RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.13■■■■□ 3.53
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.65■■■□□ 2.66
TSPAN17-201ENST00000298564 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPAN17-201ENST00000298564 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
TSPAN17-201ENST00000298564 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.92■■■□□ 2.54
TSPAN17-201ENST00000298564 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
TSPAN17-201ENST00000298564 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPAN17-201ENST00000298564 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.79■■■□□ 2.36
TSPAN17-201ENST00000298564 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.67■■■□□ 2.34
TSPAN17-201ENST00000298564 SCRIBQ14160 1630 aa29.65■■■□□ 2.34
TSPAN17-201ENST00000298564 HRCP23327 699 aa29.64■■■□□ 2.34
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCC9O60706 1549 aa29.58■■■□□ 2.33
TSPAN17-201ENST00000298564 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.58■■■□□ 2.33
TSPAN17-201ENST00000298564 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
TSPAN17-201ENST00000298564 NACADO15069 1562 aa29.35■■■□□ 2.29
TSPAN17-201ENST00000298564 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
TSPAN17-201ENST00000298564 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN17-201ENST00000298564 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.99■■■□□ 2.23
TSPAN17-201ENST00000298564 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.92■■■□□ 2.22
TSPAN17-201ENST00000298564 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.85■■■□□ 2.21
TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM41Q8WV44 630 aa28.7■■■□□ 2.18
TSPAN17-201ENST00000298564 WIZO95785 1651 aa28.68■■■□□ 2.18
TSPAN17-201ENST00000298564 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
TSPAN17-201ENST00000298564 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.46■■■□□ 2.15
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
TSPAN17-201ENST00000298564 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.36■■■□□ 2.13
TSPAN17-201ENST00000298564 SMARCA4P51532 1647 aa28.31■■■□□ 2.12
TSPAN17-201ENST00000298564 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
TSPAN17-201ENST00000298564 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TSPAN17-201ENST00000298564 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
TSPAN17-201ENST00000298564 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPAN17-201ENST00000298564 SMARCA2P51531 1590 aa28.06■■■□□ 2.08
TSPAN17-201ENST00000298564 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCC8Q09428 1581 aa27.95■■■□□ 2.06
TSPAN17-201ENST00000298564 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TSPAN17-201ENST00000298564 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPAN17-201ENST00000298564 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SOGA1O94964 1423 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPAN17-201ENST00000298564 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
TSPAN17-201ENST00000298564 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
TSPAN17-201ENST00000298564 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TSPAN17-201ENST00000298564 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.53■■■□□ 2
TSPAN17-201ENST00000298564 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
TSPAN17-201ENST00000298564 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
TSPAN17-201ENST00000298564 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.5■■□□□ 1.99
TSPAN17-201ENST00000298564 EEA1Q15075 1411 aa27.46■■□□□ 1.99
TSPAN17-201ENST00000298564 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
TSPAN17-201ENST00000298564 NEUROD1Q13562 356 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPAN17-201ENST00000298564 CEP162Q5TB80 1403 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPAN17-201ENST00000298564 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPAN17-201ENST00000298564 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TSPAN17-201ENST00000298564 SYNJ1O43426 1573 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPAN17-201ENST00000298564 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
TSPAN17-201ENST00000298564 GOLGA3Q08378 1498 aa27.26■■□□□ 1.95
TSPAN17-201ENST00000298564 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.21■■□□□ 1.95
TSPAN17-201ENST00000298564 NCAPD3P42695 1498 aa27.18■■□□□ 1.94
TSPAN17-201ENST00000298564 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TSPAN17-201ENST00000298564 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPAN17-201ENST00000298564 HMGXB3Q12766 1538 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF21BO75037 1637 aa27.07■■□□□ 1.92
TSPAN17-201ENST00000298564 TOP2BQ02880 1626 aa27.06■■□□□ 1.92
TSPAN17-201ENST00000298564 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.99■■□□□ 1.91
TSPAN17-201ENST00000298564 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TSPAN17-201ENST00000298564 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPAN17-201ENST00000298564 CLIP1P30622 1438 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPAN17-201ENST00000298564 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TSPAN17-201ENST00000298564 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TSPAN17-201ENST00000298564 CFTRP13569 1480 aa26.89■■□□□ 1.9
TSPAN17-201ENST00000298564 CUX1P39880 1505 aa26.87■■□□□ 1.89
TSPAN17-201ENST00000298564 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.79■■□□□ 1.88
TSPAN17-201ENST00000298564 PRXQ9BXM0 1461 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN17-201ENST00000298564 APLP2Q06481 763 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF27Q86VH2 1401 aa26.7■■□□□ 1.87
TSPAN17-201ENST00000298564 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN17-201ENST00000298564 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TSPAN17-201ENST00000298564 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.62■■□□□ 1.85
TSPAN17-201ENST00000298564 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TSPAN17-201ENST00000298564 PRDM2Q13029 1718 aa26.59■■□□□ 1.85
TSPAN17-201ENST00000298564 MIER1Q8N108 512 aa26.58■■□□□ 1.85
TSPAN17-201ENST00000298564 ARAP1Q96P48 1450 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN17-201ENST00000298564 CUX2O14529 1486 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN17-201ENST00000298564 IGF1RP08069 1367 aa26.45■■□□□ 1.83
TSPAN17-201ENST00000298564 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.44■■□□□ 1.82
TSPAN17-201ENST00000298564 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
TSPAN17-201ENST00000298564 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.39■■□□□ 1.81
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.36■■□□□ 1.81
TSPAN17-201ENST00000298564 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPAN17-201ENST00000298564 NESP48681 1621 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPAN17-201ENST00000298564 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.22■■□□□ 1.79
TSPAN17-201ENST00000298564 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.2■■□□□ 1.78
TSPAN17-201ENST00000298564 MYT1Q01538 1121 aa26.19■■□□□ 1.78
TSPAN17-201ENST00000298564 TOPBP1Q92547 1522 aa26.18■■□□□ 1.78
TSPAN17-201ENST00000298564 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
TSPAN17-201ENST00000298564 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.12■■□□□ 1.77
TSPAN17-201ENST00000298564 P3H3Q8IVL6 736 aa26.09■■□□□ 1.77
TSPAN17-201ENST00000298564 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms