RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.83■■■■□ 3.49
HOXD4-201ENST00000306324 SHROOM2Q13796 1616 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF11O15085 1522 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXD4-201ENST00000306324 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXD4-201ENST00000306324 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXD4-201ENST00000306324 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXD4-201ENST00000306324 IQGAP2Q13576 1575 aa36.77■■■■□ 3.48
HOXD4-201ENST00000306324 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXD4-201ENST00000306324 JPH4Q96JJ6 628 aa36.74■■■■□ 3.47
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA3Q08378 1498 aa36.67■■■■□ 3.46
HOXD4-201ENST00000306324 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.65■■■■□ 3.46
HOXD4-201ENST00000306324 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
HOXD4-201ENST00000306324 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
HOXD4-201ENST00000306324 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.53■■■■□ 3.44
HOXD4-201ENST00000306324 ARAP1Q96P48 1450 aa36.52■■■■□ 3.44
HOXD4-201ENST00000306324 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXD4-201ENST00000306324 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.44■■■■□ 3.42
HOXD4-201ENST00000306324 DISP1Q96F81 1524 aa36.44■■■■□ 3.42
HOXD4-201ENST00000306324 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0556O60303 1618 aa36.41■■■■□ 3.42
HOXD4-201ENST00000306324 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
HOXD4-201ENST00000306324 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXD4-201ENST00000306324 SAMD9Q5K651 1589 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXD4-201ENST00000306324 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.26■■■■□ 3.4
HOXD4-201ENST00000306324 P3H3Q8IVL6 736 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRGP23470 1445 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXD4-201ENST00000306324 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.21■■■■□ 3.39
HOXD4-201ENST00000306324 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.11■■■■□ 3.37
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXD4-201ENST00000306324 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXD4-201ENST00000306324 CLIP1P30622 1438 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXD4-201ENST00000306324 UACAQ9BZF9 1416 aa36.02■■■■□ 3.36
HOXD4-201ENST00000306324 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXD4-201ENST00000306324 CEP162Q5TB80 1403 aa35.98■■■■□ 3.35
HOXD4-201ENST00000306324 ABCC2Q92887 1545 aa35.96■■■■□ 3.35
HOXD4-201ENST00000306324 ABCA8O94911 1581 aa35.95■■■■□ 3.35
HOXD4-201ENST00000306324 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.94■■■■□ 3.34
HOXD4-201ENST00000306324 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.9■■■■□ 3.34
HOXD4-201ENST00000306324 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.89■■■■□ 3.34
HOXD4-201ENST00000306324 FMN1Q68DA7 1419 aa35.86■■■■□ 3.33
HOXD4-201ENST00000306324 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
HOXD4-201ENST00000306324 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.78■■■■□ 3.32
HOXD4-201ENST00000306324 ARID3CA6NKF2 412 aa35.75■■■■□ 3.31
HOXD4-201ENST00000306324 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
HOXD4-201ENST00000306324 MAPKBP1O60336 1514 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXD4-201ENST00000306324 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
HOXD4-201ENST00000306324 HECW1Q76N89 1606 aa35.68■■■■□ 3.3
HOXD4-201ENST00000306324 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
HOXD4-201ENST00000306324 ATP10BO94823 1461 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXD4-201ENST00000306324 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
HOXD4-201ENST00000306324 ASXL2Q76L83 1435 aa35.61■■■■□ 3.29
HOXD4-201ENST00000306324 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
HOXD4-201ENST00000306324 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXD4-201ENST00000306324 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.57■■■■□ 3.29
HOXD4-201ENST00000306324 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
HOXD4-201ENST00000306324 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
HOXD4-201ENST00000306324 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.52■■■■□ 3.28
HOXD4-201ENST00000306324 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.5■■■■□ 3.27
HOXD4-201ENST00000306324 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.5■■■■□ 3.27
HOXD4-201ENST00000306324 DIP2BQ9P265 1576 aa35.48■■■■□ 3.27
HOXD4-201ENST00000306324 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.48■■■■□ 3.27
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.45■■■■□ 3.27
HOXD4-201ENST00000306324 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.41■■■■□ 3.26
HOXD4-201ENST00000306324 KCNH8Q96L42 1107 aa35.41■■■■□ 3.26
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.4■■■■□ 3.26
HOXD4-201ENST00000306324 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
HOXD4-201ENST00000306324 GLI2P10070 1586 aa35.32■■■■□ 3.25
HOXD4-201ENST00000306324 TSPOAP1O95153 1857 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.26■■■■□ 3.24
HOXD4-201ENST00000306324 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXD4-201ENST00000306324 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXD4-201ENST00000306324 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
HOXD4-201ENST00000306324 TIAM1Q13009 1591 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXD4-201ENST00000306324 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXD4-201ENST00000306324 KIF14Q15058 1648 aa35.18■■■■□ 3.22
HOXD4-201ENST00000306324 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXD4-201ENST00000306324 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
HOXD4-201ENST00000306324 APLP2Q06481 763 aa35.14■■■■□ 3.22
HOXD4-201ENST00000306324 CD109Q6YHK3 1445 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXD4-201ENST00000306324 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXD4-201ENST00000306324 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
HOXD4-201ENST00000306324 MAP3K1Q13233 1512 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXD4-201ENST00000306324 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXD4-201ENST00000306324 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.03■■■■□ 3.2
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXD4-201ENST00000306324 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.01■■■■□ 3.19
HOXD4-201ENST00000306324 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
HOXD4-201ENST00000306324 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
HOXD4-201ENST00000306324 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXD4-201ENST00000306324 PLCH2O75038 1416 aa34.9■■■■□ 3.18
HOXD4-201ENST00000306324 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.9■■■■□ 3.18
HOXD4-201ENST00000306324 PREX2Q70Z35 1606 aa34.89■■■■□ 3.18
HOXD4-201ENST00000306324 NCOA2Q15596 1464 aa34.88■■■■□ 3.17
HOXD4-201ENST00000306324 FANCAO15360 1455 aa34.86■■■■□ 3.17
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.86■■■■□ 3.17
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.85■■■■□ 3.17
HOXD4-201ENST00000306324 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.85■■■■□ 3.17
HOXD4-201ENST00000306324 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.84■■■■□ 3.17
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