000311694 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.58□□□□□ -0.55
HECTD4-201ENST00000311694 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.57□□□□□ -0.56
HECTD4-201ENST00000311694 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
HECTD4-201ENST00000311694 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
HECTD4-201ENST00000311694 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.54□□□□□ -0.56
HECTD4-201ENST00000311694 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.52□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 FBLN2P98095 1184 aa11.51□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 PBRM1Q86U86 1689 aa11.51□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 ARID3CA6NKF2 412 aa11.51□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 TIAM1Q13009 1591 aa11.5□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 WDR62O43379 1518 aa11.5□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 IFT140Q96RY7 1462 aa11.49□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 GRIN2BQ13224 1484 aa11.49□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.48□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.48□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.47□□□□□ -0.57
HECTD4-201ENST00000311694 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.46□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 ADAMTS12P58397 1594 aa11.45□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.45□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 FMN1Q68DA7 1419 aa11.45□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.45□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.44□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.42□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 MAP3K1Q13233 1512 aa11.41□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 SAMD9Q5K651 1589 aa11.41□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 IQGAP2Q13576 1575 aa11.41□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.4□□□□□ -0.58
HECTD4-201ENST00000311694 GRIN2AQ12879 1464 aa11.37□□□□□ -0.59
HECTD4-201ENST00000311694 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
HECTD4-201ENST00000311694 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.36□□□□□ -0.59
HECTD4-201ENST00000311694 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.34□□□□□ -0.59
HECTD4-201ENST00000311694 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HECTD4-201ENST00000311694 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.34□□□□□ -0.59
HECTD4-201ENST00000311694 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 SYNJ2O15056 1496 aa11.32□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 NCOA2Q15596 1464 aa11.31□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.31□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 DISP1Q96F81 1524 aa11.3□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.3□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 JPH4Q96JJ6 628 aa11.3□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 CEP170Q5SW79 1584 aa11.3□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.3□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.29□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.28□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 KIAA0556O60303 1618 aa11.28□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 HECW1Q76N89 1606 aa11.28□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HECTD4-201ENST00000311694 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.26□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.26□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.26□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 PTPRKQ15262 1439 aa11.24□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.24□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.24□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.24□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 NUP160Q12769 1436 aa11.22□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.22□□□□□ -0.61
HECTD4-201ENST00000311694 MSH5O43196 834 aa11.21□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.2□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 BCANQ96GW7 911 aa11.2□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.2□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 MAPKBP1O60336 1514 aa11.19□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 FKBP8Q14318 412 aa11.19□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 ARHGEF11O15085 1522 aa11.17□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 TRIM52Q96A61 297 aa11.16□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 KCNH8Q96L42 1107 aa11.16□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 CHD1O14646 1710 aa11.16□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 NAIPQ13075 1403 aa11.15□□□□□ -0.62
HECTD4-201ENST00000311694 HFM1A2PYH4 1435 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms