RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.06■■□□□ 1.76
TSPAN17-201ENST00000298564 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.04■■□□□ 1.76
TSPAN17-201ENST00000298564 ITGAEP38570 1179 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPAN17-201ENST00000298564 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
TSPAN17-201ENST00000298564 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
TSPAN17-201ENST00000298564 TIAM1Q13009 1591 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPAN17-201ENST00000298564 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN17-201ENST00000298564 MAP3K1Q13233 1512 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN17-201ENST00000298564 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN17-201ENST00000298564 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN17-201ENST00000298564 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN17-201ENST00000298564 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN17-201ENST00000298564 CUL7Q14999 1698 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN17-201ENST00000298564 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN17-201ENST00000298564 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TSPAN17-201ENST00000298564 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TSPAN17-201ENST00000298564 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.86■■□□□ 1.73
TSPAN17-201ENST00000298564 WDR97A6NE52 1622 aa25.85■■□□□ 1.73
TSPAN17-201ENST00000298564 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.82■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.81■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.81■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 KCNH8Q96L42 1107 aa25.79■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.79■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.79■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.79■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.78■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.77■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.77■■□□□ 1.72
TSPAN17-201ENST00000298564 BCANQ96GW7 911 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPAN17-201ENST00000298564 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
TSPAN17-201ENST00000298564 FMN1Q68DA7 1419 aa25.7■■□□□ 1.71
TSPAN17-201ENST00000298564 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPAN17-201ENST00000298564 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPAN17-201ENST00000298564 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TSPAN17-201ENST00000298564 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.64■■□□□ 1.69
TSPAN17-201ENST00000298564 SAMD9Q5K651 1589 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPAN17-201ENST00000298564 MAPKBP1O60336 1514 aa25.59■■□□□ 1.69
TSPAN17-201ENST00000298564 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.57■■□□□ 1.68
TSPAN17-201ENST00000298564 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
TSPAN17-201ENST00000298564 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN17-201ENST00000298564 GRIN2BQ13224 1484 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN17-201ENST00000298564 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN17-201ENST00000298564 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN17-201ENST00000298564 PBRM1Q86U86 1689 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN17-201ENST00000298564 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN17-201ENST00000298564 NCOA2Q15596 1464 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPAN17-201ENST00000298564 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TSPAN17-201ENST00000298564 FKBP8Q14318 412 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPAN17-201ENST00000298564 ADAMTS12P58397 1594 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPAN17-201ENST00000298564 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPAN17-201ENST00000298564 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TSPAN17-201ENST00000298564 PTPRKQ15262 1439 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TSPAN17-201ENST00000298564 IQGAP2Q13576 1575 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPAN17-201ENST00000298564 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPAN17-201ENST00000298564 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.35■■□□□ 1.65
TSPAN17-201ENST00000298564 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TSPAN17-201ENST00000298564 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.34■■□□□ 1.65
TSPAN17-201ENST00000298564 IFT140Q96RY7 1462 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPAN17-201ENST00000298564 ARID3CA6NKF2 412 aa25.32■■□□□ 1.64
TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM52Q96A61 297 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPAN17-201ENST00000298564 HFM1A2PYH4 1435 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPAN17-201ENST00000298564 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPAN17-201ENST00000298564 WDR62O43379 1518 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPAN17-201ENST00000298564 HECW1Q76N89 1606 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPAN17-201ENST00000298564 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17-201ENST00000298564 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGEF11O15085 1522 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPAN17-201ENST00000298564 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPAN17-201ENST00000298564 NAIPQ13075 1403 aa25.24■■□□□ 1.63
TSPAN17-201ENST00000298564 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TSPAN17-201ENST00000298564 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TSPAN17-201ENST00000298564 UACAQ9BZF9 1416 aa25.21■■□□□ 1.63
TSPAN17-201ENST00000298564 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.21■■□□□ 1.63
TSPAN17-201ENST00000298564 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPAN17-201ENST00000298564 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPAN17-201ENST00000298564 ERCC6Q03468 1493 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPAN17-201ENST00000298564 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TSPAN17-201ENST00000298564 DISP1Q96F81 1524 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 GRIN2AQ12879 1464 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 TONSLQ96HA7 1378 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 BCL11AQ9H165 835 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 KIAA0556O60303 1618 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 NEFLP07196 543 aa25.08■■□□□ 1.6
TSPAN17-201ENST00000298564 MIA2Q96PC5 1412 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN17-201ENST00000298564 FBLN2P98095 1184 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN17-201ENST00000298564 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TSPAN17-201ENST00000298564 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TSPAN17-201ENST00000298564 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TSPAN17-201ENST00000298564 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.99■■□□□ 1.59
TSPAN17-201ENST00000298564 KDM6BO15054 1643 aa24.99■■□□□ 1.59
TSPAN17-201ENST00000298564 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.98■■□□□ 1.59
TSPAN17-201ENST00000298564 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms