RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310418.8

CLTB-201, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-201ENST00000310418 IGF1RP08069 1367 aa39.59■■■■□ 3.93
CLTB-201ENST00000310418 CUL7Q14999 1698 aa39.51■■■■□ 3.92
CLTB-201ENST00000310418 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.4■■■■□ 3.9
CLTB-201ENST00000310418 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.33■■■■□ 3.89
CLTB-201ENST00000310418 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.15■■■■□ 3.86
CLTB-201ENST00000310418 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.14■■■■□ 3.86
CLTB-201ENST00000310418 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.14■■■■□ 3.86
CLTB-201ENST00000310418 MAPKBP1O60336 1514 aa39.06■■■■□ 3.84
CLTB-201ENST00000310418 IQGAP2Q13576 1575 aa39.05■■■■□ 3.84
CLTB-201ENST00000310418 PTPRGP23470 1445 aa39.02■■■■□ 3.84
CLTB-201ENST00000310418 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.02■■■■□ 3.84
CLTB-201ENST00000310418 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39■■■■□ 3.83
CLTB-201ENST00000310418 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.99■■■■□ 3.83
CLTB-201ENST00000310418 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.97■■■■□ 3.83
CLTB-201ENST00000310418 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.96■■■■□ 3.83
CLTB-201ENST00000310418 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
CLTB-201ENST00000310418 DIP2BQ9P265 1576 aa38.91■■■■□ 3.82
CLTB-201ENST00000310418 DISP1Q96F81 1524 aa38.85■■■■□ 3.81
CLTB-201ENST00000310418 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.81■■■■□ 3.8
CLTB-201ENST00000310418 ABCC2Q92887 1545 aa38.79■■■■□ 3.8
CLTB-201ENST00000310418 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
CLTB-201ENST00000310418 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.73■■■■□ 3.79
CLTB-201ENST00000310418 UACAQ9BZF9 1416 aa38.72■■■■□ 3.79
CLTB-201ENST00000310418 KIAA0556O60303 1618 aa38.7■■■■□ 3.79
CLTB-201ENST00000310418 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.67■■■■□ 3.78
CLTB-201ENST00000310418 ASXL2Q76L83 1435 aa38.64■■■■□ 3.78
CLTB-201ENST00000310418 TSPOAP1O95153 1857 aa38.63■■■■□ 3.77
CLTB-201ENST00000310418 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.62■■■■□ 3.77
CLTB-201ENST00000310418 PRXQ9BXM0 1461 aa38.62■■■■□ 3.77
CLTB-201ENST00000310418 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.56■■■■□ 3.76
CLTB-201ENST00000310418 KDM6BO15054 1643 aa38.54■■■■□ 3.76
CLTB-201ENST00000310418 GOLGA3Q08378 1498 aa38.52■■■■□ 3.76
CLTB-201ENST00000310418 GLI2P10070 1586 aa38.52■■■■□ 3.76
CLTB-201ENST00000310418 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
CLTB-201ENST00000310418 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
CLTB-201ENST00000310418 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
CLTB-201ENST00000310418 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.37■■■■□ 3.73
CLTB-201ENST00000310418 ABCA8O94911 1581 aa38.33■■■■□ 3.73
CLTB-201ENST00000310418 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.31■■■■□ 3.72
CLTB-201ENST00000310418 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.29■■■■□ 3.72
CLTB-201ENST00000310418 EEA1Q15075 1411 aa38.23■■■■□ 3.71
CLTB-201ENST00000310418 P3H3Q8IVL6 736 aa38.2■■■■□ 3.71
CLTB-201ENST00000310418 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.2■■■■□ 3.71
CLTB-201ENST00000310418 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
CLTB-201ENST00000310418 SAMD9Q5K651 1589 aa38.13■■■■□ 3.69
CLTB-201ENST00000310418 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
CLTB-201ENST00000310418 KCNH8Q96L42 1107 aa38.11■■■■□ 3.69
CLTB-201ENST00000310418 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.09■■■■□ 3.69
CLTB-201ENST00000310418 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.05■■■■□ 3.68
CLTB-201ENST00000310418 CD109Q6YHK3 1445 aa38.04■■■■□ 3.68
CLTB-201ENST00000310418 ARID3CA6NKF2 412 aa38.04■■■■□ 3.68
CLTB-201ENST00000310418 ATP10BO94823 1461 aa38.02■■■■□ 3.68
CLTB-201ENST00000310418 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.01■■■■□ 3.67
CLTB-201ENST00000310418 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
CLTB-201ENST00000310418 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.96■■■■□ 3.67
CLTB-201ENST00000310418 KIF21BO75037 1637 aa37.93■■■■□ 3.66
CLTB-201ENST00000310418 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.88■■■■□ 3.66
CLTB-201ENST00000310418 ADGRL1O94910 1474 aa37.83■■■■□ 3.65
CLTB-201ENST00000310418 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
CLTB-201ENST00000310418 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
CLTB-201ENST00000310418 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
CLTB-201ENST00000310418 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.79■■■■□ 3.64
CLTB-201ENST00000310418 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.79■■■■□ 3.64
CLTB-201ENST00000310418 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.78■■■■□ 3.64
CLTB-201ENST00000310418 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.71■■■■□ 3.63
CLTB-201ENST00000310418 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.67■■■■□ 3.62
CLTB-201ENST00000310418 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
CLTB-201ENST00000310418 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.65■■■■□ 3.62
CLTB-201ENST00000310418 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.61■■■■□ 3.61
CLTB-201ENST00000310418 NEO1Q92859 1461 aa37.58■■■■□ 3.61
CLTB-201ENST00000310418 RAPGEF3O95398 923 aa37.49■■■■□ 3.59
CLTB-201ENST00000310418 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
CLTB-201ENST00000310418 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.46■■■■□ 3.59
CLTB-201ENST00000310418 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.45■■■■□ 3.599e-9■■■■□ 22.3
CLTB-201ENST00000310418 FMN1Q68DA7 1419 aa37.44■■■■□ 3.58
CLTB-201ENST00000310418 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.4■■■■□ 3.58
CLTB-201ENST00000310418 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.39■■■■□ 3.58
CLTB-201ENST00000310418 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
CLTB-201ENST00000310418 HECW1Q76N89 1606 aa37.38■■■■□ 3.57
CLTB-201ENST00000310418 FANCAO15360 1455 aa37.36■■■■□ 3.57
CLTB-201ENST00000310418 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.35■■■■□ 3.57
CLTB-201ENST00000310418 AKNAQ7Z591 1439 aa37.35■■■■□ 3.57
CLTB-201ENST00000310418 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
CLTB-201ENST00000310418 RICTORQ6R327 1708 aa37.27■■■■□ 3.56
CLTB-201ENST00000310418 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.26■■■■□ 3.56
CLTB-201ENST00000310418 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
CLTB-201ENST00000310418 PLCH2O75038 1416 aa37.21■■■■□ 3.55
CLTB-201ENST00000310418 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.21■■■■□ 3.55
CLTB-201ENST00000310418 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.2■■■■□ 3.55
CLTB-201ENST00000310418 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
CLTB-201ENST00000310418 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.15■■■■□ 3.54
CLTB-201ENST00000310418 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.15■■■■□ 3.54
CLTB-201ENST00000310418 KIF14Q15058 1648 aa37.14■■■■□ 3.54
CLTB-201ENST00000310418 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.13■■■■□ 3.54
CLTB-201ENST00000310418 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
CLTB-201ENST00000310418 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.13■■■■□ 3.53
CLTB-201ENST00000310418 PTPRMP28827 1452 aa37.11■■■■□ 3.53
CLTB-201ENST00000310418 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.1■■■■□ 3.53
CLTB-201ENST00000310418 CLIP1P30622 1438 aa37.08■■■■□ 3.53
CLTB-201ENST00000310418 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.07■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms