RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 CEP170Q5SW79 1584 aa32.23■■■□□ 2.75
PPARG-202ENST00000309576 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.16■■■□□ 2.74
PPARG-202ENST00000309576 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.13■■■□□ 2.73
PPARG-202ENST00000309576 IQGAP2Q13576 1575 aa32.07■■■□□ 2.72
PPARG-202ENST00000309576 CEP162Q5TB80 1403 aa32.06■■■□□ 2.72
PPARG-202ENST00000309576 OSCARQ8IYS5 282 aa32.02■■■□□ 2.72
PPARG-202ENST00000309576 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.01■■■□□ 2.71
PPARG-202ENST00000309576 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
PPARG-202ENST00000309576 CLIP1P30622 1438 aa31.98■■■□□ 2.71
PPARG-202ENST00000309576 JPH4Q96JJ6 628 aa31.96■■■□□ 2.71
PPARG-202ENST00000309576 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.95■■■□□ 2.71
PPARG-202ENST00000309576 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.92■■■□□ 2.7
PPARG-202ENST00000309576 SHROOM2Q13796 1616 aa31.87■■■□□ 2.69
PPARG-202ENST00000309576 SAMD9Q5K651 1589 aa31.86■■■□□ 2.69
PPARG-202ENST00000309576 DISP1Q96F81 1524 aa31.85■■■□□ 2.69
PPARG-202ENST00000309576 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.85■■■□□ 2.69
PPARG-202ENST00000309576 ARAP1Q96P48 1450 aa31.81■■■□□ 2.68
PPARG-202ENST00000309576 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
PPARG-202ENST00000309576 P3H3Q8IVL6 736 aa31.79■■■□□ 2.68
PPARG-202ENST00000309576 KIAA0556O60303 1618 aa31.76■■■□□ 2.68
PPARG-202ENST00000309576 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.75■■■□□ 2.67
PPARG-202ENST00000309576 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.73■■■□□ 2.67
PPARG-202ENST00000309576 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.7■■■□□ 2.67
PPARG-202ENST00000309576 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.61■■■□□ 2.65
PPARG-202ENST00000309576 FMN1Q68DA7 1419 aa31.56■■■□□ 2.64
PPARG-202ENST00000309576 PTPRGP23470 1445 aa31.52■■■□□ 2.64
PPARG-202ENST00000309576 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.64
PPARG-202ENST00000309576 ARHGEF11O15085 1522 aa31.5■■■□□ 2.63
PPARG-202ENST00000309576 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.45■■■□□ 2.63
PPARG-202ENST00000309576 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.43■■■□□ 2.62
PPARG-202ENST00000309576 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
PPARG-202ENST00000309576 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.39■■■□□ 2.62
PPARG-202ENST00000309576 ABCA8O94911 1581 aa31.38■■■□□ 2.61
PPARG-202ENST00000309576 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.37■■■□□ 2.61
PPARG-202ENST00000309576 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.37■■■□□ 2.61
PPARG-202ENST00000309576 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.37■■■□□ 2.61
PPARG-202ENST00000309576 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.34■■■□□ 2.61
PPARG-202ENST00000309576 UACAQ9BZF9 1416 aa31.34■■■□□ 2.61
PPARG-202ENST00000309576 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
PPARG-202ENST00000309576 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
PPARG-202ENST00000309576 HECW1Q76N89 1606 aa31.27■■■□□ 2.6
PPARG-202ENST00000309576 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.25■■■□□ 2.59
PPARG-202ENST00000309576 ABCC2Q92887 1545 aa31.25■■■□□ 2.59
PPARG-202ENST00000309576 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
PPARG-202ENST00000309576 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.22■■■□□ 2.59
PPARG-202ENST00000309576 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.2■■■□□ 2.58
PPARG-202ENST00000309576 MAP3K1Q13233 1512 aa31.19■■■□□ 2.58
PPARG-202ENST00000309576 ARID3CA6NKF2 412 aa31.19■■■□□ 2.58
PPARG-202ENST00000309576 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.19■■■□□ 2.58
PPARG-202ENST00000309576 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.17■■■□□ 2.58
PPARG-202ENST00000309576 APLP2Q06481 763 aa31.17■■■□□ 2.58
PPARG-202ENST00000309576 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.17■■■□□ 2.58
PPARG-202ENST00000309576 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
PPARG-202ENST00000309576 ATP10BO94823 1461 aa31.17■■■□□ 2.58
PPARG-202ENST00000309576 TIAM1Q13009 1591 aa31.16■■■□□ 2.58
PPARG-202ENST00000309576 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
PPARG-202ENST00000309576 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.12■■■□□ 2.57
PPARG-202ENST00000309576 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.11■■■□□ 2.57
PPARG-202ENST00000309576 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
PPARG-202ENST00000309576 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.05■■■□□ 2.56
PPARG-202ENST00000309576 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
PPARG-202ENST00000309576 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PPARG-202ENST00000309576 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.04■■■□□ 2.56
PPARG-202ENST00000309576 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
PPARG-202ENST00000309576 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
PPARG-202ENST00000309576 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.96■■■□□ 2.55
PPARG-202ENST00000309576 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.93■■■□□ 2.54
PPARG-202ENST00000309576 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
PPARG-202ENST00000309576 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.92■■■□□ 2.54
PPARG-202ENST00000309576 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.92■■■□□ 2.54
PPARG-202ENST00000309576 ASXL2Q76L83 1435 aa30.85■■■□□ 2.53
PPARG-202ENST00000309576 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.82■■■□□ 2.52
PPARG-202ENST00000309576 NCOA2Q15596 1464 aa30.79■■■□□ 2.52
PPARG-202ENST00000309576 MAPKBP1O60336 1514 aa30.79■■■□□ 2.52
PPARG-202ENST00000309576 KIF14Q15058 1648 aa30.77■■■□□ 2.52
PPARG-202ENST00000309576 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
PPARG-202ENST00000309576 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.75■■■□□ 2.51
PPARG-202ENST00000309576 KCNH8Q96L42 1107 aa30.74■■■□□ 2.51
PPARG-202ENST00000309576 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.72■■■□□ 2.51
PPARG-202ENST00000309576 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.67■■■□□ 2.5
PPARG-202ENST00000309576 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.62■■■□□ 2.49
PPARG-202ENST00000309576 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
PPARG-202ENST00000309576 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.62■■■□□ 2.49
PPARG-202ENST00000309576 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.62■■■□□ 2.49
PPARG-202ENST00000309576 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PPARG-202ENST00000309576 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.57■■■□□ 2.48
PPARG-202ENST00000309576 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.55■■■□□ 2.48
PPARG-202ENST00000309576 MIA2Q96PC5 1412 aa30.52■■■□□ 2.48
PPARG-202ENST00000309576 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.51■■■□□ 2.48
PPARG-202ENST00000309576 DIP2BQ9P265 1576 aa30.51■■■□□ 2.48
PPARG-202ENST00000309576 GLI2P10070 1586 aa30.51■■■□□ 2.47
PPARG-202ENST00000309576 PLCH2O75038 1416 aa30.51■■■□□ 2.47
PPARG-202ENST00000309576 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
PPARG-202ENST00000309576 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
PPARG-202ENST00000309576 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.47■■■□□ 2.47
PPARG-202ENST00000309576 PREX2Q70Z35 1606 aa30.47■■■□□ 2.47
PPARG-202ENST00000309576 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.47■■■□□ 2.47
PPARG-202ENST00000309576 CD109Q6YHK3 1445 aa30.45■■■□□ 2.46
PPARG-202ENST00000309576 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.44■■■□□ 2.46
PPARG-202ENST00000309576 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms