RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305031.4

CHSY3-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY3, Length 3,850 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3-201ENST00000305031 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.51■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.5■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.47■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.47■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.46■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 NBR1Q14596 966 aa22.45■■□□□ 1.18
CHSY3-201ENST00000305031 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.42■■□□□ 1.18
CHSY3-201ENST00000305031 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CHSY3-201ENST00000305031 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CHSY3-201ENST00000305031 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.4■■□□□ 1.18
CHSY3-201ENST00000305031 NCAPD3P42695 1498 aa22.38■■□□□ 1.17
CHSY3-201ENST00000305031 TONSLQ96HA7 1378 aa22.37■■□□□ 1.17
CHSY3-201ENST00000305031 IGF1RP08069 1367 aa22.35■■□□□ 1.17
CHSY3-201ENST00000305031 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.34■■□□□ 1.17
CHSY3-201ENST00000305031 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CHSY3-201ENST00000305031 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.32■■□□□ 1.16
CHSY3-201ENST00000305031 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CHSY3-201ENST00000305031 KIF21BO75037 1637 aa22.29■■□□□ 1.16
CHSY3-201ENST00000305031 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.28■■□□□ 1.16
CHSY3-201ENST00000305031 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.26■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 BCL11AQ9H165 835 aa22.26■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.25■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 ARAP1Q96P48 1450 aa22.24■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.24■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 CUX1P39880 1505 aa22.21■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.2■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 CFTRP13569 1480 aa22.2■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 NESP48681 1621 aa22.19■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.19■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 MRS2Q9HD23 443 aa22.17■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 FOXD1Q16676 465 aa22.16■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.15■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 PRXQ9BXM0 1461 aa22.14■■□□□ 1.13
CHSY3-201ENST00000305031 TOP2BQ02880 1626 aa22.12■■□□□ 1.13
CHSY3-201ENST00000305031 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.12■■□□□ 1.13
CHSY3-201ENST00000305031 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CHSY3-201ENST00000305031 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.09■■□□□ 1.13
CHSY3-201ENST00000305031 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.07■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.06■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.06■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.04■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.03■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
CHSY3-201ENST00000305031 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CHSY3-201ENST00000305031 HMGXB3Q12766 1538 aa21.98■■□□□ 1.11
CHSY3-201ENST00000305031 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.97■■□□□ 1.11
CHSY3-201ENST00000305031 ERCC6Q03468 1493 aa21.96■■□□□ 1.11
CHSY3-201ENST00000305031 TSPY4P0CV99 314 aa21.94■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 TSPY10P0CW01 314 aa21.94■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 FMN1Q68DA7 1419 aa21.94■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.94■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.92■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 RGL3Q3MIN7 710 aa21.89■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 ARXQ96QS3 562 aa21.88■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 TMC1Q8TDI8 760 aa21.86■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.86■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.84■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 TOPBP1Q92547 1522 aa21.81■■□□□ 1.08
CHSY3-201ENST00000305031 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.81■■□□□ 1.08
CHSY3-201ENST00000305031 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CHSY3-201ENST00000305031 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CHSY3-201ENST00000305031 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CHSY3-201ENST00000305031 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
CHSY3-201ENST00000305031 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.76■■□□□ 1.07
CHSY3-201ENST00000305031 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CHSY3-201ENST00000305031 JPH4Q96JJ6 628 aa21.72■■□□□ 1.07
CHSY3-201ENST00000305031 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.71■■□□□ 1.07
CHSY3-201ENST00000305031 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.7■■□□□ 1.06
CHSY3-201ENST00000305031 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.69■■□□□ 1.06
CHSY3-201ENST00000305031 PKD2Q13563 968 aa21.69■■□□□ 1.06
CHSY3-201ENST00000305031 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.67■■□□□ 1.06
CHSY3-201ENST00000305031 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CHSY3-201ENST00000305031 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.64■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.64■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.63■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.62■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 CCER2I3L3R5 266 aa21.62■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 TIAM1Q13009 1591 aa21.62■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 NCOA2Q15596 1464 aa21.58■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CHSY3-201ENST00000305031 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.56■■□□□ 1.04
CHSY3-201ENST00000305031 CCDC184Q52MB2 194 aa21.56■■□□□ 1.04
CHSY3-201ENST00000305031 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.56■■□□□ 1.04
CHSY3-201ENST00000305031 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.55■■□□□ 1.04
CHSY3-201ENST00000305031 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms